你知道什么是你知道什么是瓊脂糖凝膠電泳嗎,?讓我們一起來看看吧!
一,、瓊脂糖凝膠的特點(diǎn)
核酸分子是兩性解離分子,,在高于其等電點(diǎn)的電泳緩沖液中,其堿基不解離,,而磷酸基團(tuán)全部解離,核酸分子因而帶負(fù)電荷,,電泳時(shí)向正極遷移,。
瓊脂糖主要從海洋植物瓊脂中提取而來并經(jīng)糖基化修飾,為一種聚合鏈線性分子,,使用瓊脂糖凝膠作為電泳支持介質(zhì),,發(fā)揮分子篩功能,使得大小和構(gòu)象不同的核酸分子的遷移率出現(xiàn)較大差異,,從而達(dá)到分離的目的,。
因此,目前多用瓊脂糖為電泳支持物進(jìn)行平板電泳,,其優(yōu)點(diǎn)如下,。
(1)瓊脂糖凝膠電泳操作簡單,電泳速度快,,樣品不需事先處理就可以進(jìn)行電泳,。
(2)瓊脂糖凝膠結(jié)構(gòu)均勻,含水量大(約占 98%~99%),,近似自由電泳,,樣品擴(kuò)散較自由電流,對樣品吸附極微,, 因此電泳圖譜清晰,,分辨率高,重復(fù)性好,。
(3)瓊脂糖透明無紫外吸收,,電泳過程和結(jié)果可直接用紫外光燈檢測及定量測定。
(4)電泳后區(qū)帶易染色,,樣品極易洗脫,,便于定量測定。制成干膜可長期保存,。
二,、DNA 的瓊脂糖凝膠電泳
瓊脂糖凝膠電泳對核酸的分離作用主要是依據(jù)它們的相對分子量質(zhì)量及分子構(gòu)型,同時(shí)與凝膠的濃度也有密切關(guān)系。
1. 核酸分子大小與瓊脂糖濃度的關(guān)系
(1)DNA分子的大小在凝膠中,,DNA 片段遷移距離(遷移率)與堿基對的對數(shù)成反比,,因此通過已知大小的標(biāo)準(zhǔn)物移動的距離與未知片段的移動距離時(shí)行比較,便可測出未知片段的大小,。
(2)瓊脂脂糖的濃度 如下表所示,,不同大小的DNA需要用不同濃度的瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分離。
核酸構(gòu)型與瓊脂糖凝膠電泳分離的關(guān)系
2. 同構(gòu)型 DNA 的移動速度次序?yàn)椋汗﹥r(jià)閉環(huán) DNA(covalently closed circular,,cccDNA)>直線 DNA>開環(huán) 的雙鏈環(huán)狀 DNA,。
當(dāng)瓊脂糖濃度太高時(shí),環(huán)狀 DNA不能進(jìn)入膠中,,相對遷移率為 0(Rm=0),,而同等大小的直線雙鏈 DNA(剛性棒狀)則可以長軸方向前進(jìn)(Rm>0),由此可見,,這三種構(gòu)型的相對遷移率主要取決于凝膠濃度,,但同時(shí),也受到電流強(qiáng)度,、緩沖液離子強(qiáng)度等的影響,。
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