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　　雜交捕獲的原理是人工設(shè)計(jì)探針（DNA探針或者RNA探針）,，探針可以和目標(biāo)區(qū)段部分或者全部互補(bǔ)。將樣本和探針混合,，探針會(huì)將目標(biāo)區(qū)段捕獲,，未設(shè)計(jì)探針的區(qū)段會(huì)被洗脫丟棄，之后通過變性（一般是調(diào)節(jié)PH值到堿性）將探針和捕獲區(qū)段分開,，被捕獲的片段即可進(jìn)行二代測序文庫構(gòu)建,。

　　雜交捕獲流程介紹：

　　1、文庫制備

　　將提取后的基因組DNA利用超聲或酶切的方法將基因組DNA進(jìn)行片段化,，并進(jìn)行末端修復(fù)和接頭連接,，接著進(jìn)行PCR及純化,。

　　2,、雜交反應(yīng)

　　將帶有生物素標(biāo)記的RNA/DNA探針，對(duì)DNA文庫的目標(biāo)區(qū)域片段進(jìn)行結(jié)合（探針應(yīng)過量）,。

　　3,、鏈霉親和素磁珠結(jié)合

　　使用鏈霉親和素磁珠結(jié)合帶有生物素標(biāo)記的RNA/DNA探針與DNA文庫相結(jié)合的雙鏈復(fù)合物,。

　　4、清洗

　　利用不同鹽濃度的緩沖液進(jìn)行多次清洗,，主要目的為去除未被探針捕獲的非特異性雜交,，保留目標(biāo)區(qū)域的DNA從而達(dá)到捕獲效率的提升。

　　5,、捕獲后擴(kuò)增

　　對(duì)捕獲及清洗后的DNA產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,，構(gòu)建完成靶向富集的測序文庫。

　　雜交捕獲的優(yōu)缺點(diǎn)都是什么呢,？

　　優(yōu)點(diǎn)：捕獲區(qū)段大,，可以達(dá)到幾百M(fèi)B，遠(yuǎn)超PCR方案和MIP方案,，同時(shí)根據(jù)探針的原理其均一性很好,，均一性是評(píng)價(jià)捕獲技術(shù)很關(guān)鍵的參數(shù)，均一性好后續(xù)測序成本就會(huì)下降,。

　　缺點(diǎn)：容易捕獲非目標(biāo)片段,，造成成本增加。因?yàn)殡s交前樣本會(huì)被隨機(jī)打斷一般認(rèn)為500bp是比較合適的長度,，探針捕獲時(shí)可能和目標(biāo)片段部分雜交,，導(dǎo)致一些含有部分目標(biāo)區(qū)段的片段被捕獲。所以雜交捕獲的特異性較差,，容易捕獲非目標(biāo)區(qū)段,。