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熒光原位雜交技術(shù)

時間:2021/12/24閱讀:1742
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原理


用已知的標(biāo)記單鏈核酸為探針,,按照堿基互補的原則,,與待檢材料中未知的單鏈核酸進行異性結(jié)合,,形成可被檢測的雜交雙鏈核酸,。由于DNA分子在染色體上是沿著染色體縱軸呈線性排列,,因而可以探針直接與染色體進行雜交從而將特定的基因在染色體上定位。


材料與儀器

人的MyoD1(MYF3)基因探針 人外周血中期染色體細胞標(biāo)本
指甲油 甲酰胺 氯化鈉 檸檬酸鈉 氫氧化鈉 吐溫20
恒溫水浴鍋 培養(yǎng)箱 染色缸 載玻片 Nikon E-400熒光顯微鏡 蓋玻片 封口膜 200μL移液器 暗盒

步驟


1.  探針變性
 
將探針在75℃恒溫水浴中溫育5 min,,立即置0℃,,5~10 min,使雙鏈DNA探針變性,。
 
2.  標(biāo)本變性
 
(1)將制備好的染色體玻片標(biāo)本于50℃培養(yǎng)箱中烤片2~3 h,。(經(jīng)Giemsa染色的標(biāo)本需預(yù)先在固定液中退色后再烤片)。 
 
(2)取出玻片標(biāo)本,,將其浸在70~75℃的體積分數(shù)70% 甲酰胺/2x SSC的變性液中變性2~3 min,。 
 
(3)立即按順序?qū)?biāo)本經(jīng)體積分數(shù)70%、體積分數(shù)90%和體積分數(shù)100%冰乙醇系列脫水,,每次5 min,,然后空氣干燥。

3.  雜交
 
將已變性或預(yù)退火的DNA探針10 uL 滴于已變性并脫水的玻片標(biāo)本上,,蓋上18x18蓋玻片,,用Parafilm封片,置于潮濕暗盒中37℃雜交過夜(約15~17 h),。由于雜交液較少,,而且雜交溫度較高,持續(xù)時間又長,,因此為了保持標(biāo)本的濕潤狀態(tài),,此過程在濕盒中進行。
 
4.  洗脫
 
此步驟有助于除去非特異性結(jié)合的探針,,從而降低本底,。
 
(1) 雜交次日,將標(biāo)本從37℃溫箱中取出,,用刀片輕輕將蓋玻片揭掉,。 
 
(2) 將已雜交的玻片標(biāo)本放置于已預(yù)熱42~50℃的體積分數(shù)50%甲酰胺/2xSSC中洗滌3次,每次5 min,。 
 
(3) 在已預(yù)熱42~50℃的1xSSC中洗滌3次,,每次5 min。 
 
(4) 在室溫下,,將玻片標(biāo)本于2xSSC中輕洗一下,。 
 
(5) 取出玻片,,自然干燥。 
 
 (6) 取200 uL復(fù)染溶液(PI/antifade或DAPI/antifade染液)滴加在玻片標(biāo)本上,,蓋上蓋玻片,。
 
5.  雜交信號的放大(適用于使用生物素標(biāo)記的探針)
 
(1) 在玻片的雜交部位加150 uL封閉液I,用保鮮膜覆蓋,,37℃溫育20min,。 
 
(2) 去掉保鮮膜,再加150 uL avidin-FITC于標(biāo)本上,,用保鮮膜覆蓋,,37℃繼續(xù)溫育40 min。 
 
(3) 取出標(biāo)本,,將其放入已預(yù)熱42~50℃的洗脫液中洗滌3次,,每次5 min。 
 
(4) 在玻片標(biāo)本的雜交部位加150 uL封閉液II,,覆蓋保鮮膜,,37℃溫育20 min。
 
(5) 去掉保鮮膜,,加150 uL antiavidin于標(biāo)本上,,覆蓋新的保鮮膜,37℃溫育40 min,。 
 
(6) 取出標(biāo)本,,將其放入已預(yù)熱42~50℃的新洗脫液中,洗滌3次,,每次5 min,。 
 
 (7) 重復(fù)步驟(1)、(2),、(3),,再于2xSSC中室溫清洗一下。 
 
 (8) 取出玻片,,自然干燥,。 
 
 (9) 取200 uL PI/antifade染液滴加在玻片標(biāo)本上,蓋上蓋玻片,。
 
6.  封片
 
可采用不同類型的封片液,。如果封片液中不含有Mowiol(可使封片液產(chǎn)生自封閉作用),為防止蓋片與載片之間的溶液揮發(fā),,可使用指甲油將蓋片周圍封閉,。封好的玻片標(biāo)本可以在-20~-70℃的冰箱中的暗盒中保持數(shù)月之久。
 
7.  熒光顯微鏡觀察FISH結(jié)果
 
先在可見光源下找到具有細胞分裂相的視野,然后打開熒光激發(fā)光源,,F(xiàn)ITC的激發(fā)波長為490 nm,。細胞被PI染成紅色,而經(jīng)FITC標(biāo)記的探針?biāo)诘奈恢冒l(fā)出綠色熒光,。
 
所用不同熒光材料的激發(fā)光和發(fā)射光波長及濾光鏡選擇

注意事項


相關(guān)溶液的配制


1.20×SSC:175.3 g NaCl,,88.2 g檸檬酸鈉,,加水至1 000 mL(用10 mol/L NaOH調(diào)pH 至7.0),。


2.去離子甲酰胺(DF):將10 g混合床離子交換樹脂加入100 mL甲酰胺中。電磁攪拌30 min,,用Whatman l號濾紙濾,。


3.體積分數(shù)70%甲酰胺/2×SSC:35 mL甲酰胺,5 mL 20×SSC,,10 mL水,。


4.體積分數(shù)50%甲酰胺/2×SSC:100 mL甲酰胺,20 mL 20×SSC,,80 mL水,。


5.體積分數(shù)50%硫酸葡聚糖(DS):65℃水浴中融化,4℃或-20℃保存,。


6.雜交液:8 μL體積分數(shù)25%DS,,20 μL 20×SSC混合。(或40 μL體積分數(shù)50% DS,,20 μL 20×SSC,,40 μL ddH2O混合)取上述混合液50 μL,與5 μL DF混合即成,。其終濃度為體積分數(shù)10% DS,,2×SSC,體積分數(shù)50% DF,。


7.PI/antifade溶液


PI原液:先以雙蒸水配置溶液,,濃度為100 μg/mL,取出1 mL,,加39 mL雙蒸水,,使終濃度為2.5 μg/mL。Antifade原液:以PBS緩沖液配制該溶液,,使其濃度為10 mg/mL,,用0.5 mmol/L的NaHCO3調(diào)pH值為8.0。取上述溶液1 mL,,加9 mL甘油,,混勻。


PI/antifade溶液:PI與antifade原液按體積比1:9比例充分混勻,,——20℃保存?zhèn)溆谩?/p>


8.DAPI/antifade溶液:用去離子水配制1mL/mg DAPI儲存液,,按體積比1:300,,以antifade溶液稀釋成工作液。


9.封閉液I:體積分數(shù)5% BSA 3 mL,,20×SSC 1 mL,,ddH2O 1mL,Tween20 5 μL混合,。


10.封閉液II:體積分數(shù)5%  BSA 3mL,,20×SSC 1mL,goat serum 250 μL,,ddH2O 750 μL,,Tween20 5 μL混合。


11.熒光檢測試劑稀釋液:體積分數(shù)5%  BSA 1mL,,20×SSC 1mL,,ddH2O 3mL,Tween20 5μL混合,。


12.洗脫液:100 mL 20×SSC,,加水至500 mL,加Tween20 500 μL,。


常見問題


相關(guān)溶液的配制


1.20×SSC:175.3 g NaCl,,88.2 g檸檬酸鈉,加水至1 000 mL(用10 mol/L NaOH調(diào)pH 至7.0),。


2.去離子甲酰胺(DF):將10 g混合床離子交換樹脂加入100 mL甲酰胺中,。電磁攪拌30 min,用Whatman l號濾紙濾,。


3.體積分數(shù)70%甲酰胺/2×SSC:35 mL甲酰胺,,5 mL 20×SSC,10 mL水,。


4.體積分數(shù)50%甲酰胺/2×SSC:100 mL甲酰胺,,20 mL 20×SSC,80 mL水,。


5.體積分數(shù)50%硫酸葡聚糖(DS):65℃水浴中融化,,4℃或-20℃保存。


6.雜交液:8 μL體積分數(shù)25%DS,,20 μL 20×SSC混合,。(或40 μL體積分數(shù)50% DS,20 μL 20×SSC,,40 μL ddH2O混合)取上述混合液50 μL,,與5 μL DF混合即成。其終濃度為體積分數(shù)10% DS,2×SSC,,體積分數(shù)50% DF,。


7.PI/antifade溶液


PI原液:先以雙蒸水配置溶液,濃度為100 μg/mL,,取出1 mL,,加39 mL雙蒸水,使終濃度為2.5 μg/mL,。Antifade原液:以PBS緩沖液配制該溶液,,使其濃度為10 mg/mL,用0.5 mmol/L的NaHCO3調(diào)pH值為8.0,。取上述溶液1 mL,,加9 mL甘油,混勻,。


PI/antifade溶液:PI與antifade原液按體積比1:9比例充分混勻,——20℃保存?zhèn)溆谩?/p>


8.DAPI/antifade溶液:用去離子水配制1mL/mg DAPI儲存液,,按體積比1:300,,以antifade溶液稀釋成工作液。


9.封閉液I:體積分數(shù)5% BSA 3 mL,,20×SSC 1 mL,,ddH2O 1mL,Tween20 5 μL混合,。


10.封閉液II:體積分數(shù)5%  BSA 3mL,,20×SSC 1mL,goat serum 250 μL,,ddH2O 750 μL,,Tween20 5 μL混合。


11.熒光檢測試劑稀釋液:體積分數(shù)5%  BSA 1mL,,20×SSC 1mL,,ddH2O 3mL,Tween20 5μL混合,。


12.洗脫液:100 mL 20×SSC,,加水至500 mL,加Tween20 500 μL,。

熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization FISH)是一門新興的分子細胞遺傳學(xué)技術(shù),,是20世紀80年代末期在原有的放射性原位雜交技術(shù)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的一種非放射性原位雜交技術(shù)。目前這項技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于動植物基因組結(jié)構(gòu)研究,、染色體精細結(jié)構(gòu)變異分析,、病毒感染分析、人類產(chǎn)前診斷、腫瘤遺傳學(xué)和基因組進化研究待許多領(lǐng)域,。

與傳統(tǒng)的放射性標(biāo)記原位雜交相比,,熒光原位雜交具有快速、檢測信號強,、雜交特異性高和可以多重染色等特點,,因此在分子細胞遺傳學(xué)領(lǐng)域受到普遍關(guān)注。

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