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熒光檢測PCR定量檢測原理及優(yōu)點

閱讀:235      發(fā)布時間:2025-3-21
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熒光檢測 PCR 定量檢測,,即實時熒光定量 PCR(qPCR),其原理是在普通 PCR 的基礎(chǔ)上,,加入熒光基團,,通過對 PCR 過程中熒光信號的實時監(jiān)測,,實現(xiàn)對核酸模板的定量分析,具體如下:

熒光信號產(chǎn)生機制

熒光染料法:常用的熒光染料如 SYBR Green I,,它可以特異性地結(jié)合到雙鏈 DNA 的小溝部位,。在 PCR 反應(yīng)體系中,當 DNA 進行復(fù)制形成雙鏈時,,SYBR Green I 就會結(jié)合到雙鏈 DNA 上,,從而被激發(fā)產(chǎn)生熒光信號。而且熒光信號的強度與雙鏈 DNA 的含量成正比關(guān)系,。

探針法:使用的是 TaqMan 探針等,。TaqMan 探針是一段與目標 DNA 序列特異性互補的寡核苷酸,其 5' 端標記有熒光報告基團(如 FAM),,3' 端標記有熒光淬滅基團(如 TAMRA),。在 PCR 反應(yīng)過程中,當引物延伸到探針結(jié)合部位時,,Taq 酶的 5' - 3' 外切酶活性會將探針降解,,使得熒光報告基團與淬滅基團分離,從而產(chǎn)生熒光信號,。每擴增一條 DNA 鏈,,就會有一個探針被切斷,釋放出一個熒光信號,。

定量原理

標準曲線法:通過一系列已知濃度的標準品模板進行 PCR 擴增,,得到不同濃度標準品對應(yīng)的熒光信號值,以標準品的起始拷貝數(shù)的對數(shù)為橫坐標,,以對應(yīng)的熒光閾值循環(huán)數(shù)(Ct 值)為縱坐標,,繪制出標準曲線。在相同條件下對未知樣品進行 PCR 擴增,,根據(jù)其得到的 Ct 值,,從標準曲線上就可以計算出未知樣品的起始拷貝數(shù)。

Ct 值的定義與應(yīng)用:Ct 值是指在 PCR 擴增過程中,,熒光信號開始由本底進入指數(shù)增長階段的拐點所對應(yīng)的循環(huán)次數(shù),。研究表明,在 PCR 反應(yīng)的指數(shù)增長期,,Ct 值與起始模板量的對數(shù)呈線性關(guān)系,,即起始模板量越多,Ct 值越??;反之,起始模板量越少,,Ct 值越大,。因此,,可以利用 Ct 值來對模板進行定量分析。

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熒光檢測 PCR 定量,,即實時熒光定量 PCR(qPCR),,具有以下優(yōu)點:

靈敏度高:能夠檢測到極低拷貝數(shù)的核酸模板,可對痕量核酸進行定量分析,,比如在病毒感染早期,,血液中病毒核酸含量極低時,也能準確檢測出病毒的存在并進行定量,,有助于疾病的早期診斷,。

特異性強:無論是使用熒光染料法還是探針法,都具有很高的特異性,。探針法中,,TaqMan 探針與目標 DNA 序列特異性互補結(jié)合,只有當引物和探針都與目標序列準確結(jié)合時才能產(chǎn)生熒光信號,,極大地提高了檢測的特異性,;熒光染料法中,SYBR Green I 只結(jié)合雙鏈 DNA,,且在 PCR 引物設(shè)計時會確保其與目標序列特異性結(jié)合,從而保證了檢測的特異性,。

精確性好:通過對熒光信號的實時監(jiān)測和對 Ct 值的精確測定,,以及標準曲線的建立,能夠?qū)崿F(xiàn)對核酸模板的準確定量,。實驗結(jié)果的重復(fù)性好,,變異系數(shù)通常較低,在科研和臨床診斷等領(lǐng)域能夠提供可靠的數(shù)據(jù),。

快速高效:整個 PCR 過程在封閉的反應(yīng)體系中進行,,無需像傳統(tǒng) PCR 那樣在反應(yīng)結(jié)束后進行開蓋檢測,減少了操作步驟和時間,,同時也降低了污染的風險,。一般在 1 - 2 小時內(nèi)就能完成檢測,能夠快速得到檢測結(jié)果,,適用于緊急情況和大規(guī)模樣本的檢測,。

高通量:可以同時對多個樣本進行檢測,配合自動化的儀器設(shè)備,,能夠?qū)崿F(xiàn)一次運行檢測幾十甚至上百個樣本,,大大提高了檢測效率,適用于大規(guī)模的疾病篩查,、基因表達分析等研究和應(yīng)用,。

實時監(jiān)測:在 PCR 擴增過程中實時監(jiān)測熒光信號的變化,,能夠直接觀察到核酸擴增的動態(tài)過程,了解反應(yīng)的進程和效率,,及時發(fā)現(xiàn)異常情況,,如引物二聚體的形成、非特異性擴增等,,有助于對實驗結(jié)果進行準確的分析和判斷,。


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