目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學(xué)試劑>>試劑盒>> T3體外轉(zhuǎn)錄及加帽試劑盒
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 5次 |
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貨號 | XY-D-1689 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | T3 invitroTranscription and Capping Kit |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 12個月 |
產(chǎn)品簡介:
本試劑盒是基于沙門氏噬菌體T3 RNA 聚合酶的RNA 體外轉(zhuǎn)錄及加帽試劑盒,它利用含有 T3 啟動子的模版 DNA,,以 NTP 和 m7G(5' )ppp(5' )G 為底物從 T3 啟動子下游開始合成與模板 DNA 中一條鏈互補(bǔ)的 RNA,,簡單快速獲得大量的 RNA 分子(含帶帽 RNA)。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1.即開即用,,用戶只需提供含 T3 啟動子的 DNA 模板即可以進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),,不需單獨(dú)準(zhǔn)備每一個成份。
2.體外轉(zhuǎn)錄和加帽同管一步式進(jìn)行,,不需要先體外轉(zhuǎn)錄再加帽,。
3.單溶液預(yù)配液,減少加樣次數(shù),,避免了操作誤差,,增加了可重復(fù)性。
4.模板 DNA 可以是線性化的質(zhì)粒 DNA,,也可以是 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,。
5.可以合成的 RNA 的最佳長度在 20nt 到 5000nt 之問。
6.產(chǎn)品配方經(jīng)過精心優(yōu)化,,每μg DNA 模板可以合成 2-6μg RNA,。
7.得到的加帽 RNA 比不加帽的 RNA 更穩(wěn)定,可以用于 RNA 結(jié)構(gòu)研究,、核解生物化學(xué),、體外翻譯、RNA-蛋白質(zhì)相互作用,、反義技術(shù),、SELEX 技術(shù)和 RNA 干擾(RNAi)等實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品參數(shù):
成份規(guī)格包裝
2×T3 體外轉(zhuǎn)錄及加帽預(yù)配液50μL0.1mL 本蓋管
T3 RNA 聚合酶-RI 混合液5μL10μL 紅蓋管
RNase-free 水1mL1mL 藍(lán)蓋管
使用手冊1 份無
保存和運(yùn)輸
T3體外轉(zhuǎn)錄及加帽試劑盒低溫運(yùn)輸,,-20℃保存,,有效期一年。
自備試劑
如果需要去除轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中的 DNA 模板,,則需要 RNase-free DNase,、Tris 飽和
酚、氯仿,、微量核酸沉淀劑,、RNase-free 75%乙醇。
使用方法:
一,、制備 DNA 模板
PCR 片段和質(zhì)粒 DNA 都可以用作體外轉(zhuǎn)錄的模板,,但是必須注意以下幾點(diǎn)。一是必須使用線性化的 DNA,。如果是質(zhì)粒 DNA,,則必須先用適當(dāng)?shù)南拗菩詢?nèi)切酶切成線狀。二是需要轉(zhuǎn)錄的 DNA 序列的上游必須有 T3 啟動子,。如果模板是 PCR 產(chǎn)物,, 則可以在設(shè)計引物時將 T3 啟動子序列
(5’AATTAACCCTCACTAAAGG 3’)加上。如果是將 DNA 片段克隆
到載體上,,則需要選擇有 T3 啟動子的載體,,并且克隆位點(diǎn)必須位于 T3 啟動子下游。三是需要轉(zhuǎn)錄的 DNA 序列的下游端最好不要是 3’突出,。如果
是 3’突出(如選擇了 Pst I 來線性化質(zhì)粒),,則最好用 T4 DNA 聚合酶修平,。四是必須保證 DNA 模板中沒有 RNase。由于提取質(zhì)粒 DNA 的過程中一般要使用大量的 RNase A,,因此質(zhì)粒 DNA 一般都有嚴(yán)重的 RNase A 污染,,所以在用作模板前,最好采取膠回收得方法回收質(zhì)粒 DNA,。并且加入少量總 RNA 一起保溫,,然后電泳檢測 RNA 是否被降解,以此判斷純化的DNA 模板是否有殘留 RNase A,。
二,、體外轉(zhuǎn)錄及加帽反應(yīng)
1.如果有 N 個樣品,強(qiáng)烈建議做一個陰性對照,,故共設(shè)置 N+1 個反應(yīng),,這樣一起并排電泳時容易判斷哪個條帶是模板 DNA,哪個條帶是擴(kuò)增得到的RNA,。在 N+1 個 RNase-free 的塑料離心管中,,在室溫下(不是在 4℃下)按次序加入下列成分:
注:此為 20μL 反應(yīng)體系的用量,對其他體積的反應(yīng)體系,,各成分的用量可以按比例增減,。如果需要標(biāo)記 RNA 探針,則需要另購 NTP 與 2×T3 轉(zhuǎn)錄預(yù)配液分開提供的試劑盒,。
2.37℃保溫 1-2 小時,。注意:延長保溫時間并不能提高產(chǎn)量。
3.70℃加熱 10 分鐘滅活 T3 RNA 聚合酶,。
4.取 1-3μL 電泳檢測轉(zhuǎn)錄效果,。比陰性對照多出的條帶就是擴(kuò)增得到的 RNA
(由于檢測時的電泳不需要堿變性膠,并且合成的 RNA 長度不一定均勻,, 即使長度均勻,,但由于自生形成發(fā)夾結(jié)構(gòu),因此不一定呈現(xiàn)清晰的電泳條帶,。但由于 RNA 是單鏈,,分子量比同樣長度的 DNA 小一倍,因此轉(zhuǎn)錄得到的 RNA 一般比其模板電泳速度更快,。
5.定量,,可以用自備的單鏈 RNA 定量試劑盒檢測濃度,也可以肉眼比較電泳膠上 RNA 和 DNA 的強(qiáng)度,。由于 RNA 是單鏈,,跟核酸染料結(jié)合力低,因此同等亮度的 RNA 條帶,其 RNA 分子數(shù)一般比 DNA 的分子數(shù)多一倍,。1 μg DNA 模板一般可以合成 2-6μg 的 RNA(含帶帽 RNA),。
得到的 RNA 可以放-80℃保存(溶液中有 DNA 模板和未使用的 NTP)。注:若需進(jìn)一步去除 T3 轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系中的 DNA 模板,,可參考下列操作步
驟,,但所用試劑需另行購買,,本試劑盒不提供,。
1. 在體外轉(zhuǎn)錄結(jié)束后,在反應(yīng)體系中加入 3-5 U 自備的 RNase-free DNase,。 2. 37℃保溫 15-30 分鐘,。
3.補(bǔ)水到 100μL,
4.用自備的等體積(100μL)的 Tris 飽和酚-氯仿抽提一次去除殘留的 DNase和 RNA 聚合酶,。
5.在上清中加 200μL 自備的微量核酸沉淀劑(CAT#50903,;用前需要搖晃混勻),振蕩后 15000 rpm 離心 3-5 分鐘,,棄上清,。
6.加入 1mL 75%乙醇,震蕩 10 秒后 15000 rpm 離心 3-5 分鐘,,棄上清,。
7.短暫離心數(shù)秒,用槍頭吸棄上清,。
8.晾干半分鐘,,所得沉淀即去除 DNA 模板后的 RNA??扇苡?RNase-free水中后立即使用或放-80℃長期保存,。
選擇我們的T3體外轉(zhuǎn)錄及加帽試劑盒,就是選擇精準(zhǔn),、高效,、可靠的檢測方案,為您的科研實(shí)驗(yàn)保駕護(hù)航,!
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