測序試劑盒的捕獲步驟通常指的是在基因組測序過程中,,如何從樣本中選擇和富集特定的目標區(qū)域,。捕獲步驟通常與目標區(qū)域捕獲(TargetedCapture)技術相結合,主要用于高通量測序(NGS)中,,通過選擇性地捕獲特定DNA片段以提高分析的靈敏度和準確性。下面是捕獲步驟的概述:
1.樣本準備
首先,,需要從樣本中提取DNA,。樣本可以是血液、組織,、唾液等,,提取過程會根據不同的樣本類型選擇不同的提取方法,。提取后的DNA會被質控,以確保其質量和完整性滿足后續(xù)實驗的要求,。
2.DNA片段化
為了便于后續(xù)的捕獲和測序,,提取到的DNA需要經過片段化。這一步驟通過物理(例如超聲波破碎)或酶切(如限制性內切酶)的方法將DNA分解成適合捕獲的小片段,。
3.目標區(qū)域設計與探針合成
根據研究的需要,,選擇目標區(qū)域(例如特定基因、外顯子或其他感興趣的序列),。然后,,合成與這些目標序列互補的探針。探針通常是固定在微珠或其他固相支持物上的寡核苷酸序列,。這些探針可以與樣本中的目標DNA序列特異性結合,。
4.目標區(qū)域富集(捕獲)
在這一步,添加合成的探針與片段化的DNA進行雜交,。探針與目標區(qū)域序列結合后,,未結合的非目標DNA序列會被洗脫掉。這個過程可以通過反應體系中的條件控制,,使目標DNA區(qū)域與探針特異性結合,。
5.洗脫
捕獲了目標序列后,使用洗滌步驟去除非特異性結合的雜散DNA,。通過一定的鹽濃度和溫度控制,,確保只有目標DNA區(qū)域被保留下來,而其他無關序列被去除,。
6.擴增(可選)
有時,,為了提高捕獲序列的量,捕獲后的DNA片段會進行PCR擴增,。這一步是為了增加目標區(qū)域的信號強度,,以確保后續(xù)測序的靈敏度。
7.文庫構建
捕獲后的目標區(qū)域DNA可以直接用于文庫構建,。文庫構建過程中,,DNA片段的兩端會連接適配器,以便后續(xù)的測序平臺進行識別和擴增,。
8.測序
文庫構建完成后,,將其加載到高通量測序平臺(如Illumina、BGISEQ等)進行測序,,獲取高質量的序列數據,。
總結
捕獲步驟的關鍵在于目標區(qū)域的選擇、探針設計以及洗脫過程,,通過精確的操作,,可以確保只富集出感興趣的區(qū)域,,從而提高測序的效率和準確性。
相關產品
免責聲明
- 凡本網注明“來源:化工儀器網”的所有作品,,均為浙江興旺寶明通網絡有限公司-化工儀器網合法擁有版權或有權使用的作品,未經本網授權不得轉載,、摘編或利用其它方式使用上述作品,。已經本網授權使用作品的,應在授權范圍內使用,,并注明“來源:化工儀器網”,。違反上述聲明者,本網將追究其相關法律責任,。
- 本網轉載并注明自其他來源(非化工儀器網)的作品,,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網贊同其觀點和對其真實性負責,,不承擔此類作品侵權行為的直接責任及連帶責任,。其他媒體、網站或個人從本網轉載時,,必須保留本網注明的作品第一來源,,并自負版權等法律責任。
- 如涉及作品內容,、版權等問題,,請在作品發(fā)表之日起一周內與本網聯系,否則視為放棄相關權利,。