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賽默飛色譜及質(zhì)譜

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文獻(xiàn)分享:iCIEF-HRMS在線直連技術(shù)用于蛋白質(zhì)藥物電荷異質(zhì)性分析

閱讀:1216      發(fā)布時(shí)間:2023-2-14
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原創(chuàng) 飛飛 賽默飛色譜與質(zhì)譜中國(guó)

關(guān)注我們,,更多干貨驚喜好禮

 

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張曉夕

 

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在整個(gè)制藥行業(yè)中,,重組單克隆抗體 (mAb) 為生物治療產(chǎn)品在銷售額和臨床份額的快速增長(zhǎng)起到了重要作用。最近,,因?yàn)楠?dú)特的治療效果,,復(fù)雜的蛋白質(zhì)包括抗體-藥物偶聯(lián)物 (ADC)、雙特異性抗體和融合蛋白等重新獲得了科學(xué)家們的特別關(guān)注,。在蛋白質(zhì)藥物的關(guān)鍵質(zhì)量屬性(critical quality attribute, CQA)評(píng)估過(guò)程中,,電荷異質(zhì)性需要對(duì)蛋白分子進(jìn)行深入的結(jié)構(gòu)表征,以確保其安全性,、有效性和效力,。

此外,對(duì)電荷變異體的監(jiān)測(cè)也是蛋白質(zhì)藥物質(zhì)量控制(QC)中必要的步驟,。目前,,主要有兩種檢測(cè)蛋白質(zhì)藥物電荷變異體的方法:離子交換(IEX) 色譜和成像毛細(xì)管等電聚焦(iCIEF) CIEF,,兩者傳統(tǒng)上都使用 紫外(UV) 作為檢測(cè)器。UV檢測(cè)雖然具有良好的穩(wěn)定性和靈敏度,,但受限于其定性能力,,無(wú)法對(duì)分離后的電荷變異體進(jìn)行更深入的鑒定。為了分析電荷異構(gòu)體的成因,,必須進(jìn)行準(zhǔn)確的定性分析,。高分辨率質(zhì)譜(HRMS)是定性蛋白質(zhì)分析的有力手段之一。然而,,由于所用溶液體系的限制,,傳統(tǒng)上IEX iCIEF 不能直接與質(zhì)譜連接。鑒于iCIEF在蛋白質(zhì)電荷變異體分析中具有分辨率高,、通量高等優(yōu)點(diǎn),,已經(jīng)逐漸成為生物制藥行業(yè)生產(chǎn)與質(zhì)量控制階段的金標(biāo)準(zhǔn)。因此,,科學(xué)家們也在嘗試各種將iCIEF與高分辨質(zhì)譜直接連接的技術(shù),。其中一種方法是基于芯片的直連技術(shù),然而該方法是使用化學(xué)試劑形成pH梯度,,穩(wěn)定性有所欠缺,,且分辨率會(huì)下降;其他的直連方法在通量,、穩(wěn)定性以及與質(zhì)譜離子源連接的便利性等方面均有不足,。

本文中所使用的CEInfinite (Advanced Electrophoresis Solution Ltd., AES) iCIEF平臺(tái),與該公司的專利卡柱和兩性電解質(zhì)配合使用,,對(duì)mAb,、ADC等分子的電荷變異體均可實(shí)現(xiàn)高分辨率分離,且兼具良好的穩(wěn)定性,。更為重要的是,,所用溶液體系中無(wú)甲基纖維素、尿素等,,兩性電解質(zhì)也與質(zhì)譜兼容,,這使得iCIEF與高分辨質(zhì)譜在線直連測(cè)量電荷變異體完整蛋白分子量成為可能。該平臺(tái)與質(zhì)譜離子源部分連接簡(jiǎn)單,,無(wú)需額外接口(圖1),,不同工作模式切換簡(jiǎn)便。

 

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1. CEInfinite iCIEF平臺(tái)質(zhì)譜直連模式工作原理圖

(點(diǎn)擊查看大圖)

 

 

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在本文中,,我們對(duì)NIST mAbNIST8671),、bevacizumabpembrolizumab,以及T-DM1這一賴氨酸偶聯(lián)的ADC藥物進(jìn)行了iCIEF-HRMS在線直連分析。根據(jù)每個(gè)分子及其電荷變異體的pI分布,,我們選擇了不同范圍的兩性電解質(zhì)(表1),,目的在于實(shí)現(xiàn)不同電荷變異體之間更好的分離。

1. 樣品配制

 

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對(duì)于每個(gè)分子,,我們也根據(jù)其不同性質(zhì)優(yōu)化了iCIEF實(shí)驗(yàn)條件,詳見(jiàn)表2,。

2. iCIEF分離條件

 

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實(shí)驗(yàn)條件的優(yōu)化

由于每個(gè)蛋白及其電荷變異體的等電點(diǎn)(pI)分布范圍存在差異,,為了在直連質(zhì)譜時(shí)得到最好的分離效果,需要進(jìn)一步優(yōu)化iCIEF分離條件,。優(yōu)化時(shí),,先用pH范圍較寬的兩性電解質(zhì)分析目標(biāo)蛋白得到初步結(jié)果,然后再根據(jù)初步結(jié)果中每個(gè)組分不同的pI分布范圍,,選用相應(yīng)的窄pH范圍兩性電解質(zhì)(優(yōu)化過(guò)程數(shù)據(jù)未展示),。

 

iCIEF的聚焦過(guò)程中,蛋白會(huì)在電場(chǎng)形成的pH梯度中遷移,,直至到達(dá)pH=pI的位置,,遷移停止。由于蛋白在pI處停止后易沉淀,,通常會(huì)加入一定濃度的尿素助溶,。然而尿素與質(zhì)譜不兼容,為了解決這個(gè)問(wèn)題,,我們的實(shí)驗(yàn)中換用甲酰胺代替尿素,,在助溶的同時(shí),也與質(zhì)譜兼容,;對(duì)于每個(gè)樣品,,甲酰胺的濃度同樣也進(jìn)行了優(yōu)化(數(shù)據(jù)未展示),對(duì)于大部分樣品,,10%(v/v)甲酰胺是最適合的條件,。

 

iCIEF-MS直連模式中,需要兩路輔助溶劑,。一路被稱為mobilization solution(蛋白從卡柱上被推出的溶液,,由iCIEF系統(tǒng)配備的蠕動(dòng)泵完成),該溶液通常為10mM醋酸溶液或0.1-0.5%甲酸水溶液,;另一路為make-up solution(HPLC的泵模塊提供,,在柱后與mobilization混合) ,通常使用0.1%甲酸,,水:乙腈=11的溶液,。

因?yàn)檫@兩路溶液的流速會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成影響,我們同樣對(duì)這兩個(gè)流速分別進(jìn)行了優(yōu)化,mobilization solution流速優(yōu)化范圍30-100nL/min, make-up solution流速優(yōu)化范圍1-10μL/min,,發(fā)現(xiàn)mobilization solution流速在40-50nL/min之間iCIEF分辨率最好,,50-100nL/min分辨率會(huì)下降;mobilizaiton solution= 5μL/min,,質(zhì)譜靈敏度最好,。

 

iCIEF-MS直連模式的重復(fù)性

在本實(shí)驗(yàn)中,NIST mAb被用于系統(tǒng)穩(wěn)定性測(cè)試,。如圖2所示,,圖2ANISTmAb三針平行進(jìn)樣結(jié)果,可見(jiàn)質(zhì)譜總離子流圖(total ion current, TIC chromatogram)和主峰解卷積結(jié)果均具有良好的重現(xiàn)性,;圖2B對(duì)NIST mAbTICiCIEF-UV譜圖進(jìn)行了對(duì)比,,可見(jiàn)iCIEF分離出的五個(gè)電荷異質(zhì)體峰均可與TIC中的峰一一對(duì)應(yīng)。需要注意的是,,由于系統(tǒng)直連的模式,,iCIEF分離后的峰是按照pI由大到小的順序依次被引入質(zhì)譜離子源的,故TIC圖上最先被檢測(cè)到的是pI值最大的堿峰,,TICiCIEF-UV譜圖中峰的分布呈鏡像關(guān)系,。

 

Picture24.jpg

 

(A)

 

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(B)

2.iCIEF-MS系統(tǒng)穩(wěn)定性測(cè)試。

 (A),,NIST mAb三針平行進(jìn)樣,。

(B)NIST mAb 質(zhì)譜總離子流圖(TIC)iCIEF-UV譜圖對(duì)比,。

(點(diǎn)擊查看大圖)

 

iCIEF-MS分析bevacizumab

3展示了iCIEF-MS分析bevacizumab的結(jié)果,。從圖3AiCIEF-UV譜圖中可以看出,總共有六個(gè)電荷變異體的峰被分離并鑒定到,,包括三個(gè)酸峰(A1-A3),,兩個(gè)堿峰(B1-B2)和主峰(M),均可在TIC-MS譜圖中找到對(duì)應(yīng)的峰,。圖3B為使用Thermo Fisher Biopharma Finder 5.0 (BPF 5.0)軟件對(duì)各個(gè)電荷變異體進(jìn)行解卷積之后的結(jié)果,,可見(jiàn)在兩個(gè)堿峰中,主要的電荷變異體分別為重鏈末端保留一個(gè)賴氨酸(B1)和兩個(gè)賴氨酸均被保留(B2)的形式,;在酸峰中,,主要觀察到的電荷變異體為糖化(+162Da)

3列出了iCIEF-MS鑒定到的bevacizumab電荷變異體,。對(duì)于酸峰中常見(jiàn)的脫酰胺化修飾,,由于其修飾后分子量?jī)H增加0.984Da,,通常需要在肽圖層面上進(jìn)一步確認(rèn),。

 

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(A)

 

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(B)

3. iCIEF-MS分析bevacizumab

(A), TIC-MSiCIEF-MS譜圖對(duì)比,。

(B), 經(jīng)iCIEF分離后的bevacizumab電荷變異體質(zhì)譜數(shù)據(jù)解卷積結(jié)果。

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3. iCIEF-MS鑒定到的bevacizumab電荷變異體

 

Picture28.png

 

 

iCIEF-MS分析pembrolizumab

下圖4及圖5展示了我們使用iCIEF-MS直連技術(shù)分析pembrolizumab電荷變異體的結(jié)果,,可見(jiàn)即使是pI僅差0.02的堿峰B1和主峰,,也可以在iCIEF上得到基線分離(4A),隨后的高分辨質(zhì)譜分子量測(cè)定結(jié)果顯示該堿峰與主峰相比,,主要差異是其中一條重鏈的N端未發(fā)生焦谷氨酸環(huán)化(圖5B-C),。另外觀察原始質(zhì)譜譜圖不難發(fā)現(xiàn),得益于Orbitrap高分辨質(zhì)譜的靈敏度,,即使是強(qiáng)度比主峰低2~3個(gè)數(shù)量級(jí)的堿峰B3,,仍可得到糖型分布清晰的譜圖,并可通過(guò)解卷積觀察到該峰中各個(gè)組分的分子量,,例如重鏈末端丟失GK(-185Da)的電荷變異體也在堿峰B3中被鑒定到(圖5D)。表4展示了iCIEF-MS直連測(cè)得的每個(gè)峰中主要的電荷變異體種類,。

 

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(A)                                  (B)

4. (A), pembrolizumab iCIEF- UV 分離譜圖,。(B), pembrolizumab各個(gè)電荷變異體百分含量,上樣量為柱上1.6μg,。A1-A4, 酸峰; Main, 主峰; B1-B3, 堿峰,。

(點(diǎn)擊查看大圖)

 

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5. iCIEF-MS分析pembrolizumab電荷變異體質(zhì)譜圖及解卷積譜圖。

(A),,主峰與所有堿峰原始質(zhì)譜圖對(duì)比,。

(B),堿峰B1(pI=7.59)與主峰(pI=7.57)解卷積結(jié)果鏡像圖對(duì)比,。

(C),,基于肽圖得到的主峰和堿峰B1重鏈N端焦谷氨酸環(huán)化比率。

(D),,堿峰B3解卷積結(jié)果,。

(點(diǎn)擊查看大圖)

4 iCIEF-MS在線直聯(lián)鑒定pembrolizumab電荷變異體。HC,,重鏈,。

 

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iCIEF-MS分析ADC

ADC是一類經(jīng)過(guò)細(xì)胞工程設(shè)計(jì),將小分子藥物通過(guò)linker分子偶聯(lián)至mAb分子特定氨基酸位點(diǎn)上,,通過(guò)mAb對(duì)細(xì)胞表面的靶點(diǎn)精確識(shí)別后,,將小分子藥物定向?qū)氚┘?xì)胞中,以實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)殺滅癌細(xì)胞,,減少對(duì)正常細(xì)胞殺傷的一類蛋白質(zhì)藥物,。由于小分子藥物的偶聯(lián)增加了產(chǎn)品的復(fù)雜性,故在質(zhì)譜分析之前,,通過(guò)各種分離技術(shù)對(duì)偶聯(lián)了不同數(shù)目小分子藥物的ADC進(jìn)行預(yù)分離,,可大大降低質(zhì)譜數(shù)據(jù)的復(fù)雜度和解析難度。圖6展示了iCIEF-UV分析ADC的譜圖,可見(jiàn)由于偶聯(lián)小分子藥物的數(shù)目不同,,ADC的電荷異質(zhì)性也不同,,可以在iCIEF層面上得到分離。圖7展示了iCIEF-MS分析ADC的質(zhì)譜譜圖及解卷積結(jié)果,,可見(jiàn)iCIEF將對(duì)偶聯(lián)了不同數(shù)目小分子藥物的ADC根據(jù)其電荷異質(zhì)性進(jìn)行分離后,,能夠減少質(zhì)譜譜圖中相鄰信號(hào)之間的干擾,從而降低質(zhì)譜譜圖的復(fù)雜度,,使質(zhì)譜譜圖的解析更精確和便利,。

 

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6. iCIEF-UV 分析T-DM1譜圖,上樣量1.6μg,。D0-D10, 小分子藥物偶聯(lián)數(shù)目,。

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7. iCIEF-MS分析T-DM1質(zhì)譜譜圖及解卷積結(jié)果(分離后未偶聯(lián)小分子藥物的組分,D0),。iCIEF分離大大降低了譜圖復(fù)雜度,。

(點(diǎn)擊查看大圖)

 

基于iCIEF分離的

蛋白電荷變異體離線餾分收集

 iCIEF-MS可以從完整蛋白層面上提供蛋白電荷變異體的分子量信息,如需更多修飾位點(diǎn)層面的信息,,可以對(duì)iCIEF分離的蛋白電荷變異體離線餾分收集后進(jìn)行酶解,,隨后使用HPLC-MSMS進(jìn)行肽圖表征。圖8展示了pembrolizumab蛋白電荷變異體離線餾分收集的iCIEF-UV譜圖,,更多詳細(xì)信息可參考已發(fā)表文獻(xiàn)[1],。

 

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(A)

 

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(B)

8. Pembrolizumab 電荷變異體離線餾分收集及確認(rèn)。

(A) 離線餾分收集,。iCIEF-UV10針平行進(jìn)樣的重疊,,插入表格為每個(gè)峰以峰面積計(jì)算的相對(duì)含量和10針平行進(jìn)樣的CV

 (B) 峰純度確認(rèn),,每個(gè)峰均為5針平行進(jìn)樣,,同一個(gè)pI收集峰的混合。

(點(diǎn)擊查看大圖)

 

 

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在生物醫(yī)藥行業(yè)中,,快速且準(zhǔn)確的電荷變異體分析是關(guān)鍵需求之一,。本文中使用的iCIEF在線直連高分辨質(zhì)譜工作流程,能夠克服CE-MS在靈敏度,、重現(xiàn)性等方面的不足,,特別是我們使用的CEInfinite平臺(tái)可以靈活的在不同工作流程之間轉(zhuǎn)換,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)電荷變異體表征中的一站整合式” iCIEF分析,。

 

Picture38.png

 

 

原文參考

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參考文獻(xiàn)

[1] X. Zhang, T. Chen, V. Li, T. Bo, M. Du, T. Huang, Cutting-edge mass spectrometry strategy based on imaged capillary isoelectric focusing (iCIEF) technology for characterizing charge heterogeneity of monoclonal antibody, Analytical Biochemistry 660 (2023) 114961.

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