產(chǎn)品介紹

細菌基因組測序，可分為細菌基因組de novo測序和細菌基因組重測序兩類,。細菌基因組de novo測序，即從頭測序是指不需要任何現(xiàn)有的序列信息就可以對某個細菌物種進行測序，利用生物信息學分析手段對序列進行拼裝,，從而獲得該細菌物種的基因組序列。細菌基因組重測序是對已有參考序列（Reference Sequence）的物種的不同個體進行基因組測序,，并以此為基礎(chǔ)進行個體或群體水平的差異性分析,。可關(guān)注大量的單核苷酸多態(tài)性位點（SNP）,、插入缺失（InDel, Insertion/Deletion）,、結(jié)構(gòu)變異（Structure Variation，SV）等變異信息,。細菌基因組測序可以預測重要基因和蛋白以了解其功能和可能機制,，已取代傳統(tǒng)方法成為研究細菌進化遺傳機制,、關(guān)鍵功能基因的重要工具。

根據(jù)不同的研究目的和需求,，細菌基因組測序可具體分為以下產(chǎn)品： 
細菌重測序
構(gòu)建小片段文庫,，深度測序，基于已知參考基因組關(guān)注基因組變異情況（包括SNP和InDel等）,，可進行群體研究,。 
細菌denovo測序
細菌框架圖：構(gòu)建小片段文庫，采用高深度測序（100X）和初級的基因組從頭組裝策略,，可滿足細菌基因組研究的基礎(chǔ)需求,。 
細菌精細圖：構(gòu)建大片段和小片段文庫，采用高深度測序（150X）和針對性的基因組從頭組裝策略,，是目前細菌基因組研究的主導產(chǎn)品,。 
細菌完成圖：根據(jù)待測菌株具體情況量身定制*策略，構(gòu)建不同大小片段及類型文庫,，綜合利用多種高通量測序技術(shù)及組裝技術(shù),，終組裝得到一條完整的基因組序列（1 Contig，0 gap）,，是細菌基因組測序從頭組裝的高標準,。 
流程圖

結(jié)果示例

案例分析
案例：耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）全基因組測序揭示其傳播機制及系統(tǒng)發(fā)育 
Genome sequencing defines phylogeny and spread of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a high transmission setting. Genome Res. 2015 January; 25(1): 111–118.

耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）是一種常見的引發(fā)醫(yī)院內(nèi)感染的致病菌，本研究對泰國東北部一家醫(yī)院分離出的79株菌進行了全基因組測序,，繪制了該菌的系統(tǒng)發(fā)育樹,，并發(fā)現(xiàn)了多個不同進化支，據(jù)此推理出感染病人之間的MRAS傳播途徑,。
技術(shù)參數(shù)

樣品要求

服務(wù)流程

1、提交項目課題相關(guān)需求和資料,。

2,、與我們的專業(yè)技術(shù)團隊討論項目細節(jié)。

3,、根據(jù)討論后的意見對實驗方案進行修改,。

4、雙方均滿意并達成一致,，簽訂技術(shù)服務(wù)合同,。

5、開展實驗,，按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容,。

6、結(jié)題,，提供實驗原始結(jié)果和分析結(jié)果,、實驗流程,、實驗條件等等。

我們的優(yōu)勢

1,、適用于單細胞,、微量細胞樣品。

2,、數(shù)據(jù)質(zhì)量高,、偏差小、高度均一,。

3,、高通量，單個樣本可達30-100X的測序深度和數(shù)據(jù)產(chǎn)出量,。

4,、*的覆蓋度，能檢測到90%以上的SNP位點信息,。

5,、檢測靈敏度和準確度高。

6,、能夠全面發(fā)掘新的和稀有的遺傳變異

咨詢與訂購

感謝您選擇我們的服務(wù),，如果您有任何問題，請聯(lián)系我們,，我們將竭誠為您解答和服務(wù),。