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qPCR實驗結(jié)果分析基本步驟(一)

時間:2021/10/15閱讀:11239
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實時熒光定量PCR實驗會產(chǎn)生大量實驗數(shù)據(jù),,一般可以用PCR儀自帶的軟件進(jìn)行收集,、分析,。但即使有了方便可靠的軟件,,我們也需要對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行檢查,、再分析,,評估數(shù)據(jù)的質(zhì)量和可靠性。


這需要三個基本的步驟,。


第一步,,查看擴(kuò)增曲線,有必要時調(diào)整基線和閾值,。

qPCR實驗結(jié)果分析基本步驟(一)

Ct值由基線和閾值計算得來,,所以他們的值對結(jié)果影響很大。軟件會給出1個默認(rèn)的基線和閾值,,但不一定是最合適的,,需要我們進(jìn)行手動調(diào)整。

首*行基線的調(diào)整,。


一般范圍是循環(huán)數(shù)3~15,,使得靶基因的擴(kuò)增信號大于背景噪聲。出現(xiàn)不正常的擴(kuò)增曲線,,通常是因為設(shè)置了不正常的基線,,需要對單個孔進(jìn)行設(shè)置。


比較好的做法是,,基線的最小值(起始循環(huán)數(shù))設(shè)置在背景噪聲的尾巴后,,最大值(結(jié)束循環(huán)數(shù))設(shè)置為擴(kuò)增起始點。


循環(huán)范圍在5個循環(huán)就可以,,具體跟擴(kuò)增曲線的對數(shù)圖來設(shè)定,。


擴(kuò)增曲線的對數(shù)圖是什么?下期告訴你



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