自下而上和自上而下蛋白質組學的全面解析檢測技術服務詳情介紹

自下而上和自上而下蛋白質組學是蛋白質組學研究中的兩種主要策略,，旨在解析蛋白質的結構,、功能以及相互作用。自下而上蛋白質組學（Bottom-Up Proteomics）主要是通過蛋白質的酶解,，將復雜的蛋白質樣本分解成更小的肽段,，再通過質譜等高靈敏度的分析技術對這些肽段進行識別和定量分析。這種方法的核心在于通過肽段的信息反推整個蛋白質的性質和功能。因此,，自下而上蛋白質組學在大規(guī)模蛋白質識別,、定量和功能解析方面具有廣泛的應用。 與之相對的,，自上而下蛋白質組學（Top-Down Proteomics）則是直接對完整蛋白質進行分析,。這種方法避免了蛋白質酶解可能帶來的信息丟失問題，能夠提供關于蛋白質修飾,、異構體和亞型的詳細信息,。自上而下蛋白質組學在研究蛋白質多態(tài)性、翻譯后修飾以及蛋白質復合物的結構分析中具有dútè的優(yōu)勢,。因此,，兩者在蛋白質組學研究中有著互補的作用，結合使用能更全面地揭示蛋白質的生物學意義,。

一,、自下而上蛋白質組學

先使用酶（如yídànbáiméi）將蛋白質樣本水解成小肽段，再對這些肽段進行質譜分析,，zuì后根據(jù)肽段的質譜數(shù)據(jù)推測原始蛋白質的序列,。

1、步驟

（1）酶解：選擇合適的蛋白酶將蛋白質切割成較小的肽段,。

（2）分離：通過一維或多維色譜技術對酶解后的肽段混合物進行分離,。

（3）質譜分析：將分離后的肽段送入質譜儀，得到肽段的質荷比等數(shù)據(jù),。

（4）數(shù)據(jù)庫匹配：將質譜數(shù)據(jù)與已知的蛋白質數(shù)據(jù)庫進行比對,，識別出樣品中的蛋白質。

2,、優(yōu)點

（1）高通量：能夠同時處理大量的蛋白質樣品,，快速鑒定出大量蛋白質。

（2）適合復雜樣本：對于復雜的蛋白質混合物,，如細胞裂解液等,，能有效進行分析。

（3）技術成熟：經(jīng)過多年發(fā)展,，相關技術和方法已經(jīng)比較成熟,，實驗操作相對簡單。

3,、缺點

（1）修飾信息丟失：在酶解過程中,，可能會導致蛋白質的翻譯后修飾信息丟失或難以準確判斷修飾位點。

（2）結構信息不完整：蛋白質被切割成肽段后,，無法直接得到蛋白質的整體結構信息,，難以研究蛋白質的gāojí結構和蛋白質-蛋白質相互作用,。

（3）肽段偏好性：某些肽段可能由于自身特性，在酶解,、分離或質譜分析過程中存在偏好性,，導致部分蛋白質的鑒定不準確或無法鑒定。

4,、適用場景

（1）大規(guī)模蛋白質鑒定：在對未知蛋白質組進行普查,，快速確定樣品中存在哪些蛋白質時非常有效。

（2）蛋白質定量分析：如比較不同細胞狀態(tài),、不同組織或不同疾病樣本中的蛋白質表達量變化,。

（3）生物標志物發(fā)現(xiàn)：從大量蛋白質中篩選出與疾病或生理過程相關的潛在生物標志物。

二,、自上而下蛋白質組學

直接對完整的,、未經(jīng)消化的蛋白質進行分析，通過質譜儀測量出蛋白質的分子量和結構等信息,。

1,、步驟

（1）蛋白質分離：采用液相色譜或 2-D 凝膠電泳等技術從復雜的生物樣品中分離出完整的蛋白質。

（2）質譜分析：將完整蛋白質直接送入質譜儀,，利用電噴霧電離（ESI）或基質輔助激光解吸電離（MALDI）等軟電離方法將蛋白質離子化,，再通過多種解離方法如高能碰撞引入解離（HCD）、電子捕獲解離（ECD）和電子轉移解離（ETD）產(chǎn)生碎片,，進行質譜分析,。

2、優(yōu)點

（1）完整信息保留：能夠保留蛋白質的完整結構信息,，包括翻譯后修飾（如磷酸化、甲基化等）以及蛋白質異構體或亞型的信息,。

（2）直接分析：無需酶解等預處理步驟,，減少了實驗操作過程中的誤差和信息丟失風險，可直接檢測生物蛋白質的分子量,。

（3）研究蛋白質復合物：對于蛋白質復合物的分析優(yōu)勢明顯,，能夠發(fā)現(xiàn)蛋白質復合物及其翻譯后修飾的組合形式。

3,、缺點

（1）技術要求高：對于大分子蛋白質的分離和分析較為困難,，需要高分辨率和高精度的質譜儀。

（2）通量較低：相比自下而上蛋白質組學,，分析速度較慢,，難以進行大規(guī)模的蛋白質分析。

（3）數(shù)據(jù)處理復雜：得到的質譜數(shù)據(jù)相對復雜,，解析難度較大,，需要更優(yōu)良的數(shù)據(jù)處理軟件和技術。

4、適用場景

（1）蛋白質結構研究：需要jīngquè了解蛋白質的三維結構,、折疊狀態(tài)以及二硫鍵等結構特征時,。

（2）翻譯后修飾研究：深入研究蛋白質的翻譯后修飾類型、位點和修飾程度,，以及修飾之間的相互關系,。

（3）蛋白質異構體分析：區(qū)分和鑒定蛋白質的不同異構體或亞型，研究其在生理和病理過程中的作用,。

百泰派克生物科技在自下而上和自上而下蛋白質組學領域提供全面的分析服務,。我們擁有經(jīng)驗豐富的技術團隊，能夠根據(jù)客戶的研究需求制定個性化的蛋白質組學解決方案,。無論是大規(guī)模的蛋白質鑒定還是復雜蛋白質的深度解析,，百泰派克始終致力于為客戶提供高質量、可靠的研究結果,。歡迎與我們合作,，共同推進蛋白質組學研究的前沿探索。

百泰派克生物科技特色項目

一,、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質序列進行分析,，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對蛋白質的氨基酸組成分析,，N端測序,，C端測序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務,。對于未知理論序列的蛋白質,，提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務，對蛋白序列進行分析,。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液,、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,，PEC和和糖基化等N端修飾的影響,。

二、蛋白質組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,，提供定量蛋白質組學,、靶向蛋白質組學、多肽組學,、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務,。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,，助力微量樣本蛋白組學,、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作,。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質標記方法,，適用于分析組織,、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高,，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確,。

三,、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子,，然后用流式細胞原理分離單個細胞,，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數(shù)據(jù)轉換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量,。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良,，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題,?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白,。

2.分析數(shù)量大,，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞,，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq,。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景,；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾,；

③可檢測細胞存活率、細胞大小,、mRNA轉錄子表達量,、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四,、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的,、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案,。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量,。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥,、免疫疾病及傳染病的解決方案,，深入挖掘未知的靶標。

五,、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術,，MALDI TOF，高效色譜分離技術,，提供一系列完善的生物藥物分析方案,，從蛋白質、多肽,、抗體,、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析,。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務,，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征,，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務,。公司實驗室遵循NMPA、ICH,、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系,，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤,，為客戶提供一體化解決方案和技術服務,，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行,。

1.公司采用ISO9001質量控制體系,，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可,，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務,；

3.業(yè)務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學,、代謝組學,、生物藥物表征,、單細胞分析、單細胞質譜流式,、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等,；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求,；

5.服務3000+企業(yè),，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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