2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系用戶需自備的試劑:cDNA 或 DNA 模板,、引物,、ROX Reference Dye/ROX Reference Dye II。
請按照不同品牌熒光定量PCR儀的使用說明書要求進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作,。
操作示例:分別以20 µ l和50 µ l PCR反應(yīng)體系為例:
1. PCR 反應(yīng)體系的建立:
組分 | 20ul體系 | 50ul體系 |
DNA模板 | 1ul | 1ul |
正向引物(10uM) | 0.5ul | 1ul |
反向引物(10uM) | 0.5ul | 1ul |
2×RealStar Green Fast Mixture | 10ul | 25ul |
ROX Reference Dye/ROX Reference Dye II | 0.4ul | 1ul |
RNase-free H2O | 補(bǔ)足至20ul | 補(bǔ)足至50ul |
*模板量: 10-100 ng基因組DNA,,或 1-10 ng cDNA 為參照,因不同物種的模板中含有的目的基因拷貝數(shù)不同,,可對模板進(jìn)行梯度稀釋,,以確定最佳的模板使用量。 另外,, Two Step RT-PCR 反應(yīng)的cDNA( RT 反應(yīng)液)作為模板時(shí)的添加量不要超過 PCR 反應(yīng)液總體積的10% ,。
*引物:通常引物濃度以 0.2 μM 可以得到較好結(jié)果,可以終濃度 0.1-1.0 μM 作為設(shè)定范圍的參考,。擴(kuò)增效率不高的情況下,可提高引物的濃度,;發(fā)生非特異性反應(yīng)時(shí),,可降低引物濃度,由此優(yōu)化反應(yīng)體系,。為了獲得理想的 qPCR 的效果,,擴(kuò)增片段的長度建議為 80-200 bp 。
*不同儀器所需 ROX Reference Dye不同,,或需要添加或不需要添加,,請根據(jù)儀器說明進(jìn)行操作。
2,。PCR 反應(yīng)條件的設(shè)置: 本制品中使用的HotStart Taq DNA Polymerase是利用抗Taq抗體封閉的HotStart DNA聚合酶,,如果在PCR反應(yīng) 前進(jìn)行模板的預(yù)變性,通常設(shè)定為95℃、2 min,,復(fù)雜或高GC模板適當(dāng)延長時(shí)間至5 min,。該DNA聚合酶在15 s內(nèi)可完成至 少300 bp的擴(kuò)增,可以滿足絕大多數(shù)的qPCR實(shí)驗(yàn),;對于超過350 bp或者高GC含量的擴(kuò)增子,,建議增加延伸時(shí)間至60 s或者 采用三步法以提高擴(kuò)增效率。
兩步法 PCR 擴(kuò)增標(biāo)準(zhǔn)程序: |
預(yù)變性 | 95℃ | 2min |
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變性 | 95℃ | 15s | 40 Cycles
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退火/延伸 | 60℃ | 15-30s |
溶解曲線(儀器自動設(shè)置) |
三步法 PCR 擴(kuò)增程序: |
預(yù)變性 | 95℃ | 2min |
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變性 | 95℃ | 15s | 40 Cycles
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退火 | 60℃ | 15-30s |
延伸 | 72℃ | 30s |
溶解曲線(儀器自動設(shè)置) |
注 : 以上舉例為常規(guī) qPCR
反應(yīng)系統(tǒng),,僅供參考,。實(shí)際反應(yīng)條件因模板、引物等的結(jié)構(gòu)不同而各異 ,, 需根據(jù)模板,、引物、目的片段的特點(diǎn)設(shè)定最佳反應(yīng)條件,,并根據(jù)比例放大或縮小反應(yīng)體系,。
3. 在相應(yīng)的 real time PCR 儀器上完成實(shí)驗(yàn),并分析結(jié)果,。