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當(dāng)前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術(shù)服務(wù)>>蛋白分析>> 高通量SWATH-MS蛋白質(zhì)定量助力生物
產(chǎn)品型號(hào)
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時(shí)間:2025-06-12 12:03:59瀏覽次數(shù):36次
聯(lián)系我時(shí),,請(qǐng)告知來自 化工儀器網(wǎng)基于LC-MS的無標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué):高
如何利用AI與機(jī)器學(xué)習(xí)提升無標(biāo)記蛋白質(zhì)組
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生物標(biāo)志物在疾病早期篩查,、分型診斷,、個(gè)體化治療和療效監(jiān)測中發(fā)揮著核心作用。隨著臨床研究日趨精細(xì)化,,標(biāo)志物篩選面臨的技術(shù)門檻不斷提高,,尤其是在低豐度蛋白的準(zhǔn)確識(shí)別與跨批次數(shù)據(jù)一致性方面。質(zhì)譜是dànbáizhì組研究的基礎(chǔ)工具,,其中DDA(Data-Dependent Acquisition)模式由于其隨機(jī)采集機(jī)制,,存在覆蓋度有限、重現(xiàn)性差的問題,。而SWATH-MS(Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra)作為數(shù)據(jù)獨(dú)立采集(DIA)技術(shù)的代表,,憑借全面、無偏,、穩(wěn)定的采集方式,,為高通量,、可信賴的標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)提供了全新路徑。
一,、SWATH-MS:重新定義dànbáizhì組定量方式
SWATH-MS通過將m/z范圍劃分為多個(gè)連續(xù)窗口,,在每個(gè)窗口內(nèi)同時(shí)對(duì)所有前體離子進(jìn)行碎裂和采集,完整記錄碎片離子譜圖,。這種無選擇性,、系統(tǒng)性的采集方式解決了DDA中只關(guān)注強(qiáng)信號(hào)的偏倚問題,提升了dànbáizhì的檢測深度和定量精度,。其技術(shù)底層機(jī)制確保每一次實(shí)驗(yàn)都具備穩(wěn)定,、可重復(fù)、高覆蓋率的數(shù)據(jù)輸出,,大幅提高了標(biāo)志物研究中關(guān)鍵蛋白的檢出概率與定量可信度,。
二、技術(shù)優(yōu)勢(shì)總結(jié):為何SWATH-MS適合標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)
1,、全面采集,,無盲區(qū)
SWATH-MS不會(huì)遺漏低豐度或弱信號(hào)肽段,保證對(duì)復(fù)雜樣本中所有可檢測離子的系統(tǒng)覆蓋,,避免重要生物學(xué)信息被采集策略所“屏蔽"。
2,、高覆蓋率,,識(shí)別低豐度蛋白
對(duì)于臨床早期診斷或微環(huán)境研究中表達(dá)變化細(xì)微的蛋白,SWATH-MS具備更強(qiáng)的定量靈敏度與識(shí)別能力,,是低信號(hào)標(biāo)志物挖掘的重要工具,。
3、高通量,,適配大樣本設(shè)計(jì)
一次運(yùn)行可定量上萬個(gè)蛋白,,適合多條件、多重復(fù)的大規(guī)模實(shí)驗(yàn)需求,,縮短項(xiàng)目周期,,提高數(shù)據(jù)利用效率。
4,、重現(xiàn)性強(qiáng),,數(shù)據(jù)一致性好
統(tǒng)一的掃描策略顯著提升批間一致性,確保來自不同時(shí)間,、不同實(shí)驗(yàn)批次的數(shù)據(jù)具有可比性,,尤其適合多中心標(biāo)志物驗(yàn)證研究。
5,、數(shù)據(jù)可追溯,,可重分析
完整保存的碎片譜圖支持?jǐn)?shù)據(jù)反復(fù)挖掘,無需重新實(shí)驗(yàn)即可進(jìn)行新的生物信息分析或模型訓(xùn)練,提升科研數(shù)據(jù)生命周期價(jià)值,。
三,。應(yīng)用場景聚焦:SWATH-MS如何賦能標(biāo)志物研究
1、疾病早期診斷
早期病變往往只涉及微弱蛋白表達(dá)變化,,且多為低豐度信號(hào),。SWATH-MS可以在不犧牲通量的前提下,可靠識(shí)別出這些早期差異蛋白,,是構(gòu)建早篩面板的理想技術(shù)平臺(tái),。
2、臨床隊(duì)列樣本分析
大規(guī)模臨床樣本往往來源復(fù)雜,、批次跨度大,,DDA在此類項(xiàng)目中容易導(dǎo)致蛋白缺失率高。SWATH-MS的高重復(fù)性為穩(wěn)定建庫與差異分析提供強(qiáng)有力保障,。
3,、多組學(xué)聯(lián)合研究
在與轉(zhuǎn)錄組、代謝組聯(lián)合分析時(shí),,SWATH-MS提供的蛋白定量數(shù)據(jù)能有效支撐網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與通路還原,,提升多維標(biāo)志物組合的準(zhǔn)確性與解讀深度。
在dànbáizhì組學(xué)不斷向“高通量,、高準(zhǔn)確,、強(qiáng)轉(zhuǎn)化"方向演進(jìn)的jīntiān,SWATH-MS通過改變采集邏輯,,構(gòu)建了一個(gè)更穩(wěn)定,、更全面的定量平臺(tái)。其在生物標(biāo)志物研究中的作用,,已從“輔助工具"躍升為“核心基礎(chǔ)設(shè)施",。百泰派克生物科技提供SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù),涵蓋樣本處理,、質(zhì)譜采集與數(shù)據(jù)分析全過程,。如果您正致力于開展相關(guān)研究,歡迎聯(lián)系我們,,獲取個(gè)性化技術(shù)支持,。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),,包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,,Cduāncèxù和全序列分析,,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù),。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),,對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析,。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),,助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作,。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織,、細(xì)胞,、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確,。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量,。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.技術(shù)先進(jìn),,填補(bǔ)技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白,。
2.分析數(shù)量大,,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,,在臨床診斷,、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向,。除常規(guī)蛋白外,,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細(xì)胞存活率,、細(xì)胞大小,、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等,。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別,。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量,。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,,深入挖掘未知的靶標(biāo),。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),,MALDI TOF,,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,,從dànbáizhì,、多肽、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì),。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù),。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA,、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,,建立了完備的質(zhì)量體系,,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,,軟件審計(jì)追蹤,,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā),、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行,。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù),;
2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué),、多肽組學(xué),、代謝組學(xué)、生物藥物表征,、單細(xì)胞分析,、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等,;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺(tái),,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),,10000+客戶的選擇,;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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