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羅氏LightCycler® 480 實(shí)時熒光定量PCR系統(tǒng)是實(shí)驗室中常用的一款中高通量qPCR平臺,。以下是其標(biāo)準(zhǔn)的使用步驟流程,,適用于絕大多數(shù)使用SYBR Green或TaqMan探針進(jìn)行核酸擴(kuò)增和定量分析的場景:
羅氏LightCycler® 480 使用步驟
一,、實(shí)驗準(zhǔn)備
核酸提取
提取DNA或RNA(如為RNA需進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA)
評估濃度與純度(建議A260/A280介于1.8–2.0)
試劑準(zhǔn)備
根據(jù)實(shí)驗方案選擇合適的qPCR試劑(如SYBR Green I Master,、Probe Master)
準(zhǔn)備引物/探針工作液,,確保無氣泡、低溫避光保存
二,、反應(yīng)體系配置
標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系(以20 µL體積為例):
成分 | 體積(µL) |
---|---|
Master Mix | 10 |
Forward Primer (10 µM) | 0.4 |
Reverse Primer (10 µM) | 0.4 |
探針/染料(如適用) | 0.2 |
模板DNA/cDNA | 1–2 |
無RNAse水 | 補(bǔ)足至20 µL |
注意:
所有反應(yīng)成分應(yīng)在冰上配置,;
引物濃度通常在0.2–0.5 µM之間;
若使用多重qPCR,,請確保熒光通道互不干擾,。
三,、裝板與封板
將反應(yīng)混合液分裝至96孔或384孔反應(yīng)板中;
使用專用光學(xué)封板膜密封反應(yīng)板,;
輕壓封膜并離心去除氣泡(例如2000 rpm × 30秒),;
插入LightCycler® 480中指定托架位置。
四,、程序設(shè)定(軟件操作)
在LightCycler® 480 Software中設(shè)置PCR程序,,以下為常用的SYBR Green法設(shè)定模板:
預(yù)變性:95°C, 10 min
循環(huán)階段(40–45 cycles):
變性:95°C, 10 sec
退火:60°C, 20 sec(具體溫度依引物而定)
延伸:72°C, 20 sec(有時與退火合并)
熔解曲線分析(如用SYBR Green):
95°C, 5 sec
65°C–95°C逐步升溫,每步0.5°C,,采集熒光
熒光采集通道:根據(jù)染料選擇通道(如FAM通道用于SYBR或FAM-TaqMan探針)
五,、運(yùn)行與監(jiān)控
確認(rèn)熱蓋溫度(一般為105°C);
啟動程序運(yùn)行,,期間可實(shí)時觀察擴(kuò)增曲線,;
運(yùn)行時間約為1.5–2小時(視程序設(shè)定而定);
六,、數(shù)據(jù)分析
擴(kuò)增曲線查看:確認(rèn)每孔反應(yīng)特征,,是否存在拖尾、背景信號,;
Ct值判讀:導(dǎo)出或自動生成Ct結(jié)果表,;
熔解曲線分析(SYBR Green):判斷特異性與是否出現(xiàn)非特異擴(kuò)增;
標(biāo)準(zhǔn)曲線法(如絕對定量):生成曲線并計算拷貝數(shù),;
表達(dá)量分析(如相對定量):使用ΔΔCt法比較表達(dá)差異,;
七、數(shù)據(jù)導(dǎo)出與保存
可導(dǎo)出
.xls
,.pdf
,.xml
等格式結(jié)果,;保存完整項目用于追溯和后續(xù)分析,;
建議同時備份至本地和實(shí)驗室服務(wù)器。
八,、儀器清潔與維護(hù)
每次使用后清理反應(yīng)板托盤,;
定期進(jìn)行光路校準(zhǔn)與溫控驗證;
每月檢查熱蓋壓力與熒光通道響應(yīng),;
若長期不使用,,建議進(jìn)行關(guān)機(jī)保護(hù)處理。