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中級(jí)會(huì)員 | 第5年

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大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取

時(shí)間:2023/4/19閱讀:1286
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實(shí)驗(yàn)方法原理堿法提取主要是利用共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒與線(xiàn)性染色質(zhì)在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來(lái)分離它們。在堿性pH環(huán)境,,DNA變性,當(dāng)恢復(fù)中性并在高鹽離子濃度時(shí),絕大多數(shù)質(zhì)粒DNA可以準(zhǔn)確復(fù)性,,留在上清中,;而線(xiàn)性染色體DNA不能準(zhǔn)確復(fù)性,,相互交聯(lián)纏繞附著在細(xì)胞壁碎片上與蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀,。離心后獲得大量質(zhì)粒的上清液,利用親水性有機(jī)溶劑(乙醇、異丙醇,、PEG8000)使質(zhì)粒DNA脫水,,離心后收集。
實(shí)驗(yàn)材料
含質(zhì)粒的大腸桿菌
試劑,、試劑盒
葡萄糖 EDTA Tris-HCl NaOH SDS KAc 異戊醇
儀器、耗材
臺(tái)式高速離心機(jī) 恒溫振蕩搖床 高壓滅菌鍋 振蕩器 微量移液器 1.5ml離心管
實(shí)驗(yàn)步驟

一,、試劑配制


1. LB液體培養(yǎng)基,。


2. 100 mg/ml氨芐西林儲(chǔ)存液:稱(chēng)取25g的氨芐西林粉末,加去離子水至250ml,,全部溶解后過(guò)濾,、分裝,20℃保存,。


3. 溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖溶液,,25 mmoi/L Tris-鹽酸(pH 8.0),10 mmol/L EDTA(pH 8 0),。1 mol/L Tris-鹽酸(pH 8.0)12.5ml,,0 5 mol/L EDTA(pH8.0)10ml,葡萄糖4.730g,;加去離子水至500ml,,高壓滅菌,貯存于4℃,。


4. 溶液Ⅱ:0.2moI/L 氫氧化鈉溶液,,1% SDS(10 N 氫氧化鈉20 μl,10%SDS 100μl,,加去離子水至1ml),,使用前臨時(shí)配制。


5. 溶液Ⅲ(pH 4.8):5 mol/L 醋酸鉀300ml,,冰醋酸57.5ml,,加去離子水至500ml,4℃保存,。


6. 苯酚:氯仿(1:1,,V/V)(酚和氯仿均有很強(qiáng)的腐蝕性操作時(shí)應(yīng)戴手套!),。


7. 無(wú)水乙醇,。


8. 70%乙醇。


9. RNase A(20 mg/ml)溶液:100 mg RNA酶干粉加5ml超純水溶解,,然后在沸水煮


15min,,分裝,20℃保存,。


10. TE緩沖液:10 mmol/L Tris-鹽酸(pH8.0),,1 mmol/L EDTA(pH8.O),。


二、實(shí)驗(yàn)方法


1. 挑取LB固體培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的單菌落,,接種于2.0ml LB(含Amp 100 μg/ml)液體培養(yǎng)


基中,。37℃、250 r/min振蕩培養(yǎng)過(guò)夜(約12——14h),。


2. 取1.5ml細(xì)菌培養(yǎng)液倒入離心管中,,4℃、6000轉(zhuǎn)離心30s,,棄上清,,將離心管倒置于紙巾上,去除殘留液體,。


3. 菌體沉淀重懸于100μl用冰預(yù)冷的溶液Ⅰ中,,劇烈振蕩,使菌體分散混勻,,室溫下放置5 min,。


4. 加入200μl新配制的溶液Ⅱ,蓋緊管口,,快速溫和顛倒離心管5——10次,,以混勻內(nèi)容


物,冰浴5min,。


5. 加入150μl預(yù)冷的溶液Ⅲ,,蓋緊管口,溫和顛倒5——10次混勻,,冰浴3——5min,,4℃、6000轉(zhuǎn)離心5min,。轉(zhuǎn)移上清到一個(gè)新的1.5ml Ep管中,。


6. 加入等體積的酚一氯仿抽提劑,振蕩混勻,,4℃,、6000轉(zhuǎn),離心2 rain,。


7. 小心移出上清于1.5ml Ep管中,;加入2倍體積用冰預(yù)冷的無(wú)水乙醇于室溫沉淀雙鏈


DNA,混勻,,室溫放置2--5rain,,4℃、6000轉(zhuǎn)離心5min。


8. 棄上清,,將離心管倒置于紙巾上使所有液體流出,,加入1ml 70%乙醇,蓋緊離心管顛倒數(shù)次,,4℃,、6000轉(zhuǎn),離心2min,。


9. 去除所有的乙醇溶液,,將管倒置于紙巾上使液體流盡,室溫干燥5——10min,,直到乙醇都揮發(fā)干凈。


10.將質(zhì)粒DNA沉淀溶于50 μl TE緩沖液(含20 μg/ml RNaseA)中,,溫和振蕩數(shù)秒,,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>


注意事項(xiàng)1. 溶液Ⅰ與溶菌液充分搖勻,用力適當(dāng),。因?yàn)榇藭r(shí)細(xì)菌還沒(méi)有與堿和SDS作用,,染色體DNA尚未釋放,不必?fù)?dān)心其分子斷裂,,一般可用力振蕩幾次,。


2. 加入SDS后則要注意不能過(guò)分用力振蕩,溫和混勻,,但又必須讓它反應(yīng)充分,。


3. 加入溶液Ⅱ混勻之后,一定要在冰上放置,,不要搖動(dòng),,對(duì)于溶液Ⅲ同樣處理。


深圳安培生物科技有限公司,,是一家具有核心的技術(shù)實(shí)力,、壹流的經(jīng)營(yíng)管理水平和完善的市場(chǎng)銷(xiāo)售體系的生物高科技企業(yè)??偛吭O(shè)在廣東,,服務(wù)面向全國(guó)。安培生物集進(jìn)口試劑,、實(shí)驗(yàn)室耗材銷(xiāo)售,、技術(shù)服務(wù)與合約開(kāi)發(fā)為一體的專(zhuān)業(yè)化高科技公司,旨在為生命科學(xué)的發(fā)展提供壹流的產(chǎn)品與服務(wù),。本公司建立了涵蓋分子生物學(xué),、細(xì)胞生物學(xué)、免疫學(xué)、信號(hào)傳導(dǎo)和神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域的產(chǎn)品供應(yīng)線(xiàn),,在各個(gè)領(lǐng)域內(nèi)向用戶(hù)提供世界前沿水平和質(zhì)量穩(wěn)定的產(chǎn)品,,安培生物致力于為廣大的科研機(jī)構(gòu)、高等院校等優(yōu)質(zhì)客戶(hù)提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品,、技術(shù)支持與服務(wù),。


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