關(guān)鍵詞:454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務(wù)|實(shí)驗技術(shù)服務(wù)
簡介:世界*品牌454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務(wù)|實(shí)驗技術(shù)服務(wù)原裝,,質(zhì)量保證,*,。
454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務(wù)|實(shí)驗技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達(dá)體系,。
我們具備豐富的蛋白表達(dá)設(shè)計經(jīng)驗及實(shí)驗操作技巧,,承諾客戶不成功不收費(fèi),。在獲得重組蛋白產(chǎn)品的同時,,我們也會提供相應(yīng)的原始數(shù)據(jù)和原始圖片,不需要再額外花費(fèi)精力重復(fù)實(shí)驗。另一方面,,我們所有的實(shí)驗數(shù)據(jù)真實(shí)可信,,我們提供原始的表達(dá)菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實(shí)驗報告重復(fù)我們的實(shí)驗結(jié)果。
產(chǎn)品品牌:454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務(wù)|實(shí)驗技術(shù)服務(wù) http://www.,。,。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
實(shí)驗描述
測序?qū)嶒灹鞒蹋?br>1、文庫制備:根據(jù)樣品的種類和實(shí)驗?zāi)康?,將基因組DNA/cDNA段化處理至400-800bp間,,經(jīng)末端修復(fù)與特異性接頭連接等修飾后變性處理回收單鏈的DNA(sstDNA);
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
2,、Emulsion PCR:特定比例的單鏈DNA文庫被固定在特別設(shè)計的DNA捕獲磁珠上,,使大部分磁珠磁珠攜帶了一個*的單鏈DNA斷,。磁珠結(jié)合的文庫被擴(kuò)增試劑乳化,,形成油包水的混合物,每個*的片斷在自己的微反應(yīng)器里進(jìn)行獨(dú)立的擴(kuò)增,,而不受其他的競爭性或者污染性序列的影響,。整個片段文庫的擴(kuò)增平行進(jìn)行。擴(kuò)增后產(chǎn)生了幾百萬個相同的拷貝,。隨后,,乳液混合物被打破,擴(kuò)增后仍結(jié)合在磁珠上的段既可被回收純化用于后續(xù)的測序?qū)嶒灒?br>Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
3,、測序反應(yīng):攜帶DNA的珠子與其他反應(yīng)物混合物,,隨后放入PTP板中進(jìn)行后繼的測序。PTP孔的直徑(29um)只能容納一個珠子(20um),。然后將PTP板放置在GS FLX中,,測序開始。每一個與模板鏈互補(bǔ)的核苷酸的添加都會產(chǎn)生化學(xué)發(fā)光的信號,,并被CCD照相機(jī)所捕獲,;
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
4、數(shù)據(jù)分析:GS FLX系統(tǒng)在10小時的運(yùn)行當(dāng)中可獲得100多萬個讀長,,讀取超過4-6億個堿基信息,,通過GS FLX系統(tǒng)提供兩種不同的生物信息學(xué)工具對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。
技術(shù)特點(diǎn):
? 速度快,,一個測序反應(yīng)耗時10個小時,,獲得4-6億(400-600M)個堿基對。比傳統(tǒng)的Sanger測序的方法快100倍,;
? 讀長長,,單個序列的讀長更長,平均可達(dá)到450個堿基左右,;
? 通量高,,每個反應(yīng)可以得到超過100萬個序列讀長,成本大大降低;
? 準(zhǔn)確度高,,讀長超過400bp時,,單一讀長的準(zhǔn)確性可以超過99%;
? 一致性好,,測序結(jié)果一致性超過99.99%,;
? 可以進(jìn)行Pair-End測序研究;
? 簡便,,不需要進(jìn)行建庫,、克隆挑取、質(zhì)粒提取等工作,,一個人可以在一天內(nèi)完成一個微生物物種的測序工作,。
GS FLX系統(tǒng)的應(yīng)用
全基因組測序
多達(dá)120 Mb的未知基因組的測序
-生成基因組結(jié)構(gòu)概圖
-研究DNA序列的組織,分布和信息
-基因篩查:尋找新基因,,定位和功能
-和其他基因組進(jìn)行比較研究
全基因組進(jìn)行測序,,例如微生物基因,BAC和YAC克隆測序,。
比較基因組研究
-識別單堿基突變
-識別突變熱點(diǎn)和保守區(qū)域
-識別插入或者缺失的基因
-斷定基因型和表型之間的相關(guān)關(guān)系(比如,,研究藥物抗性的遺傳基礎(chǔ))
- 基于基因測序變化進(jìn)行毒性預(yù)測
-進(jìn)行流行病學(xué)分析
-了解工業(yè)生產(chǎn)菌株和它們的親代菌株序列上的差異作為進(jìn)行工業(yè)生產(chǎn)菌株開發(fā)的遺傳基礎(chǔ)
-進(jìn)行宏基因組 (metagenomics)研究
-古代化石DNA 測序研究
利用配對末端方法(Pair-End Tag)將Contigs拼接成Scaffolds。
轉(zhuǎn)錄組和基因調(diào)節(jié)研究
基于短Tags,,ESTs, ChIP,,或者GIS-PET序列的高通量轉(zhuǎn)錄組分析,或者miRNA 序列的基因組范圍識別,,小分子和非編碼RNA的測序,。
研究DNA的甲基化模式來進(jìn)行基因調(diào)節(jié)的研究。
擴(kuò)增產(chǎn)物分析
PCR產(chǎn)物的超精細(xì)測序(應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究的重測序)
-在混合的腫瘤樣本中識別體細(xì)胞突變
-在群體水平上發(fā)現(xiàn)高可信度的SNP位點(diǎn)