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北京百奧創(chuàng)新科技有限公司

全外顯子組測序服務

時間:2019-2-20 閱讀:3190
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產品介紹
全外顯子組測序(Whole Exome Sequencing,,WES)是利用探針雜交富集蛋白編碼區(qū)域DNA序列,,通過高通量測序,,發(fā)現(xiàn)與蛋白質功能變異相關的遺傳突變,。研究顯示:人類全外顯子組只占人類全基因組長度的1%左右,,由DNA變異引起的疾病大致有80%以上來自于外顯子組區(qū)域的變異,,因此全外顯子測序遠比全基因組測序(Whole Genome Sequencing,WGS)更簡便,、經(jīng)濟、,,其目標區(qū)域覆蓋度也更高,,便于變異檢測。

檢測流程

1,、樣本采集,,提取基因組DNA。

2,、將基因組DNA打斷,,構建隨機片段文庫。

3,、文庫純化,,然后通過外顯子捕獲系統(tǒng)進行雜交富集。

4,、PCR擴增,,qPCR質量檢測,。

5、上機進行高通量測序,。

6,、數(shù)據(jù)分析,。

信息分析流程 

 

信息分析內容 

1,、去除接頭污染和低質量數(shù)據(jù)。 

2,、進行數(shù)據(jù)產量統(tǒng)計分析,、測序深度分析、覆蓋度均一性分析,。 

3,、SNP、Indel變異信息檢測,。

4,、SNP、indel的RefGene注釋,。

5,、SNP、Indel數(shù)據(jù)庫分析 (與dbSNP,、千人基因組數(shù)據(jù),、ESP外顯子組數(shù)據(jù)庫、炎黃基因組數(shù)據(jù)進行數(shù)據(jù)庫注釋分析) ,。

6,、單樣品SNP保守性預測、致病性分析 (SIFT,、Polyphen-2,、Phylop、GERP scores),。

7,、SNP、InDel在各基因功能元件上的分布統(tǒng)計,。

樣本要求

1,、基因組DNA:Illumina:DNA濃度≥20 ng/μl,總量≥6 μg,,OD 260/280介于1.8-2.0之間,,電泳檢測無明顯RNA條帶,基因組條帶清晰,、完整,。樣品濃度越高越好,。

2、血液樣品:請使用專業(yè)抗凝管儲存樣品,。哺乳動物血液提供>2ml,,有細胞核的血液>500ul。

3,、樣品中有多糖,、糖蛋白的殘留,往往對打斷DNA樣品帶來非常大的麻煩,,且很難去除,,因此特別要求,客戶提供的樣品一定要將多糖或糖蛋白去除干凈,。

4,、樣品保存期間切忌反復凍融。

服務流程

1,、提交項目課題相關需求和資料,。

2、與我們的專業(yè)技術團隊討論項目細節(jié),。

3,、根據(jù)討論后的意見對實驗方案進行修改。

4,、雙方均滿意并達成一致,,簽訂技術服務合同。

5,、開展實驗,,按期完成合同規(guī)定的內容。

6,、結題,,提供實驗原始結果和分析結果、實驗流程,、實驗條件等等,。

我們的優(yōu)勢

1、適用于單細胞,、微量細胞樣品,。

2、數(shù)據(jù)質量高,、偏差小,、高度均一。

3、高通量,,單個樣本可達30-100X的測序深度和數(shù)據(jù)產出量,。

4、*的覆蓋度,,能檢測到90%以上的SNP位點信息,。

5、檢測靈敏度和準確度高,。

6,、能夠全面發(fā)掘新的和稀有的遺傳變異

咨詢與訂購

感謝您選擇我們的服務,如果您有任何問題,,請聯(lián)系我們,,我們將竭誠為您解答和服務,。

 

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