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中級(jí)會(huì)員 | 第6年

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泛素化實(shí)驗(yàn)

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更新時(shí)間:2025-02-28 15:27:56瀏覽次數(shù):474次

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?E3連接酶篩選與驗(yàn)證?

通過(guò)酵母雙雜交,、GST Pull-down或CRISPR篩選技術(shù)發(fā)現(xiàn)候選E3酶,再通過(guò)體外/體內(nèi)泛素化實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其功能?17,。
示例:研究KRAS突變時(shí),,發(fā)現(xiàn)USP25與RNF31調(diào)控KRAS的線性泛素化修飾?1。
?泛素鏈類型分析?

利用特異性泛素抗體(如K48,、K63鏈抗體)或串聯(lián)泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域(TUBEs)區(qū)分泛素鏈連接方式?36,。
  • ?體外泛素化實(shí)驗(yàn)?

    • 使用重組表達(dá)的E1、E2,、E3酶與底物蛋白,,結(jié)合ATP、泛素分子進(jìn)行反應(yīng),,通過(guò)Western Blot檢測(cè)底物泛素化水平?26,。

    • 常用試劑盒(如Ubiquitinylation Kit)可標(biāo)準(zhǔn)化操作流程?7

  • ?體內(nèi)泛素化檢測(cè)?

    • 在細(xì)胞中過(guò)表達(dá)泛素,、E3連接酶及底物蛋白,,利用蛋白酶體抑制劑(如MG132)阻斷降解,通過(guò)免疫共沉淀(Co-IP)富集目標(biāo)蛋白后檢測(cè)泛素化信號(hào)?26,。

  • ?泛素化位點(diǎn)鑒定?

    • ?質(zhì)譜法?

      :通過(guò)富集泛素化肽段,,結(jié)合高分辨率質(zhì)譜確定具體修飾位點(diǎn)?45

    • ?點(diǎn)突變驗(yàn)證?

      :基于生物信息學(xué)預(yù)測(cè)(如UbiNet,、GPS-Uber等工具),,對(duì)潛在賴氨酸位點(diǎn)進(jìn)行突變后觀察泛素化水平變化?47


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