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ICDD&束蘊儀器丨探索新冠*藥,,我們在行動

閱讀:1685      發(fā)布時間:2020-7-22
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衍射數(shù)據(jù)中心(ICDD)解析出一種可用于治療新冠肺炎COVID-19的潛在藥物Atazanavir的晶體結構。

 

隨著新冠病毒的蔓延,,*醫(yī)學研究人員都在努力尋找用于治療新冠肺炎的*藥,,Atazanavir(阿扎那韋,C38 H52 N6 O7)是一種能夠有效治療SARS-CoV-2病毒的藥物,。相關研究表明,,Atazanavir有可能對抗新冠病毒COVID-19也具有一定的療效,。2015年,,ICDD-PDF數(shù)據(jù)庫收錄了Atazanavir粉末衍射圖及二維分子式(見PDF No. 00-065-1426),,并于2017年修正了該物相的F因子。

 

僅僅知悉藥物的二維分子式,,對于研究藥物對抗病毒的機理,,還遠遠不夠,迫切需要解析Atazanavir的晶體結構,,來深入研究該藥物對抗新冠病毒的療效顯得尤為重要,。近ICDD執(zhí)行主席Thomas Blanton 、PDF數(shù)據(jù)庫編輯Amy Gindhart和其合作者伊利諾伊理工學院的James Kaduk基于PDF卡片數(shù)據(jù)庫中出版的Atazanavir標準衍射卡片,,共同解析出了室溫下Atazanavir的晶體結構,,為醫(yī)學工作者研究新冠病毒COVID-19的治療方案提供了巨大的幫助,極大的推進了探索Atazanavir治療新冠病毒的可行性,。

采用同步輻射的方法,,收集了純相的Atazanavir的衍射圖,基于Rietveld精修理論,,使用JADE(ICDD-MDI)軟件對其進行了指標化,,Atazanavir屬于單斜晶系,空間群為P21,,晶胞參數(shù)為a = 15.331, b = 5.902, c = 21.562 ?, β = 96.3°; 原胞體積為1939.3 ?3,。

 

采用密度泛函理論(Densityfunctional theoryDFT),,對Atazanavir的晶體結構能量計算進而優(yōu)化晶體結構,,以尋求優(yōu)的晶體結構。同時結合Rietveld精修的結果,,對Atazanavir晶體結構進行解析,。下圖為Rietveld精修和DFT理論優(yōu)化的Atazanavir晶體結構的對比,相關的均方根約為0.077 ,。

 

進一步,,解析出Atazanavir的三維結構如下圖所示:


 

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