RNA 是一種核酸分子,,在生物學(xué)中扮演著重要的角色,。在細(xì)胞內(nèi),RNA 不僅具有轉(zhuǎn)錄和翻譯的功能,,而且在調(diào)控基因表達(dá),、細(xì)胞信號傳導(dǎo)以及病理機制等方面也發(fā)揮著重要的作用。Trizol法是目前普遍使用的RNA提取方法,那么Trizol法提取RNA的原理與步驟是什么,?讓我們一起來看看吧,!
一、Trizol法的實驗原理
TRIZOL 試劑是直接從細(xì)胞或組織中提取總RNA的試劑,,它在破碎和溶解細(xì)胞時能保持 RNA 的完整性,。試劑主要成分為異硫氰酸和苯酚,其中異硫氰酸肌可裂解細(xì)胞,,促使核蛋白體的解離,,使 RNA 與蛋白質(zhì)分離,并將 RNA 釋放到濟(jì)液中,。加入氯仿后離心,,樣品分成水樣層(無色)和有機層(黃色)。RNA 存在于水樣層中,。收集上面的水樣層后,,RNA 可以通過異丙醇沉淀來還原。在除去水樣層后,,樣品中的 DNA 和蛋白也能相繼以沉淀的方式還原,。乙醇沉淀能析出中間層的 DNA,在有機層中加入異丙醇能沉淀出蛋白,。
二,、Trizol法提取RNA操作步驟
1. 勻漿并裂解樣本
組織樣本:每10~100mg組織加入1ml TRNsol,建議使用機械勻漿器來勻漿,。另外也可 用液氮來破碎組織,,用研缽、研杵把組織粉碎后,,把粉末轉(zhuǎn)移至一干凈的1.5ml小離心管中,,在15- 30°C放置5分鐘,以che底分離核蛋白復(fù)合體,。,。樣本的體積應(yīng)不超過所使用的TRNsol的體積的10%,否則會出現(xiàn)DNA污染,。
2. 相分離
每1 ml TRNsol中加0.2 ml 氯仿,。蓋上離心管蓋子,劇烈地振蕩15sec,,在冰上孵育5 min,。室溫 下,12,000×g下離心10min,。此時混合物分成三層:底層為苯酚氯仿相層(紅色),,中間層,,和上層水相層(無色)。水相占總TRIZOL的60%,,RNAwan全存在于水相中,。
3. RNA沉淀
轉(zhuǎn)移不多于80%上層水相至新的離心管中,往水相中加入異丙醇,,每使用1ml的TRNsol,,加入 500μl的異丙醇(注:如果是含多糖、多酚的植物樣品,,請加入300μl異丙醇的同時加入300μl 0.8M 檸檬酸鈉/1.2M NaCl混合液),。渦旋混勻,室溫下放置10min,,然后在4度下12,000×g離心10min,,離心前可以在管的側(cè)壁和底部看到絮狀膠樣沉淀,這就是RNA沉淀,。糖類豐富的樣本:富含多糖的植物樣本或富含糖胺聚糖和蛋白質(zhì)聚糖的動物樣本需要使用以下的 修飾的沉淀方法來獲得純的RNA,。準(zhǔn)備1份Buffer A(1.2M NaCl,0.8M檸檬酸鈉),。做完第二步后,, 緊接著依次往水相中加入異丙醇和Buffer A (1ml TRNsol加0.3ml的異丙醇和0.3ml的Buffer A)。旋渦混勻,,并在室溫下,≤12,000×g離心10min,,這一高鹽沉淀會減少復(fù)雜糖類的共同純化。
4. RNA洗滌
洗滌RNA:棄上清,, 并用75%乙醇洗滌沉淀一次,。旋渦混和樣本,并在室溫下以不超過7,500×g 的速度離心樣本5min,。注意:75%的乙醇必須用DEPC處理過的滅菌水來配制,,否則75%乙醇中 殘留的RNaseA會降解RNA。5. RNA的溶解:小心地吸棄乙醇,,短暫離心將溶滴甩到管底,,用移液槍小心吸棄殘留的溶液。室 溫下空氣干燥RNA 5-10min,。不要用離心干燥裝置或真空干燥裝置,,因為過度干燥會導(dǎo)致很難用 水重新溶解RNA。加入適當(dāng)?shù)?/span>DEPC水溶解RNA,。
5. RNA再溶解
去上清,,置真空或空氣中5-10分鐘,,干燥RNA沉淀,,(不能在真空中離心干燥)。注意不能將RNA沉淀wan全干燥,這樣會極大地降低它的溶解度,。部份溶解的RNA樣品其A260/280 ratio < 1.6,。
用無RNase 水或0.5% SDS溶液重懸RNA沉淀,用槍頭反復(fù)吹打幾次,,靜置10分鐘,,55-60°C。測濃度后-20°C保存,。
6. 測濃度
取2μl 儲存液加入另一個EP管中,,再加入98μl無RNase水,離心混勻,,以無RNase水作空白對照,,測OD260/280值。1OD=40μg RNA,。OD260/280值在1.8-2.0視為純度很高,。一般濃在1000ng/ml較準(zhǔn)。濃度太高要稀釋以后再測定,。
7. RNA鑒定
甲醛變性瓊脂糖電泳,,確定抽提RNA完整性和DNA污染情況。
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