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(一)lncRNA 對于細胞周期及凋亡的調控作用
有研究報道,,lncRNA 可以通過調節(jié)細胞周期和凋亡的方式,,來影響細胞的增殖。
例如,,Gas5(growth arrest-specific 5,,非編碼 RNA)在細胞周期阻滯的細胞內大量集聚。其發(fā)揮作用的機制是抑制對于糖皮質激素敏感的基因表達,,使得細胞發(fā)生凋亡,。Gas5 能與糖皮質激素受體上的“糖皮質激素反應元件"(glucocorticoid response element,GRE,,該反應元件位于糖皮質激素受體的 DNA 結合結構域內)相結合,,通過競爭性抑制的方式抑制由糖皮質激素受體誘導的 DNA 轉錄反應。
第二個例子是 lincRNA-p21(Long intergenic non-coding RNA-p21),。該分子由 p53 激活并在 p53信號通路中發(fā)揮重要作用并誘導細胞凋亡,。lincRNA-p21 和 hnRNP-K(heterogenous nuclearribonucleoprotein-K)相互結合,并介導下游 hnRNP-K 的轉錄抑制作用,。
第三個被詳細研究的分子是 lncRNA PANDA,。lncRNA PANDA 位于 CDKN1A 基因轉錄起始位點上游 5kb 處,它的序列正好和 CDKN1A 的序列互補,。它在 DNA 損傷引起的反應中發(fā)揮了重要的作用,。在 DNA 發(fā)揮損傷后,p53 激活了 CDKN1A,、PANDA 和 lincRNA-p21 的轉錄,。PANDA被轉錄后,和轉錄因子 NF-YA 相互結合并抑制凋亡,。PANDA,、lincRNA-p21 和 CDNK1A 這三個
基因協(xié)同作用,最終影響了細胞周期阻滯和細胞凋亡,。
(二)lncRNA 對于 mRNA 降解的調控作用
mRNA 在細胞內的豐度往往決定了蛋白表達的高低(雖然不絕對,,但是大多數情況下如此),。而 mRNA 在細胞內的豐度,通常有兩個方面的原因決定:
1)轉錄的多少,;
2)降解的快慢,。
其中,mRNA 的降解有多條途徑,,而 lncRNA 則參與了其中 Staufen 1 介導的 mRNA 降解途徑(Staufen 1-mediated mRNA decay,,SMD)。lncRNA 1/2-sbsRNA(Half-STAU1-binding site RNA)上的 Alu 元件(Alu element)能與 SMD 途徑中的靶分子上的 3'UTR 區(qū)域的 Alu 元件相互結合,,形成完整的 STAU1 (Staufen1)結合位點(STAU1-binding site),。這個完整的位點激活了STAU1,并介導了 STAU 與 mRNA 的結合,。這是一種全新的 mRNA 降解機制,,通過誘導蛋白與 mRNA 結合并調控 mRNA 的降解。
(三)lncRNA 調控蛋白翻譯
lncRNA 同樣可以直接調控蛋白的翻譯,。在小鼠模型中發(fā)現了一條 lncRNA,,它能直接和泛素羧基端水解酶 L1(ubiquitin carboxy-terminal hydrolase L1,UCHL1)結合,,通過 SINEB2 重復序列(SINEB2 repeat)的介導,,增加 UCHL1 的蛋白合成。另一個例子是,,BACE-AS (一條
lncRNA 分子)是 BACE1 (β-site APP cleaving enzyme1)分子的反義轉錄產物,。通過 BACE-AS與 BACE1 mRNA 序列的互補結合,增強了 BACE1 mRNA 的穩(wěn)定性,,增加了 BACE1 蛋白在細胞內的表達量,,最終參與了阿爾斯海默癥的發(fā)生。當然,,lncRNA 的作用方式分類方法有很多,,上述分類方法是通過 lncRNA 發(fā)揮的功能來進行分類的。同樣,,還可以根據 lncRNA 的作用方式來進行分類,。
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