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做過 Western-Blot 的童鞋知道,,分子量小于 30KDa 的蛋白分子不容易做。小分子蛋白虐我千百遍,,我待小分子蛋白如初戀,。抱怨是沒用的,想方設法解決問題才是正道,。一次又一次的調(diào)整方案,,一次又一次的徒勞無功。在此,,總結了小分子蛋白之路經(jīng)驗,,供有需求的童鞋參考。
一,、提蛋白的過程在 30 分鐘之內(nèi)完成,,提完蛋白立即加入上樣緩沖液煮沸(煮沸的時間長一點,一般 20 分鐘),,準備好蛋白樣品后立即電泳,。(小分子蛋白容易形成多聚體,這樣可以大大減少多聚體的形成),。
二,、電泳時,電泳的時間要足夠長,。習慣是先用 60-80V 電壓跑完濃縮膠,,再以 100-120V 電壓跑分離膠,溴酚藍電泳至玻璃板底部,。伯樂系列的電泳槽一般電泳 2 個小時左右,,GE 以及百晶系列的電泳槽要電泳 4 到 5 個小時。電泳時要在冰水浴中進行,。最好用 1mm 和 1.5mm 厚的膠(若用 0.75mm 厚的膠時要適當縮短轉(zhuǎn)膜時間),。
三,、轉(zhuǎn)膜時,盡量用濕轉(zhuǎn)法(半干轉(zhuǎn)也可以,,但是容易轉(zhuǎn)過),。轉(zhuǎn)膜緩沖液中,甲醇濃度要達到 20%,。PVDF 膜,,財大氣粗的土豪可以用 0.22 微米的膜。對于我們大多數(shù)窮人來說,,0.45 微米的膜也是可以的,。以下是摸索出來的轉(zhuǎn)膜時間(濕轉(zhuǎn)法,0.45 微米的膜),,供大家參考,。
四、一抗孵育因為多數(shù)小分子蛋白的表達量較少,,所以我一般孵育至少 48 個小時,,甚至孵育 72 個小時。以上方法適用于分子量在 20-30KDa 的蛋白,。若蛋白分子量小于 15KDa,,則不用 SDS-PAGE 凝 膠電泳(蛋白與 SDS 共遷移,影響分離度,,得不到很好的分離效果),,應該采用 Tris-Tricine 緩沖系統(tǒng)與 Tricine 分離膠。具體操作步驟見《精編分子生物學實驗室指南》338-340 頁(這本書每個實驗室必會備,,若沒有,,可以在孔夫子舊書市場上買一本)。
需要注意的是,,Tricine 電泳時,蛋白樣品用 Tricine 樣品緩沖液處理,,加樣前在 37-40℃沙浴中處理一個小時(不要煮沸,!不要煮沸!不要煮沸,!重要的事情說三遍),。內(nèi)槽中加滿陰極緩沖液,外槽中加滿陽極緩沖液(千萬不要加反了,。否則蛋白全部進入緩沖液?。?nbsp;
最后,,祝做小分子蛋白的童鞋實驗之路順利,,早日做出滿意的結果,。
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