進(jìn)樣閥在進(jìn)樣過(guò)程中,，必須是非常清潔的，否則得不到較好的結(jié)果,。進(jìn)樣閥切換到進(jìn)樣位置（Inject）后,，要在此位置保持一段時(shí)間，使流動(dòng)相充分沖洗樣品定量管,，這樣可以有較高的度,，而且不用另外再?zèng)_洗樣品定量管。這種由色譜儀器控制的沖洗顯然要比手動(dòng)沖洗更好些,。注意：沖洗需要的流動(dòng)相體積至少為所進(jìn)樣品體積的10倍,。例如，如果取20μL樣品至100μL樣品定量管中,，而流動(dòng)相此時(shí)的流速為1mL/min,，則需要在進(jìn)樣位置至少保持12s，即：20μL×10/1000μL•min-1=0.2min=12s,。
當(dāng)樣品定量管經(jīng)過(guò)充分的沖洗后,，可以將旋柄轉(zhuǎn)回取樣位置（Load），也可以繼續(xù)保持在進(jìn)樣位置,，到下次取樣前才切換回取樣位置,。在切換回取樣位置時(shí)，將樣品進(jìn)樣針或微量樣品進(jìn)樣針從進(jìn)樣閥中拔出,。
為防止交叉污染,，正常情況下不必每次進(jìn)樣后都沖洗進(jìn)樣閥注射針導(dǎo)入口。進(jìn)樣閥內(nèi)根據(jù)設(shè)計(jì)的直接連接進(jìn)樣孔,，可以使注射針頭的前端直接連接到樣品定量管的末端,，沒有其他空間供樣品殘留。這樣在下一次進(jìn)樣時(shí),，就不會(huì)有上一次殘留的樣品進(jìn)入樣品定量管,。
但是在進(jìn)樣針頭插入或拔出過(guò)程中，會(huì)有痕量的樣品沉積在針頭密封區(qū)域,。精密的測(cè)定顯示這種殘留有1nL ~ 10nL,。這表明進(jìn)20μL樣品，會(huì)殘留0.005% ~ 0.05%,。每次進(jìn)樣后沖洗注射針導(dǎo)入口可以將此殘留沖洗干凈,。沖洗注射針導(dǎo)入口的過(guò)程為：設(shè)定流動(dòng)相的流速為0.1mL/min ~ 1mL/min，將注射針導(dǎo)入口沖洗頭（Rheodyne部件號(hào)7125-054）連接到一只體積相對(duì)較大的注射器上,，用的流動(dòng)相只在進(jìn)樣位置清洗注射針導(dǎo)入口,。這樣進(jìn)入進(jìn)樣閥中的液體繞過(guò)樣品定量管由樣品溢出管5#口排出。這一過(guò)程可以將注射針導(dǎo)入口,、引導(dǎo)管,、注射針導(dǎo)入管和注射針密封圈清洗。而采用注射器插入式的沖洗方式,，則不能全部清洗上述部分的表面,。在取樣位置將注射針插入注射針導(dǎo)入口時(shí)，針頭推動(dòng)注射針密封圈內(nèi)少量樣品液體（上一次沖洗注射針導(dǎo)入管留下的）進(jìn)入樣品定量管,。當(dāng)該樣品液體與所用的流動(dòng)相組成不同,，且同時(shí)采用部分充滿定量管進(jìn)樣方式時(shí)，在高靈敏度的檢測(cè)器上可能出現(xiàn)怪峰,。所以沖洗注射針時(shí)用流動(dòng)相沖洗,。
如果已發(fā)現(xiàn)有嚴(yán)重的交叉污染現(xiàn)象，請(qǐng)檢查是否有下列原因造成：
1.使用的注射針頭長(zhǎng)度不夠（針頭的長(zhǎng)度至少要5cm）,，注射針末端不能到達(dá)定子表面,。
2.注射針沒有充分插入注射針導(dǎo)入口。
3.注射針導(dǎo)入口內(nèi)的污染物或針頭密封磨損下來(lái)的削片,，使注射針頭末端不能接觸定子表面,。
如果不考慮交叉污染，每進(jìn)樣10次或20次沖洗一下注射針導(dǎo)入口,，這樣可以注射針導(dǎo)入管內(nèi)充滿流體,。在注射針插入或拔出的過(guò)程中，清洗注射針頭或稀釋污染這一區(qū)域的樣品的同時(shí)也使注射針導(dǎo)入口和樣品溢出5# 口充滿流體,，從而防止空氣進(jìn)入樣品管,。