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利用 shotgun 的蛋白組技術(shù)，可以實現(xiàn)對復(fù)雜樣品中大量蛋白質(zhì)的定性分析,，進而為闡明腫瘤相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用,、信號通路組成及蛋白質(zhì)亞細胞定位提供依據(jù)。
Dawson 等人發(fā)表于 2011 年《Nature》上的研究,，利用蛋白組學(xué)的方法鑒定了腫瘤發(fā)生過程中參與染色質(zhì)修飾失調(diào)的 bromodomain and extra terminal（BET）家族復(fù)合物的組成,。作者首先分離出細胞核成分，再分別以 BET 抑制劑,、Histone tails 及 BET 抗體為基質(zhì),，通過免疫沉淀或 pull down 的方法分離出 BET 各蛋白亞型及其他蛋白復(fù)合物。利用 shotgun 的方法對分離的蛋白質(zhì)進行鑒定,，作者發(fā)現(xiàn)混合系白血病融合蛋白的分子伴侶 SEC 和 PAFc 是 BET 復(fù)合物的主要成員,，并利用鑒定到的蛋白質(zhì)構(gòu)建了 BET 復(fù)合物蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)。在此基礎(chǔ)上,，作者進一步證實 BET 復(fù)合物的功能與混合系白血病有直接關(guān)系,，BET 是混合系白血 病的有效治療靶點。
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