化工儀器網(wǎng)>產(chǎn)品展廳>試劑標(biāo)物>行業(yè)專用試劑>生化與分子生物學(xué)用試劑>Stubby UDI Primer Kit 文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒
Stubby UDI Primer Kit 文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒
- 公司名稱 翌圣生物科技(上海)股份有限公司
- 品牌 Yeasen/翌圣生物
- 型號 Stubby UDI Primer Kit
- 產(chǎn)地 上海
- 廠商性質(zhì) 生產(chǎn)廠家
- 更新時間 2025/2/7 13:40:27
- 訪問次數(shù) 626
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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 12×2 T |
---|---|---|---|
貨號 | 12404ES | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,化工,生物產(chǎn)業(yè) |
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱
產(chǎn)品編號
規(guī)格
價格/元
*/元
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (12 Index)文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒是
12404ES01
12×2 T
515.00
489.00
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (96 Index)文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒是
12405ES01
96×2 T
4135.00
3928.00
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (192 Index)文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒是
12406ES01
192×1 T
8160.00
7743.84
Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (384 Index)文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒是
12407ES01
384×1 T
16320.00
15487.68
產(chǎn)品描述
文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒是Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®是Illumina高通量測序平臺文庫構(gòu)建專用接頭試劑盒,包含二代測序建庫中使用的PE adapter以及12/96/192/384種UDI Primer,。該試劑盒提供的UDI Primer為I5,、I7 Primer預(yù)混液,配合DNA Library Prep Kit for Illumina®使用,,可構(gòu)建多達(dá)384種雙端Index標(biāo)記的文庫,。試劑盒中提供的所有試劑都經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗證,上保證了文庫構(gòu)建的穩(wěn)定性和重復(fù)性,。
產(chǎn)品組分
編號
名稱
規(guī)格
12404ES01
PE Adapter
84 μL
UDI Primer 0001-0012
10 μL each
12405ES01
PE Adapter
2×336 μL
UDI Primer 0001-0096
10 μL each
12406ES01
PE Adapter
2×336 μL
UDI Primer 0001-0192
5 μL each
12407ES01
PE Adapter
4×336 μL
UDI Primer 0001-0384
5 μL each
運輸與保存方法
冰袋運輸,。所有組分-20°C保存,有效期1年,。
注意事項
1)本試劑盒中DNA Adapter的濃度為15 μM,,單個文庫構(gòu)建的接頭使用量根據(jù)所用試劑盒進(jìn)行調(diào)整。
2)本試劑盒提供的PE Adapter為通用型短接頭,,需要通過PCR擴增獲得完整的文庫,。UDI Primer提供Barcode序列標(biāo)簽,用于高通量測序時區(qū)分樣品,。
3)本試劑盒有四種規(guī)格,,分別提供12/96/192/384種UDI Primer,可以構(gòu)建多達(dá)384種雙端Index標(biāo)記文庫,。
4)切勿加熱接頭,,應(yīng)在室溫讓其緩慢溶解,實驗室溫度最好設(shè)置為20-25°C,。接頭避免反復(fù)凍融,,建議分裝保存,可短暫存放于4°C,。
5)使用Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina®試劑盒構(gòu)建的DNA文庫結(jié)構(gòu)如下:
6)為了您的安全和健康,,請穿實驗服并戴一次性手套操作,。
7)本產(chǎn)品僅作科研用途!
使用方法
本試劑盒使用方法按照 Hieff NGS ® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina® 試劑盒操作說明進(jìn)行,。
接頭連接 (Adapter Ligation)
在末端修復(fù)產(chǎn)物兩端連接特定的Illumina®接頭,,即Hieff NGS® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina®操作步驟3.2。
1. 根據(jù)Input DNA量按照下表1選擇合適的Adapter用量,;
表1 不同Input DNA推薦的Adapter使用濃度
Input DNA
Adapter : Input DNA摩爾比
推薦Adapter(15 μM)使用量
400 ng
30:1
3.5 μL
300 ng
40:1
3.5 μL
200 ng
60:1
3.5 μL
100 ng
100:1
3.0 μL
50 ng
100:1
1.5 μL
【注】:Input DNA 摩爾數(shù) (pmol)≈Input DNA質(zhì)量(ng)/[0.66×Input DNA平均長度 (bp)]
2. 將表2中的各種試劑解凍后顛倒混勻,,置于冰上備用;
3. 配制表2所示反應(yīng)體系,;
表2 Adapter Ligation反應(yīng)體系
名稱
體積 (μL)
dA-tailed DNA
60
Ligation Enhancer
30*
Quick T4 DNA Ligase
5
PE Adapter
x**
ddH2O
5-x
【注】:*Ligation Enhancer比較粘稠,,請上下顛倒、振蕩,,充分混勻并瞬時后離心使用,。
**本公司接頭濃度 (Cat#12404;Cat#12405,;Cat#12406,;Cat#12407)與常規(guī)商業(yè)化試劑盒一致,皆為15 μmol/L,。
4. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底;
5. 將PCR管置于PCR儀中,,設(shè)置表3所示反應(yīng)程序,,進(jìn)行接頭連接反應(yīng):
表3 Adapter Ligation反應(yīng)程序
溫度
時間
熱蓋
Off
20°C
15 min
4°C
Hold
【注】:當(dāng)Input DNA量較低,實驗效果不理想時,,可嘗試將連接時間延長一倍,。
連接產(chǎn)物磁珠純化 (Post Ligation Clean Up)
該步驟使用磁珠對連接產(chǎn)物進(jìn)行純化或分選。純化可除去未連接的Adapter或Adapter Dimer等無效產(chǎn)物,,分選可篩選特定長度DNA片段以符合測序需要,,詳細(xì)操作步驟參照Hieff NGS® MaxUp II DNA Library Prep Kit for Illumina®建庫試劑盒說明書。
文庫擴增 (Library Amplification)
該步驟將對純化或長度分選后的接頭連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴增富集,,使用本試劑盒接頭時,,該步驟為必做步驟;
1. 將表4中試劑解凍后顛倒混勻,,置于冰上備用,;
2. 于無菌PCR管中配制表4所示反應(yīng)體系;
表4 PCR擴增反應(yīng)體系
名稱
體積 (μL)
2× Super Canace® II High-Fidelity Mix
25
UDI Primer
5
Adapter Ligated DNA
20
【注】:文庫擴增引物來自Yeasen接頭引物試劑盒 (Cat#12404,;Cat#12405,;Cat#12406;Cat#12407)。
3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底,;
4. 將PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表5所示反應(yīng)程序,,進(jìn)行PCR擴增:
表5 PCR擴增反應(yīng)程序
溫度
時間
循環(huán)數(shù)
98°C
1 min
1
98°C
10 sec根據(jù)實驗需要調(diào)整
60°C
30 sec
72°C
30 sec
72°C
5 min
1
4°C
Hold
-
HB210809