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WB 實驗常見問題及問題排除

閱讀:312      發(fā)布時間:2025-1-6
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WB 實驗結(jié)果有黑點
原因解決方案
封閉液未溶解a. 確認奶粉溶解,。出現(xiàn)黑點最常發(fā)生的原因是奶粉沒有溶解,,建議加入攪拌子,增加攪拌時間,,或是溶解后離心取上清液使用,。
b. 利用0.45 um的濾紙過濾溶液,以除去未溶解的牛奶顆粒及其他雜質(zhì),。
c. 改變封閉液的種類,,如換為BSA。
溶液污染a. 使用新鮮配制的溶液 (跑膠,、轉(zhuǎn)膜,、封閉、洗脫等緩沖液)或商業(yè)化溶液,,以減少因長菌長霉造成的黑點,。
b. 確認一抗溶液是否保存不當,可嘗試重新配置一抗溶液,。
封閉液及抗體交互作用一般脫脂牛奶中含有casein這種磷酸蛋白,,可能會與磷酸化抗體產(chǎn)生非特異性結(jié)合,因此,,如使用磷酸化抗體,,建議用BSA作為封閉溶液,同時洗脫溶液也用TBST,如此可降低黑點或高背景值狀況,。
注:a. TBST是以Tris為基底,,PBST是以磷酸鹽為基底的緩沖液,一般根據(jù)習慣選擇使用TBST或PBST,。但如果是操作磷酸化抗體或最終顯色分析是用AP系統(tǒng)時,,因為PBST中的磷酸根會干擾,可能會造成高背景值或無信號,,此時建議使用TBST緩沖液,。另外,同一次實驗中請使用一種緩沖液,,不可封閉液用PBST,,洗脫液用TBST。
b. 封閉時一般使用3-5%封閉溶液,,依實驗特性不同,,可做微調(diào);牛奶與BSA的選擇也是相同,,掌握原則后,,再依實驗特性做微調(diào),就能快速上手,。
WB實驗結(jié)果信號過曝
原因解決方案
蛋白樣品過量降低蛋白上樣量,。通常蛋白上樣量為30-50 ug,但有些蛋白的表達量較高(如beta actin),,此時可依蛋白表現(xiàn)量,,調(diào)整上樣量。
抗體過量a. 提高抗體稀釋倍數(shù),。產(chǎn)生過曝時可提高一抗,、二抗的稀釋倍數(shù)。
b. 減少孵育時間
c. 于4℃孵育
信號過曝a. 縮短曝光時間,。過曝時可縮短曝光時間,,減少過曝的情形。
b. 使用低靈敏度的化學發(fā)光底物,。過曝現(xiàn)象也有可能是因為化學發(fā)光底物過強導致的, 可選用靈敏度較低的化學發(fā)光底物來改善,。
注:化學發(fā)光底物一般有三種等級,femto(飛克, 10-15g),, pico(皮克, 10-12g), 及plus(低皮克級, 10-12~ 10-9g),,可依蛋白表達量挑選適合的化學發(fā)光底物。
WB實驗結(jié)果拖帶
原因解決方案
樣本不純,,有雜質(zhì)污染a. 重新離心樣品后取上清液使用
b. 使用較純的試劑配置細胞裂解液或購買商業(yè)化產(chǎn)品
c. 使用Benzonase®核酸酶,。Benzonase®核酸酶能迅速水解核酸,,降低蛋白樣品粘度,減少核酸對跑膠的干擾
d. 全細胞或亞細胞萃取,。使用商業(yè)化全細胞或亞細胞萃取試劑盒提取蛋白樣品,,減少配制試劑溶液以及操作中分離不干凈的問題。
蛋白樣品過量a. 降低蛋白上樣量,。通常蛋白上樣量為30-50ug,,但有些蛋白表達量較高(如beta actin),此時可依蛋白表達量,,進行微調(diào),。
b. 延長加熱時間,。蛋白變性不, 也會使條帶成團拖尾,,此時可通過延長樣品加熱時間(一般約5分鐘)及調(diào)整SDS(一般是2 %)比例, 使蛋白變性更。
信號過曝a. 縮短曝光時間,。過曝時可縮短曝光時間, 減少過曝的情形,。
b. 使用低靈敏的化學發(fā)光底物。過曝現(xiàn)象可能是因為化學發(fā)光底物過強導致的, 可選用靈敏度較低的化學發(fā)光底物來改善,。
WB條帶扭曲
原因解決方案
膠沒配置好a. 確保APS & TEMED 正常, 并新鮮配置膠體,。
APS為起始劑,主要負責提供自由基供膠體進行聚合反應,, APS粉末容易受潮,,建議置于防潮箱保存,如果發(fā)生結(jié)塊,,建議重新購買,。TEMED為催化劑,如果保存不當或過期,,也會影響膠體聚合,,建議分裝。
b. 小心移除齒梳,,避免造成加樣壁孔歪斜
c. 配完下層膠后,,需用水或醇類將膠體壓平
d. 膠里面有雜質(zhì)/氣泡??深A先用0.45 um濾紙過濾膠體溶液,,混合膠體溶液時,應避免產(chǎn)生氣泡,。
電流電壓問題a. 避免用高電壓電泳使膠體過熱,。 150V,過熱有霧氣,,80-100V,,上膠帶短、下層不勻。
b. 空的孔道加樣品緩沖液,,使每個孔洞都有樣品且鹽類成分相近,。
c. 避免孔洞中有雜質(zhì),用高純度等級的化學藥品或用商業(yè)化試劑提取蛋白樣品,,或在上樣前用跑膠緩沖溶液沖洗加樣孔,。
轉(zhuǎn)膜問題a. 膠體應與膜密合,轉(zhuǎn)膜時小心滾壓膠體,,使膠體與膜貼合緊實
b. 轉(zhuǎn)膜時小心勿晃動,。有時出現(xiàn) 2個條帶是因為轉(zhuǎn)膜時發(fā)生晃動,產(chǎn)生疊影
條帶呈啞鈴狀
出現(xiàn)啞鈴最大的可能是膠沒有配置好,,膠凝固后不均一,,拔完梳子之后,某些孔道凸起不平整,,可以試著注意膠體是否凝固(確認試劑沒問題),,拔梳子時注意不要讓孔道歪掉,loading前也可以再用running buffer沖洗孔道,,另外還有一種可能是樣品中含有太多雜質(zhì),,沒有離心下來,或沒有溶解,,然后雜質(zhì)沉積在孔的中間,,蛋白因此被推擠到兩邊。
條帶呈啞鈴狀原因:出現(xiàn)啞鈴狀最可能是膠沒有配制好,,膠凝固后不均,,拔完齒梳之后,某些孔道凸起不平整,,另一種可能是樣品中含有過多雜質(zhì),,沒有離心下來,或沒有溶解,,導致雜質(zhì)沉積在孔的中間,,蛋白因此被推擠到兩邊。
解決方案:確認膠體是否凝固,,拔齒梳時注意不要讓孔道歪斜,,上樣前可再用跑膠緩沖液沖洗孔道。
WB背景值較高
原因解決方案
封閉不足a. 提高封閉液濃度,,確保封閉液覆蓋轉(zhuǎn)印膜,,如使用5% 脫脂奶粉或BSA。
b. 增加封閉時間,,一般情況會使用37℃封閉1小時,,可視情況調(diào)整封閉的條件,。
c. 使用BSA作為封閉液,同時搭配使用TBST的洗脫液來降低高背景值的狀況,。
抗體問題a. 抗體濃度太高,。建議降低抗體濃度,并增加洗滌次數(shù)和時間,。
b. 一抗孵育溫度過高,,建議4℃孵育過夜。
c. 二抗的非特異性背景,,可增加二抗對照,,以陽性對照組確認二抗。
d. 洗脫不足,,增加洗脫液體積和洗滌次數(shù),。
顯色問題化學發(fā)光底物過多,建議調(diào)整化學發(fā)光底物,,按說明書加入適量的顯色底物,。也可依據(jù)蛋白表達量的不同,,選擇合適的化學放光底物,。
膜的問題a. 挑選合適的NC或PVDF膜。依據(jù)靶標蛋白,、想要呈現(xiàn)的實驗結(jié)果及膜的特性,,選擇出適合實驗的材料。
b. 建議實驗過程中都必須注意讓膜保持濕潤,,特別是PVDF膜,。
c. 在使用PVDF膜時可能會出現(xiàn)浸潤不均勻的情況,從而導致背景值比較高的情況,。因此,,建議使用PVDF膜前使用100% methanol浸潤膜。
WB條帶非專一性
原因解決方案
蛋白質(zhì)降解a. 蛋白質(zhì)抑制劑或磷酸酶抑制劑
b. 冰上操作
c. 避免反復凍融
蛋白質(zhì)形成多聚糖a. 使用現(xiàn)配的DTT/2-ME,,并將加熱時間延長
b. 確認樣本煮沸時的溫度達到95-100℃
確認蛋白質(zhì)特性查詢生物信息確認蛋白是否存在后修飾,、剪切體等。
抗體濃度過高或蛋白樣品過量a. 調(diào)整蛋白上樣量為30-50 ug或減少上樣量
b. 增加抗體稀釋倍數(shù)
抗體非專一性結(jié)合a. 增加洗膜次數(shù)與除垢劑強度
b. 設對照組確認抗體專一性
c. 詢問抗體公司技術(shù)支持
抗體認到輕重鏈的信號a. 換不同宿主來源的一抗
b. 使用EasyBlot二抗
目標信號微弱
原因解決方案
蛋白問題a. 了解靶標蛋白的特性
? 是否存在特異性? 可提取特定細胞器增加蛋白濃度,,例:抽取核蛋白,、膜蛋白、胞質(zhì)蛋白,。
? 是否存在組織特異性? 有些目標蛋白只會在特定組織表達,,這可降低樣本挑選的錯誤率。
? 是否有后修飾作用? 目標蛋白后修飾分子量會變大,,使抗體認到的位置比估算分子量高,。
? 確認靶標蛋白在細胞株的表達量以及是否需加藥誘導蛋白表達,。
b. 增加蛋白質(zhì)上樣量。一般蛋白上樣量為20-30μg/孔, 如文獻已表明靶標蛋白表達量低或是使用極少的上樣量(例如< 10μg),,需增加上樣量來協(xié)助抗體偵測其信號,。
c. 減少蛋白降解。
? 細胞萃取時要加蛋白質(zhì)抑制劑或磷酸酶抑制劑,,避免蛋白降解,。
? 在冰上操作蛋白質(zhì)實驗。
? 避免反復凍融樣品(建議分裝),。
? 新鮮制備新一批的樣本,。
抗體問題a. 調(diào)整抗體孵育條件。
? 增加抗體量,,例如原本使用1:1000稀釋,,調(diào)整為1:500稀釋。
? 增加孵育時間:將原37℃孵育1小時改成4℃孵育過夜,。
b. 一抗二抗不相容,。檢查二抗與一抗種屬是否有正確配對,要訣:“鼠配鼠兔配兔,,isotype相配不出錯",。
c. 過度洗脫。減少洗脫次數(shù)與時間:一般洗脫三次, 每次5-10分鐘即可,。
轉(zhuǎn)膜問題a. 檢查轉(zhuǎn)膜方向,。轉(zhuǎn)膜方向錯誤會讓蛋白往反方向移動散逸在轉(zhuǎn)膜緩沖液里,方向正確才能讓蛋白粘附咋轉(zhuǎn)印模的孔洞里,。
b. 根據(jù)分子量調(diào)整轉(zhuǎn)膜條件,。大分子蛋白轉(zhuǎn)膜條件可調(diào)整為低溫過夜(濕式轉(zhuǎn)膜),小分子蛋白改用0.2 um的轉(zhuǎn)印膜,,縮短轉(zhuǎn)膜時間,。
封閉過度a. 降低封閉液濃度:一般使用3-5%的牛奶或BSA做封閉液即可。
b. 降低封閉時間:一般封閉時間為30-60分鐘,。
c. 換封閉液,,可使用商業(yè)化封閉液(GTX30963)可協(xié)助避免這個問題的發(fā)生。
化學發(fā)光底物失活或敏感度不夠a. 使用現(xiàn)配的化學發(fā)光底物
b. 使用高敏感度的化學發(fā)光底物,,例如使用飛克(GTX14698)等級的化學發(fā)光底物,。
c. 增加曝光時間


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