微生物組是指一個(gè)特定環(huán)境或生態(tài)系統(tǒng)中全部微生物及其遺傳信息,。這些微生物主要括細(xì)菌,、古菌、原生動(dòng)物,、真菌和病毒等,。微生物廣泛分布于我們生活的環(huán)境中,通過(guò)復(fù)雜的相互作用表現(xiàn)出生態(tài)系統(tǒng)功能,。目前微生物研究非?;馃幔饕婕暗胶Q?、河流,、土壤等環(huán)境和個(gè)體的口腔、腸道,、皮膚,、生殖道等部位的微生物研究。近年來(lái),,人體共生微生物和宿主健康,、疾病聯(lián)系密切相關(guān),,特別是微生物與心腦血管疾病、免疫類疾病,、代謝類疾病,、抑郁癥、自閉癥,、阿爾茲海默癥,、腫瘤的關(guān)聯(lián)研究日益火熱。
今天給大家分享一篇加州理工學(xué)院Gil Sharon等人在《Cell》雜志上發(fā)表的題為《Human Gut Microbiota from Autism Spectrum Disorder Promote Behavioral Symptoms in Mice》的研究性文章,,IF:31.398,。該研究通過(guò)從患有自閉癥兒童和正常兒童的糞便中分離培養(yǎng)功能性細(xì)菌,移植到小鼠腸道中構(gòu)建出具有穩(wěn)定擬人腸道微環(huán)境的動(dòng)物模型,,揭示腸道細(xì)菌會(huì)直接促進(jìn)小鼠的自閉癥行為發(fā)生,,為治療自閉癥等典型神經(jīng)疾病指明了潛在新方向。
研究背景:
自閉癥(ASD)表現(xiàn)為復(fù)雜的人類行為改變,,包括社會(huì)溝通和刻板印象,。除了遺傳的不同外,腸道微生物在正常發(fā)育(TD)和ASD個(gè)體之間也存在差異,,但是微生物群是否與癥狀相關(guān)目前還不清楚,。
研究材料:
無(wú)菌(GF)雄性和雌性小鼠;自閉癥癥狀小鼠,;BTBR T+ tf/J (BTBR)小鼠模型,;正常發(fā)育(TD)兒童、自閉癥患者(ASD)兒童糞便,。
研究技術(shù):
16s rDNA分析,、非靶代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究
Highlights:
1)攜帶人類ASD而非TD的小鼠,,其微生物群表現(xiàn)出類似ASD的行為,;
2)ASD和TD微生物群在小鼠中產(chǎn)生了不同的代謝組譜;
3)攜帶ASD微生物群的小鼠大腦中風(fēng)險(xiǎn)基因存在廣泛選擇性剪接,,而接受5AV或?;撬嶂委煹腂TBR小鼠的重復(fù)和社交行為得到改善。
研究結(jié)果:
1,、來(lái)自ASD個(gè)體的腸道微生物群足以使小鼠行為改變
本研究首先要測(cè)試人類微生物群是否在功能上促進(jìn)了小鼠的ASD行為,。選擇人類TD和ASD供者的糞便樣本并移植到GF野生型小鼠腸道中,對(duì)其及其后代進(jìn)行行為學(xué)分析,。結(jié)果顯示移植ASD患者糞便的小鼠重復(fù)行為增加,,運(yùn)動(dòng)減少,交流減少,,表現(xiàn)出明顯的自閉癥癥狀,。
移植ASD微生物的小鼠可再現(xiàn)人類自閉行為
2,、TD和ASD移植小鼠不同微生物種群導(dǎo)致了行為的不同
對(duì)ASD患者、ASD小鼠及其后代的腸道菌群進(jìn)行系統(tǒng)分析,,發(fā)現(xiàn)ASD患者及ASD小鼠的腸道菌群與對(duì)照組均有明顯差異,且這種差異是可以垂直傳遞給子代小鼠,。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)特定類型的腸道菌群(Bacteroides,、Parabacteroides、Eisenbergiela tayi)是引起ASD的關(guān)鍵,。
毛縷菌科,、擬桿菌科和擬副桿菌科在TD和ASD后代微生物組中含量不同
3、ASD微生物群可促進(jìn)大腦中ASD相關(guān)基因的廣泛選擇性剪接
社會(huì)行為是由包括前額葉皮層(PFC)和紋狀體(STR)在內(nèi)的多個(gè)大腦區(qū)域介導(dǎo)的,,突觸功能障礙和異常的發(fā)育軌跡可能會(huì)導(dǎo)致重復(fù)行為的增加,。通過(guò)大規(guī)模分析,研究者比較了TD和ASD個(gè)體大腦中表達(dá)的各種基因和非編碼RNA的差異表達(dá),,結(jié)果顯示差異表達(dá)的基因較少,。深入研究ASD大腦是否表現(xiàn)出選擇性剪接(AS)的差異模式(這是人類ASD大腦中發(fā)現(xiàn)的一種特征),檢測(cè)ASD相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)基因,,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有569個(gè)基因的可變剪接發(fā)生明顯改變(神經(jīng)元中高表達(dá)),,其中有52種基因是自閉癥相關(guān)基因。
微生物組影響小鼠大腦中ASD基因的表達(dá)和選擇性剪接
4,、TD,、ASD移植小鼠的微生物產(chǎn)生了代謝產(chǎn)物
大腦中的基因表達(dá)、剪接和神經(jīng)元功能可以通過(guò)小分子代謝物進(jìn)行調(diào)節(jié),。代謝組改變與自閉癥譜系障礙有關(guān),。因此對(duì)oTD和oASD小鼠的結(jié)腸內(nèi)容物和相應(yīng)的血清進(jìn)行了非靶向代謝組學(xué)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)oASD小鼠的結(jié)腸內(nèi)容物中有27種與oTD小鼠有顯著差異,,抑制γ -氨基丁酸(GABA)和甘氨酸受體的幾種激動(dòng)劑和拮抗劑存在差異,,具體來(lái)說(shuō),5-氨基戊酸(5AV)和?;撬嵩趏ASD小鼠中顯著降低,。后期對(duì)代謝過(guò)程進(jìn)行功能預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn):對(duì)照組小鼠腸道中L-脯氨酸和或反式-4-羥基-L-脯氨酸最終產(chǎn)生了5AV;而ASD小鼠腸道中最后生成了谷氨酸,。
oTD和oASD微生物組對(duì)小鼠結(jié)腸和血清代謝組的影響
宏基因組分析證實(shí)oASD小鼠氨基酸代謝缺乏
5,、調(diào)控ASD小鼠代謝物可改善ASD樣行為
腸道內(nèi)的微生物代謝物會(huì)影響神經(jīng)系統(tǒng)的預(yù)后,為了測(cè)試5AV和?;撬崾欠駥?duì)小鼠行為有影響,,作者通過(guò)Spearman相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)多種代謝物含量與小鼠模型的行為學(xué)異常存在相關(guān)性包括?;撬岷?AV,,可能保護(hù)小鼠不發(fā)生ASD樣行為,。后期通過(guò)采用BTBR T+ tf/J (BTBR)小鼠模型,當(dāng)BTBR小鼠自受孕開(kāi)始口服?;撬峄?AV至成年,,其重復(fù)性行為均明顯減少,而社交行為明顯增加,。最后通過(guò)電生理和鈣成像實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),,5AV能降低BTBR小鼠前額皮質(zhì)中的神經(jīng)元興奮性。
微生物代謝物影響B(tài)TBR小鼠模型的行為和腦生理
微生物研究思路
Absin微生物研究產(chǎn)品解決方案:
分類 | 貨號(hào) | 產(chǎn)品名稱 | 描述 |
| abs9268 | RNA樣品保存液 | 適用于動(dòng)物的組織和細(xì)胞樣本 |
核酸純化 | abs60028 | 植物RNA快速提取試劑盒(含DNase Ⅰ) | 50-100mg植物組織樣本高效RNA純化 |
abs60010 | 廣譜植物基因組DNA快速提取試劑盒 | 100mg新鮮或20mg干燥的植物樣品DNA提取 | |
abs60016 | 細(xì)菌基因組DNA快速提取試劑盒 | 細(xì)菌培養(yǎng)液1-5mL的DNA提取 | |
abs60022 | 唾液基因組DNA快速提取試劑盒 | 唾液DNA提取,,內(nèi)含carrier RNA助力微量核酸洗脫 | |
abs60173 | 土壤基因組DNA提取試劑盒 | 500mg土壤樣本DNA提取,,適合多種土壤樣本 | |
abs60352 | 水體基因組DNA提取試劑盒 | 水體樣本DNA純化,最多克達(dá)到4L | |
abs60288 | 拭子RNA提取試劑盒 | 口腔拭子,、泌尿生殖道拭子,、痰液等樣本RNA提取 | |
abs60287 | 拭子DNA提取試劑盒 | 口腔拭子、泌尿生殖道拭子,、痰液等樣本DNA提取 | |
abs60292 | 尿液RNA提取試劑盒 | 1-5mL尿液樣本RNA純化,,無(wú)需酚氯仿提取 | |
abs60291 | 尿液DNA提取試劑盒 | 1-5mL尿液樣本DNA純化,無(wú)需酚氯仿提取 | |
abs60011 | 快捷型植物基因組DNA提取試劑盒 | 從植物干粉或新鮮植物樣品進(jìn)行DNA提取 | |
abs60017 | 酵母基因組DNA快速提取試劑盒 | 酵母培養(yǎng)物DNA提取 | |
abs60290 | 糞便RNA提取試劑盒 | 200mg糞便RNA純化,,去除抑制劑,,獲得高純度RNA | |
abs60289 | 糞便DNA提取試劑盒 | 200mg糞便DNA純化,去除抑制劑,,獲得高純度DNA | |
abs60030 | 病毒基因組DNA/RNA快速提取試劑盒 | 200uL體液樣本病毒核酸提取,, | |
PCR(RT-PCR) | abs60246 | 逆轉(zhuǎn)錄一管化三代預(yù)混液 | 一步法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒 |
abs601510 | First-strand cDNA Synthesis Mix With gDNA Remover | 經(jīng)典逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,去除殘留gDNA | |
abs60074 | One-Step RT-PCR Kit | 一步法RT-PCR試劑盒 | |
abs60036 | 2×Taq PCR Mix | Taq酶,,內(nèi)含紅色染料 | |
abs60034 | 2×Xerox PCR Master Mix | 高保真酶,,保真度是普通Taq酶的60倍 | |
abs60037 | 2×Taq PCR Master Mix(for PAGE) | Taq酶 for PAGE,適合微量樣本 | |
qPCR | abs601511 | 2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系 | 染料法qPCR預(yù)混液 |
abs601512 | 2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系(高濃度ROX) | ||
abs601513 | 2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系(低濃度ROX) | ||
abs60305 | 探針?lè)晒舛縋CR試劑盒 | 探針?lè)╭PCR預(yù)混液 | |
abs60306 | UDG探針?lè)晒舛縋CR試劑盒(防污染系統(tǒng)) | UDG防污染系統(tǒng),,可高效消減氣溶膠對(duì)PCR檢測(cè)的污染 | |
abs60307 | 探針?lè)ǔ?jí)多重?zé)晒舛縋CR試劑盒 | 探針?lè)ǘ嘀豍CR預(yù)混液 | |
abs60308 | UDG多重探針?lè)晒舛縋CR試劑盒(防污染系統(tǒng)) | 探針?lè)ǘ嘀豍CR預(yù)混液,,UDG防污染系統(tǒng) |
參考文獻(xiàn)
[1] Sharon G, Cruz NJ, Kang DW, et al. Human Gut Microbiota from Autism Spectrum Disorder Promote Behavioral Symptoms in Mice.Cell. 2019;177(6):1600-1618.e17. doi:10.1016/j.cell.2019.05.004
Absin產(chǎn)品線:
爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC,、凋亡,、ELISA、ChIP,、Co-IP,、TR-FRET、生化檢測(cè),、殘留檢測(cè),、多因子檢測(cè));細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子),、分化試劑盒,;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝,;輔助試劑,、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...
特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE,、B27,、N2、霍亂毒素B亞單位CTB,、牛腦垂體提取物BPE,、百日咳毒素PTX,、重組人胰島素Insulin,、人源低密度脂蛋白LDL...
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