一）lncRNA 對(duì)于細(xì)胞周期及凋亡的調(diào)控作用
有研究報(bào)道，lncRNA 可以通過(guò)調(diào)節(jié)細(xì)胞周期和凋亡的方式,，來(lái)影響細(xì)胞的增殖,。例如,，Gas5（growth arrest-specific 5,，非編碼 RNA）在細(xì)胞周期阻滯的細(xì)胞內(nèi)大量集聚。其發(fā)揮作用的機(jī)制是抑制對(duì)于糖皮質(zhì)激素敏感的基因表達(dá),，使得細(xì)胞發(fā)生凋亡,。Gas5 能與糖皮質(zhì)激素受體上的“糖皮質(zhì)激素反應(yīng)元件"（glucocorticoid response element，GRE,，該反應(yīng)元件位于糖皮質(zhì)激素受體的 DNA 結(jié)合結(jié)構(gòu)域內(nèi)）相結(jié)合,，通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性抑制的方式抑制由糖皮質(zhì)激素受體誘導(dǎo)的 DNA 轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。
第二個(gè)例子是 lincRNA-p21（Long intergenic non-coding RNA-p21）,。該分子由 p53 激活并在 p53信號(hào)通路中發(fā)揮重要作用并誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,。lincRNA-p21 和 hnRNP-K（heterogenous nuclear ribonucleoprotein-K）相互結(jié)合，并介導(dǎo)下游 hnRNP-K 的轉(zhuǎn)錄抑制作用。
第三個(gè)被詳細(xì)研究的分子是 lncRNA PANDA,。lncRNA PANDA 位于 CDKN1A 基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游 5kb 處,，它的序列正好和 CDKN1A 的序列互補(bǔ)。它在 DNA 損傷引起的反應(yīng)中發(fā)揮了重要的作用,。在 DNA 發(fā)揮損傷后,，p53 激活了 CDKN1A、PANDA 和 lincRNA-p21 的轉(zhuǎn)錄,。PANDA被轉(zhuǎn)錄后,，和轉(zhuǎn)錄因子 NF-YA 相互結(jié)合并抑制凋亡。PANDA,、lincRNA-p21 和 CDNK1A 這三個(gè)基因協(xié)同作用,，最終影響了細(xì)胞周期阻滯和細(xì)胞凋亡。
（二）lncRNA 對(duì)于 mRNA 降解的調(diào)控作用
mRNA 在細(xì)胞內(nèi)的豐度往往決定了蛋白表達(dá)的高低（雖然不絕對(duì),，但是大多數(shù)情況下如此）,。而 mRNA 在細(xì)胞內(nèi)的豐度，通常有兩個(gè)方面的原因決定：
1）轉(zhuǎn)錄的多少,；
2）降解的快慢,。
其中，mRNA 的降解有多條途徑,，而 lncRNA 則參與了其中 Staufen 1 介導(dǎo)的 mRNA 降解途徑（Staufen 1-mediated mRNA decay，SMD）,。lncRNA 1/2-sbsRNA（Half-STAU1-binding site RNA）上的 Alu 元件（Alu element）能與 SMD 途徑中的靶分子上的 3'UTR 區(qū)域的 Alu 元件相互結(jié)合,，形成完整的 STAU1 （Staufen1）結(jié)合位點(diǎn)（STAU1-binding site）。這個(gè)完整的位點(diǎn)激活了STAU1,，并介導(dǎo)了 STAU 與 mRNA 結(jié)合,。這是一種全新的 mRNA 降解機(jī)制，通過(guò)誘導(dǎo)蛋白與 mRNA 結(jié)合并調(diào)控 mRNA 的降解,。
（三）lncRNA 調(diào)控蛋白翻譯
lncRNA 同樣可以直接調(diào)控蛋白的翻譯,。在小鼠模型中發(fā)現(xiàn)了一條 lncRNA，它能直接和泛素羧基端水解酶 L1（ubiquitin carboxy-terminal hydrolase L1,，UCHL1）結(jié)合,，通過(guò) SINEB2 重復(fù)序列（SINEB2 repeat）的介導(dǎo)，增加 UCHL1 的蛋白合成,。另一個(gè)例子是,，BACE-AS （一條lncRNA 分子）是 BACE1 （β-site APP cleaving enzyme1）分子的反義轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。通過(guò) BACE-AS與 BACE1 mRNA 序列的互補(bǔ)結(jié)合,，增強(qiáng)了 BACE1 mRNA 的穩(wěn)定性,，增加了 BACE1 蛋白在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)量，最終參與了阿爾斯海默癥的發(fā)生,。當(dāng)然,，lncRNA 的作用方式分類(lèi)方法有很多,，上述分類(lèi)方法是通過(guò) lncRNA 發(fā)揮的功能來(lái)進(jìn)行分類(lèi)的。同樣,，還可以根據(jù) lncRNA 的作用方式來(lái)進(jìn)行分類(lèi),。

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