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初級(jí)會(huì)員 | 第6年

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彗星實(shí)驗(yàn):一起來看“彗星雨”

時(shí)間:2019/11/5閱讀:1213
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彗星實(shí)驗(yàn)(Comet assay)也被稱為單細(xì)胞凝膠電泳實(shí)驗(yàn)(Single cell gel electrophoresis,,SCGE),是一種在單細(xì)胞水平上檢測(cè)DNA損傷的技術(shù),。當(dāng)各種內(nèi)源性和外源性 DNA 損傷因子誘發(fā)細(xì)胞 DNA 鏈斷裂時(shí),,其超螺旋結(jié)構(gòu)受到破壞,,在細(xì)胞裂解液作用下,細(xì)胞膜,、核膜等膜結(jié)構(gòu)受到破壞,,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì),、RNA 以及其他成分均擴(kuò)散到電解液中,,而核DNA由于分子量太大不能進(jìn)入凝膠而留在原位,。電泳過程中,如果DNA沒有損傷,,則將停留在原位,,染色后呈圓形的熒光團(tuán),無拖尾出現(xiàn),。如果DNA受損,,斷裂的碎片進(jìn)入到凝膠中,在電場(chǎng)的作用下,,DNA碎片離開原位向陽(yáng)極遷移,,形成拖尾。DNA受損越嚴(yán)重,,斷裂越多,,產(chǎn)生的碎片就越多、越小,,則向陽(yáng)極遷移的DNA碎片量就越多,,遷移距離也越長(zhǎng),熒光染色后就能看見“彗星”樣尾長(zhǎng)并且熒光強(qiáng)度增強(qiáng),。

目前有兩種常見的彗星實(shí)驗(yàn)檢測(cè)方式——堿性處理&中性處理,。在堿性處理?xiàng)l件下,DNA發(fā)生變性,,因而可檢測(cè)包括單鏈及雙鏈斷裂在內(nèi)的所有DNA 損傷,;在中性處理?xiàng)l件下,DNA 維持雙鏈構(gòu)象,,因而僅可以檢測(cè)雙鏈斷裂,。

實(shí)驗(yàn)大體流程如下:

1. 制備單細(xì)胞懸浮液,在 37℃ 條件下,,懸浮液與低熔點(diǎn)瓊脂糖(LM瓊脂糖)混合,;

2. 將瓊脂糖、細(xì)胞混合物涂布在預(yù)處理的載玻片上,;

3. 4℃條件下用裂解液處理30-60min或過夜,,裂解液由去垢劑及高鹽溶液組成,可去除多余的細(xì)胞膜及組蛋白,;

4. 將載玻片浸入電泳溶液中,;

5. 進(jìn)行凝膠電泳,隨后,,中和載玻片,,待LM瓊脂糖*干燥后,用熒光染料染色,,并于熒光顯微鏡下觀察DNA損傷程度,。

注:常用的熒光染料是SYBR Gold,,但熒光染料的觀察需要熒光顯微鏡。如果選擇銀染,,使用標(biāo)準(zhǔn)的光學(xué)顯微鏡觀察即可,。

圖片處理

在拍照時(shí)以tif格式保存圖片,然后用CASP彗星分析軟件分析,,如下圖是軟件打開的界面?

接下來?導(dǎo)入圖片,,用白色畫框選中要分析的區(qū)域。下圖中的“調(diào)整”項(xiàng)可以調(diào)整畫框的位置以包含整個(gè)細(xì)胞,,開始分析前要點(diǎn)擊“開始”,,然后點(diǎn)“分析”,再點(diǎn)“保存”,,這樣一張圖的數(shù)據(jù)就分析完了,,數(shù)據(jù)會(huì)保存在系統(tǒng)里。點(diǎn)擊“翻頁(yè)”可以繼續(xù)分析下一張圖,。

分析完所有圖片后導(dǎo)出數(shù)據(jù)到Excel表格,,保留TailDNA%(尾部DNA百分含量),TailLength(尾長(zhǎng)),,TailMoment(尾矩)三列數(shù)據(jù),。根據(jù)細(xì)胞尾部的DNA百分含量(即TailDNA%),將采集的細(xì)胞圖像分為5級(jí):彗星尾部熒光強(qiáng)度(TailDNA%)占總強(qiáng)度為0-6%是0級(jí),;6.1%-17.0%是1級(jí),;17.1%-35.0%是2級(jí);35.1%-60.0%是3級(jí),;60.1%-100.0%是4級(jí),。

彗星率等于彗星細(xì)胞數(shù)目(除去0級(jí)細(xì)胞)占總細(xì)胞數(shù)目的百分比。任意值等于各等級(jí)細(xì)胞的百分比與其對(duì)應(yīng)的級(jí)別號(hào)的乘積之和,,它可以綜合反映細(xì)胞的DNA損傷情況,。后,綜合分析Tail DNA%,、Tail length,、Tail moment、彗星率和任意值,,共5個(gè)指標(biāo)比較細(xì)胞的DNA損傷程度,。

Trevigen作為一家專注于開發(fā)細(xì)胞凋亡、DNA損傷和修復(fù),、腫瘤細(xì)胞功能與行為等相關(guān)研究產(chǎn)品的美國(guó)生物技術(shù)公司,,擁有彗星實(shí)驗(yàn)全線產(chǎn)品:

Trevigen是一家快速成長(zhǎng)的美國(guó)生物技術(shù)公司,專注于細(xì)胞凋亡、DNA損傷和修復(fù),、腫瘤細(xì)胞功能與行為等方面研究的腫瘤研究產(chǎn)品和服務(wù),。作為 Trevigen在中國(guó)區(qū)域的總代理,艾美捷與Trevigen一道為中國(guó)的科研工作者提供超好的氧化應(yīng)激,、細(xì)胞損傷和腫瘤細(xì)胞行為研究等領(lǐng)域內(nèi)的 產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù)。

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