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高效液相色譜-質(zhì)譜儀已經(jīng)在藥物,、化工、臨床醫(yī)學(xué),、分子生物學(xué)等許多領(lǐng)域中獲得廣泛的應(yīng)用：

1.醫(yī)藥學(xué):藥物代謝,、藥物動(dòng)力學(xué)、雜質(zhì)分析,、天然產(chǎn)物分析生物化學(xué):肽,、蛋白質(zhì)、寡核苷酸,、糖

2.環(huán)境化學(xué):農(nóng)藥和農(nóng)殘分析,、有機(jī)污染物、土壤/食品/水分析

3.臨床醫(yī)學(xué):新生兒檢查,、糖化血紅蛋白(糖尿病),、血紅蛋白變異、膽酸

4.食品科學(xué):香料,、添加物,、包裝物、蛋白質(zhì),、致癌物

5.法醫(yī)學(xué):濫用藥物,、爆炸物,、興*劑檢測(cè)

6.獸醫(yī)學(xué):興*劑、磺胺類藥物,、抗體

7.合成化學(xué):有機(jī)金屬化合物,、有機(jī)合成物

8.有機(jī)化學(xué):表面活性劑、染料

藥物代謝與藥物動(dòng)力學(xué)研究

LC-MS-MS的使用,，電噴霧(ESI) 和大氣壓化學(xué)電離(APCI)以及大氣壓光電離(APPI)是其主要的離子源,，由于具有高靈敏度(ng/mI~pg/ml) ，高選擇性(檢測(cè)特定的碎片離子),、高效率(每天可檢測(cè)幾百個(gè)生物樣品和對(duì)藥物結(jié)構(gòu)的廣泛適用性，對(duì)液態(tài)樣品和混合樣品的分離能力高,，可通過二級(jí)離子碎片尋找原型藥物并推導(dǎo)其結(jié)構(gòu),，LC-ESI-MS-MS已廣泛地應(yīng)用于藥物代謝研究中一期生物轉(zhuǎn)化反應(yīng)和二期結(jié)合反應(yīng)產(chǎn)物的鑒定、復(fù)雜生物樣品的自動(dòng)化分析以及代謝物結(jié)構(gòu)闡述等,，己在大型制藥企業(yè)中取代HPLC而占據(jù)了主要地位,，其測(cè)試的樣品量占總量的70%以上。

天然產(chǎn)物天然藥物的研究

目前中藥開發(fā)研究有兩條途徑,。一條途徑是從單一植物中提取一種有效成分(單體化合物)或提取物開發(fā)成新藥,。另-途徑則是中藥復(fù)方制劑的開發(fā)研究。采用現(xiàn)代多種儀器聯(lián)用新技術(shù),，特別是高效液相色譜/質(zhì)譜/質(zhì)譜聯(lián)用(HPLC-MS/MS),，可對(duì)其十幾種乃至幾十種化學(xué)成分進(jìn)行指紋圖譜分離鑒定。再?gòu)闹讣y圖譜中選擇四,、五種指標(biāo)成分(有效成分或特征成分)進(jìn)行定量,，可以確定出簡(jiǎn)化的指紋圖譜和指標(biāo)成分，又是更合理的中藥復(fù)方質(zhì)量控制的方法,，是研究中藥復(fù)雜體系,，尤其是復(fù)方的有力工具。國(guó)內(nèi)外很多學(xué)者已進(jìn)行了復(fù)方丹參,、清開靈,、瀉心湯、人參或黨參制劑等中藥中的主要成分的分析,。

臨床診斷和疾病生物標(biāo)志物的分析

歐美等目前已廣泛采用HPLC/MS/MS法用于臨床診斷以及疾病生物標(biāo)志物的研究,、檢測(cè)，具有專一性好,、靈敏度高,、成本低、分析快速,，經(jīng)濟(jì)效益可觀等特點(diǎn),。目前可進(jìn)行新生兒遺傳疾病篩選(PKU,、MCAD等四十種左右)、新生兒性激素變異的檢測(cè),、男女激素的監(jiān)測(cè),、老年癡呆癥的早期診斷、抗排異藥物的檢測(cè),、磷酸脂的檢測(cè),、血紅蛋白變異檢測(cè)、糖化血紅蛋白( 糖尿病早期檢測(cè)),、某些心臟病,、癌癥疾病篩查如乳腺癌等等(Biomarker法、通過鑒定DNA損傷程度測(cè)定),、藥物劑量監(jiān)測(cè),、藥物相互作用監(jiān)測(cè)、地區(qū)性突發(fā)性中毒病人的毒物檢測(cè)等,。

殘留,、法醫(yī)學(xué)和環(huán)境樣品測(cè)定

我國(guó)入世后，食品工業(yè)的問題就是"安全壁壘",，這將給我國(guó)的進(jìn)出口和國(guó)內(nèi)企業(yè)帶來(lái)很大的威脅,。美國(guó)食品與藥品管理局(FDA)、歐盟,、日本,、韓國(guó)等主要貿(mào)易

國(guó)和地區(qū)公布了在進(jìn)口動(dòng)物源性食品中禁止使用的藥物名單，提高了標(biāo)準(zhǔn),。這就要求我國(guó)加強(qiáng)農(nóng),、畜、水產(chǎn)品中的農(nóng)藥,、獸藥等殘留的控制和檢測(cè),。同樣隨著人類對(duì)生存環(huán)境的倍加關(guān)注，要求對(duì)環(huán)境中各種污染物,、有害或有毒物以及法庭科學(xué)中毒物,、濫用藥物等進(jìn)行更加嚴(yán)格的監(jiān)控。而配以ESI,、APCI和APPI離子化技術(shù)的LC/MS/MS以分析速度快,、靈敏度高、特異性好等特點(diǎn)廣泛應(yīng)用與殘留和毒物分析,。目前已成功地進(jìn)行數(shù)百種農(nóng)藥,、獸藥、抗生素,、興*劑類殘留和毒物,、毒素如氯霉素,、磺胺類、硝基呋喃類,、*品,、多環(huán)芳烴等等化合物的檢測(cè)。