邊緣效應(yīng)(Edge Effect)是指在利用96孔(或更多)培養(yǎng)板進行細胞培養(yǎng)時,,處在周邊及四個角孔中的細胞通常會表現(xiàn)出異常的現(xiàn)象,。
產(chǎn)生邊緣效應(yīng)的原因
1. 溫度:聚苯乙烯本身為不良熱導(dǎo)體,,將板從室溫(25℃左右)置于37℃的溫箱,,隨著孔板升溫,,在外周孔與中心孔之間可能存在熱力學梯度,。
2. 蒸發(fā):在培養(yǎng)箱經(jīng)常開關(guān)的情況下,,由于位置效應(yīng),,邊緣孔的濕度較中間孔更低,,水分揮發(fā)的現(xiàn)象就更為嚴重。容易造成四周培養(yǎng)基的體積會明顯少于中間孔,,而四個角落則更甚,。對于長時間周期的研究來說,這是一個不容忽視的問題——隨著培養(yǎng)基的蒸發(fā),孔內(nèi)的培養(yǎng)基成分和藥物濃度將增加,,這可能導(dǎo)致孔內(nèi)沉淀的出現(xiàn),。孔與孔之間的營養(yǎng)物濃度,、pH值也會影響基因和蛋白質(zhì)的表達,,以及最終的細胞生長發(fā)生變化。隨之而來的Western,、PCR/qPCR,、ELISA和其他應(yīng)用也就越不一致。
不推薦的應(yīng)對辦法
1. 留空:許多研究人員會通過避免使用邊緣孔來提高數(shù)據(jù)可重復(fù)性,,比如使用96孔板,,外圍的36個孔將被棄用(板的37.5%被浪費)。因此,,實驗組須分布在多塊培養(yǎng)板上以達到足夠的通量,,增加了工作量和成本,同時也降低了實驗中培養(yǎng)板布局的靈活性,。
2. 填充:PBS溶液,、水或培養(yǎng)基填充外孔將有助于板的水合,限制蒸發(fā),,但這可能會成為細菌的滋生地,。
3. 平鋪:當堆疊起來的時候,處于頂部和底部的孔板將比中間的更快達到37℃,,造成溫度梯度,。但大多數(shù)培養(yǎng)箱被不止一個研究人員使用且空間有限,如果其他人選擇堆放,,仍然會阻礙空氣流向你的樣品,,影響溫度。
防止邊緣效應(yīng)的建議
1. 盡量縮短試驗周期,,從而減少液體在孔中儲存的時間,,減少蒸發(fā)。
2. 使用低蒸發(fā)蓋帶冷凝環(huán)的蓋子,。
3. 使用透明或鋁箔密封膠帶進行生化測定,,或使用透氣的無菌膠帶進行細胞測定。
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