使用福爾馬林固定過(guò)組織,，其組織中的蛋白質(zhì)與核酸（DNA與RNA）會(huì)失去生物活性。福爾馬林和石蠟作為固定劑和包埋劑,，將細(xì)胞保護(hù)在其中,，十分影響核酸的提取，并且長(zhǎng)時(shí)間的保存可能會(huì)使樣品中的核酸發(fā)生降解,。
傳統(tǒng)的方法會(huì)使用二甲苯來(lái)溶解石蠟,，這種有機(jī)溶劑高度易燃，在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需要先多次使用二甲苯來(lái)溶解石蠟,，之后需要多次使用乙醇來(lái)沖洗殘留的二甲苯,。在使用二甲苯溶解石蠟的過(guò)程中，大量的二甲苯可能會(huì)對(duì)核酸造成損傷,，進(jìn)一步加劇核酸的降解,；在溶解與沖洗過(guò)程中，即使再仔細(xì)也難免將寶貴的組織材料沖掉,；并且沖洗過(guò)程很難將二甲苯WAN全洗凈,，殘留的二甲苯也會(huì)影響核酸的提取效果,。
此外，組織的消化程度也會(huì)影響DNA的提取效率,，組織不WAN全消化極大的影響DNA的提取效率,。
總的來(lái)說(shuō)，從FFPE組織中提取DNA受到以下幾個(gè)因素的制約：組織材料有限且長(zhǎng)時(shí)間保存導(dǎo)致DNA受損,，產(chǎn)量降低,；使用福爾馬林浸泡組織，導(dǎo)致不可逆的DNA交聯(lián),，這部分DNA已無(wú)法進(jìn)行擴(kuò)增,。
Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit（貨號(hào)56404）技術(shù)原理
Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit（貨號(hào)56404）可以成功克服影響FFPRE DNA提取質(zhì)量的因素，從而得到高質(zhì)量DNA,。
QIAamp DNA FFPE Tissue Kit使用成熟的QIAamp MinElute技術(shù),，從小體積樣本中純化基因組DNA和線粒體DNA。該試劑盒同時(shí)具備硅膠膜選擇性結(jié)合DNA的特性,，以及20 µl到100 µl的靈活洗脫體積,。
經(jīng)專門優(yōu)化的裂解條件，無(wú)需過(guò)夜溫育即可從福爾馬林固定,、石蠟包埋組織中高效純化基因組DNA,。蛋白酶K消化后在較高的溫度溫育，部分去除游離DNA的福爾馬林交聯(lián),，提高DNA產(chǎn)量和純度,，更適用于下游應(yīng)用。需要注意的是,，從福爾馬林固定,、石蠟包埋樣本中分離的DNA分子量通常低于新鮮或冷凍樣本中的DNA。DNA片段化的程度取決于樣本類型,、儲(chǔ)存時(shí)間以及固定的條件,。
使用Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit（貨號(hào)56404）提取的高質(zhì)量DNA可以直接應(yīng)用于多個(gè)下游反應(yīng)。如單核苷酸多態(tài)性（SNP）,、短串聯(lián)重復(fù)序列（STR）基因分型和藥物基因組學(xué)研究,，也可用于PCR。
Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit（貨號(hào)56404）的優(yōu)點(diǎn)：
1. 流程簡(jiǎn)單
2.最快僅30分鐘即可得到高純DNA
3.特別適用于同時(shí)處理多個(gè)樣本,。
4. 從小體積樣本中純化基因組DNA和線粒體DNA
(空格分隔,最多3個(gè),單個(gè)標(biāo)簽最多10個(gè)字符)
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