組織細(xì)胞

RNA提取試劑dNTP 混合物Taq DNA聚合酶*鏈cDNA合成試劑盒

離心管離心機(jī)水浴鍋PCR管電泳儀凝膠圖像分析系統(tǒng)移液管移液槍離心管盒

一、總RNA的提取 

見“總RNA的提取”相關(guān)內(nèi)容,。
 

二,、cDNA*鏈的合成 

目前試劑公司有多種cDNA*鏈試劑盒出售，其原理基本相同,，但操作步驟不一?，F(xiàn)以GIBICOL公司提供的SuperScriptTM Preamplification System  for First Strand cDNA Synthesis 試劑盒為例。
 

1． 在0.5 ml微量離心管中,，加入總RNA 1-5 μg,，補(bǔ)充適量的DEPC H₂O使總體積達(dá)11 μl。在管中加10 μM Oligo（dT）12-18 1 μl,，輕輕混勻,、離心；
 

2．70℃加熱10min,，立即將微量離心管插入冰浴中至少1min,；
 

3． 取0.5 ml PCR管，依次加入下列試劑：*鏈cDNA   2 μl,；上游引物（10 pM） 2 μl,；下游引物（10 pM） 2 μl；dNTP(2mM) 4 μl,；10×PCR buffer 5 μl,；Taq 酶（2 u/μl） 1 μl。輕輕混勻,，離心,。42℃孵育2-5 min；

4．加入SuperscriptⅡ1 μl ,，在42℃水浴中孵育50 min,；
 

5． 于70℃加熱15 min以終止反應(yīng)；
 

6．將管插入冰中,，加入RNase H 1 μl ,，37℃孵育20 min，降解殘留的RNA,。-20℃保存?zhèn)溆谩?br /> 

三,、PCR 

1．取0.5 ml PCR管，依次加入下列試劑：*鏈cDNA   2 μl,；上游引物（10 pM）2 μl,；下游引物（10 pM）2 μl；dNTP(2 mM) 4 μl,；10×PCR buffer 5 μl,；Taq 酶（2 u/μl）1 μl,；
 

2．加入適量的ddH₂O，使總體積達(dá)50 μl,。輕輕混勻,，離心；
 

3．設(shè)定PCR程序,。在適當(dāng)?shù)臏囟葏?shù)下擴(kuò)增28-32個循環(huán),。為了保證實驗結(jié)果的可靠與準(zhǔn)確，可在PCR擴(kuò)增目的基因時,，加入一對內(nèi)參（如G3PD）的特異性引物,，同時擴(kuò)增內(nèi)參DNA,，作為對照,；
 

4．電泳鑒定：行瓊脂糖凝膠電泳，紫外燈下觀察結(jié)果,；
 

5．密度掃描,、結(jié)果分析：采用凝膠圖像分析系統(tǒng)，對電泳條帶進(jìn)行密度掃描,。
 

1．在實驗過程中要防止RNA的降解,，保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,，注意避免mRNA的斷裂,；
 

2． 為了防止非特異性擴(kuò)增，必須設(shè)陰性對照,；
 

3．內(nèi)參的設(shè)定：主要為了用于靶RNA的定量,。常用的內(nèi)參有G3PD（甘油醛-3-磷酸脫氫酶）、β-Actin（β-肌動蛋白）等,。其目的在于避免RNA定量誤差,、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差；
 

4． PCR不能進(jìn)入平臺期,，出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長度,、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān),。故對于每一個目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),，均應(yīng)通過單獨實驗來確定；
 

5． 防止DNA的污染： 采用DNA酶處理RNA,； 在可能的情況下,，將PCR引物置于基因的不同外顯子，以消除基因和mRNA的共線性,。

1．反轉(zhuǎn)錄酶的選擇
 

（1） Money 鼠白血病病毒（MMLV）反轉(zhuǎn)錄酶：有強(qiáng)的聚合酶活性,，RNA酶H活性相對較弱,。zui適作用溫度為37℃；
 

（2）禽成髓細(xì)胞瘤病毒（AMV）反轉(zhuǎn)錄酶：有強(qiáng)的聚合酶活性和RNA酶H活性,。zui適作用溫度為42℃,；
 

（3）Thermus thermophilus、Thermus flavus等嗜熱微生物的熱穩(wěn)定性反轉(zhuǎn)錄酶：在Mn²⁺存在下,，允許高溫反轉(zhuǎn)錄RNA,，以