儲存條件:
細(xì)胞裂解液R 4℃放置;溶菌酶(100ug/ul) -20℃保存,;其他試劑室溫保存,。另外,為了去除RNA 中少量殘存的DNA,,客戶可根據(jù)需要購買DNase I,。
產(chǎn)品簡介
本試劑盒可從細(xì)菌細(xì)胞中快速提取總RNA,可同時處理大量不同樣品,。提取的總RNA 純度高,,沒有蛋白和其它雜質(zhì)的污染,可用于RT-PCR,、Real Time RT-PCR,、芯片分析、Northern blot,、Dot blot,、polyA 篩選、體外翻譯,、RNase 保護(hù)分析和分子克隆等多種下游實(shí)驗(yàn),。預(yù)防RNase污染,應(yīng)注意以下幾方面:
1. 經(jīng)常更換新手套,。因?yàn)槠つw經(jīng)常帶有細(xì)菌,,可能導(dǎo)致RNase 污染。
2. 使用無RNase 的塑料制品和槍頭避免交叉污染,。
3. RNA 在細(xì)菌細(xì)胞裂解液中時不會被RNase 降解,。但提取后繼續(xù)處理過程中應(yīng)使用不含RNase 的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4 小時,,塑料器皿可在0.5 M NaOH 中浸泡10 分鐘,,然后用水*清洗,再滅菌,,即可去除RNase,。
4. 配制溶液應(yīng)使用RNase-free ddH2O。(將水加入到干凈的玻璃瓶中,,加入DEPC至終濃度0.1%( v/v),,混勻后放置過夜,高壓滅菌,。)
使用前注意事項(xiàng)
1. 裂解液在儲存時可能會形成沉淀,,如果有沉淀出現(xiàn),,請加熱溶解后使用。
2. *次使用前應(yīng)在漂洗液RW 中加入無水乙醇,,加入量請參見瓶上標(biāo)簽,。
操作步驟
柱平衡步驟:向吸附柱中(吸附柱放入收集管中)加入500μl 平衡液,12,000 rpm(~13,400×g )離心1 分鐘,,倒掉收集管中的廢液,,將吸附柱重新放回收集管中備用(請使用當(dāng)天處理過的柱子)。
1. 4℃12,000 rpm(~13,400×g)離心2 分鐘收集菌體(收集菌體的zui大量不超過1×109),,仔細(xì)去除所有培養(yǎng)基上清,。
注:如果培養(yǎng)基上清去除不*,將對第二步中的細(xì)胞壁消化過程產(chǎn)生抑制,。
2. 用含有溶菌酶的100 ul 細(xì)胞懸浮液(客戶自己配制,,配制方法見下表)*重懸菌體,孵育時間如下,。
細(xì)胞懸浮液中的溶菌酶終濃度 孵育時間(室溫)
G-細(xì)菌 400 ug/ ml 3-5 min
G+細(xì)菌 3 mg/ ml 5-10 min
3. 加入1ml 裂解液R,,渦旋振蕩混勻,若出現(xiàn)不溶性沉淀,,12000 rpm(~13,400×g)離心2 分鐘,,將上清轉(zhuǎn)移至另一離心管中。
4. 每1ml 裂解液R加0.2ml氯仿,。蓋緊樣品管蓋,,劇烈振蕩15秒并將其在室溫下孵育3分鐘。
5. 于4℃ 12,,000rpm 離心10分鐘,,樣品會分成三層:下層有機(jī)相,中間層和上層無色的水相,,RNA存在于水相中,。水相層的容量大約為所加R體積的60%,把水相轉(zhuǎn)移到吸附柱中(吸附柱套在收集管內(nèi)),。
6. 12,,000rpm 離心45秒,棄掉廢液,,將吸附柱重新套回收集管。
7. 加入500μl漂洗液RW(請先檢查是否已加入無水乙醇!),,12,000 rpm 離心45秒,,棄掉廢液。
8. 加入500μl漂洗液RW,,12,000 rpm 離心45秒,,棄掉廢液,。
9. 將吸附柱放回空收集管中,13,000 rpm離心2分鐘,,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng),。
10. 取出吸附柱,放入一個新的RNase free離心管中,,根據(jù)預(yù)期RNA產(chǎn)量在吸附膜的中間部位加60-100μl RNase free water,, 室溫放置2分鐘, 12,000 rpm 離心1分鐘,。得到RNA溶液,。
(洗脫體積越大,洗脫效率越高,,如果需要RNA濃度較高,,可以適當(dāng)減少洗脫體積, 但是zui小體積不少于50μl,,體積過小降低RNA洗脫效率,,減少RNA產(chǎn)量。)
RNA純度及濃度檢測
完整性: RNA 可用普通瓊脂糖凝膠電泳 (電泳條件:膠濃度1.2%,;0.5×TBE 電泳緩沖液,;150v,15 分鐘)檢測完整性,。由于細(xì)胞中70%-80%的RNA 為rRNA,,電泳后UV 下應(yīng)能看到非常明顯的rRNA 條帶。28S rRNA 的量約為18S rRNA 的兩倍,,說明RNA 的完整性較好,。
純度:OD260/OD280 比值是衡量蛋白質(zhì)污染程度的指標(biāo)。高質(zhì)量的RNA,,OD260/OD280 讀數(shù)在1.8-2.1 之間,,比值為2.0 是高質(zhì)量RNA 的標(biāo)志。OD260/OD280 讀數(shù)受測定所用溶液的pH 值影響,。同一個RNA 樣品,,假定在10mM Tris,pH7.5 溶液中測出的OD260/OD280 讀數(shù)1.8-2.1 之間,,在水溶液中所測讀數(shù)則可能在1.5-1.9 之間,,但這并不表示RNA 不純。
濃度:取一定量的 RNA 提取物,,用RNase-free ddH2O稀釋n 倍,,用RNase-freeddH2O 將分光光度計(jì)調(diào)零,取稀釋液進(jìn)行OD260, OD280 測定,按照以下公式進(jìn)行RNA濃度的計(jì)算:
終濃度(ng/μl)= (OD260)×(稀釋倍數(shù)n)×40
DNase I儲存液的配制
將DNase I 干粉(1500 U)溶解在550 μl RNase-free ddH2O 中,,輕柔混勻,,分裝后-20℃貯存(可保存9 個月)。
DNA reaction buffer:
100mM Tris-HCl( pH 7.5 )
25mM MgCl2
5 mM CaCl2
注意:從-20℃融化后的DNase I 儲存液保存于4℃(可保存6 周),,不要再次凍存,。
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