信使 RNA (mRNA) 等外源性分子介導(dǎo)的生物療法,,其應(yīng)用面臨的一個(gè)主要障礙就是其免疫原性,因?yàn)轶w外合成的 mRNA 具有較高的免疫原性,,可能會(huì)誘發(fā)大量炎癥反應(yīng),,不僅無(wú)法取得預(yù)期的治療效果,還會(huì)引起強(qiáng)大的副作用,。關(guān)于如何降低體外合成mRNA分子的免疫原性,,在過(guò)去的十幾年中,科學(xué)家們進(jìn)行了大量相關(guān)研究,,其中,,較為重要的發(fā)現(xiàn)之一就是多種修飾核苷酸,而含有各種修飾核苷酸的 mRNA,,如假尿苷和N-6-甲基腺苷,,可以有效降低mRNA的免疫原性,抑制先天免疫激活,,使 mRNA可能成為再生醫(yī)學(xué),、疾病治療和細(xì)胞重編程的有力工具。
迄今為止,,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證的多種核苷酸化學(xué)修飾策略可以降低免疫原性而不影響其翻譯特性,,例如將天然腺苷替換為N1-甲基腺苷(m1A)或N6-甲基腺苷(m6A);替換天然胞嘧啶核苷為5-甲基胞嘧啶核苷(m5C),;以及將天然尿苷替換為5-甲氧基尿苷(5moU),,假尿苷(ψ)或N1-甲基假尿苷(m1ψ)等。其中,,m5C和ψ備受關(guān)注,,因?yàn)闊o(wú)論是體內(nèi)還是體外都表明,它們?cè)谟行Ы档蚼RNA免疫原性的同時(shí),,也顯著提高了其翻譯效率,。
圖1:mRNA的化學(xué)修飾匯總[1]
一、核苷酸修飾簡(jiǎn)介
1,、Pseudo-UTP (Ψ)
假尿苷(Pseudouridine)是RNA上豐富的修飾核苷,,又被稱為RNA的“第五種核苷"。mRNA 假尿嘧啶化修飾的過(guò)程是由假尿嘧啶合成酶進(jìn)行催化,,讓尿嘧啶核苷酸(U)化學(xué)結(jié)構(gòu)發(fā)生改變,,形成假尿嘧啶核苷酸,。已有的研究表明,mRNA 的假尿嘧啶化修飾主要有三個(gè)功能:改變密碼子,、增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄本穩(wěn)定性和應(yīng)激反應(yīng)應(yīng)答,。2005年,Katalin Karikó等人發(fā)現(xiàn)將假尿苷引入RNA中能降低其免疫原性,,并且RNA的免疫原性隨著假尿苷引入比例的增高而降低[2],。2008年,Katalin Karikó等人還發(fā)現(xiàn)用假尿苷*替代尿苷的mRNA不僅能極大地降低mRNA的免疫原性,,還能提高mRNA的穩(wěn)定性并增強(qiáng)其翻譯能力[3],。
2、N1-Methylpseudo-UTP (mΨ)
N1-methyl-pseudouridine 是一種甲基假尿苷,,通過(guò)增加核糖體密度,,mRNA 中的 N1-methyl-pseudouridine 以 eIF2α 依賴性和獨(dú)立機(jī)制增強(qiáng)翻譯。2015年,,Oliwia Andries等人發(fā)現(xiàn)用N1-甲基假尿苷*替代尿苷比用假尿苷*替代尿苷更能降低mRNA的免疫原性,,且更能增強(qiáng)mRNA的蛋白表達(dá)能力[4]。
3,、N6-Methyl-ATP(m6A)
早在 20 世紀(jì) 70 年代,,科學(xué)家們就在 RNA 中發(fā)現(xiàn)了 m6A 修飾,但其功能則由于技術(shù)制約一直未能被很好的揭示,。直到 2012 年,,科學(xué)家們的研究表明,m6A 修飾和mRNA 的穩(wěn)定性,、剪接加工,、翻譯以及 microRNA 的加工有關(guān)[5,6]。 2018年,,Shinichiro Akichikade等人還發(fā)現(xiàn)在5'-加帽的mRNA帽子上含有92% 的m6Am和8%的Am,,可促進(jìn)mRNA的翻譯[7]。
4,、5-Methyl-CTP (5mC)
在 mRNA 中,,m5C 修飾連同多種效應(yīng)酶,例如 NOP2/Sun RNA 甲基轉(zhuǎn)移酶 2 (NSUN2),、NSUN6,38 tRNA 天冬氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶 1 (TRDMT1) 和 Aly/REF 輸出因子 (ALYREF),,執(zhí)行多種功能, 包括促進(jìn) mRNA 核胞質(zhì)運(yùn)輸,;病毒蛋白表達(dá),; DNA損傷修復(fù);mRNA 穩(wěn)定性;細(xì)胞耐受性,、增殖和遷移,;干細(xì)胞的發(fā)育、分化和重編程,; mRNA 剪接的調(diào)控[8],。此外,,m5C的分布因細(xì)胞類型而異,。在mRNA的特定位置上的m5C修飾表現(xiàn)出不同的調(diào)控活性:它們可以促進(jìn)或抑制翻譯[9]。
5,、5-Methoxy-UTP(5moU)
5-甲氧基尿苷(5moU) 是一種罕見的核苷,,存在于tRNA中。它由β- D-核糖尿嘧啶(糖)和核堿基 5-甲氧基尿嘧啶組成,,是尿苷的衍生物,。RNA (mRNA) 中加入 5-甲氧基尿苷可以降低所得mRNA 的免疫原性。2022年,,Hanieh Moradian等人發(fā)現(xiàn)尿苷的化學(xué)修飾,,特別是5moU,顯示出高水平的蛋白質(zhì)產(chǎn)生,,而對(duì)炎性巨噬細(xì)胞反應(yīng)的誘導(dǎo)可忽略不計(jì)[10],。
二、核苷酸修飾應(yīng)用案例
圖2:mRNA的化學(xué)修飾能夠顯著改善表達(dá),,但因細(xì)胞類型和編碼序列而異[1]
核苷酸修飾類型 | 功能/應(yīng)用 |
Ψ,、mΨ[11] | 用N1-甲基假尿苷*替代尿苷比用假尿苷*替代尿苷更能降低mRNA的免疫原性,且更能增強(qiáng)mRNA的蛋白表達(dá)能力 |
mΨ[12,13] | Moderna 疫苗(mRNA-1273)和BioNTech 疫苗(BNT162b) |
m6A,、Ψ,、mΨ、2FdU,、5mC,、5hmC、5moC和2 2FdC[14] | 與未修飾的 mRNA 相比,,具有修飾核苷酸的每種 mRNA 減少了 IFN-β 的產(chǎn)生, 逃避或抑制先天性免疫信號(hào) |
ψ,、mψ、5mC/ψ,、5hmC/5mU 和 5moC/5mU[15] | 五種修飾的FLuc mRNA(ψ,、mψ、5mC/ψ,、5hmC/5mU 和 5moC/5mU-FLuc mRNA)顯著優(yōu)于未修飾的 FLuc mRNA 的活性,。 |
Mψ、5moU、ψ[16] | mRNA的化學(xué)修飾能夠顯著改善蛋白質(zhì)表達(dá),,這取決于細(xì)胞類型和編碼序列,。具有mψ、5moU和ψ修飾的eGFP mRNAs在測(cè)試的細(xì)胞系中表達(dá)前三,。5moU 修飾的 eGFP mRNA 比其他 eGFP mRNA更穩(wěn)定,。 |
愛必信提供以下幾種修飾核苷酸
修飾堿基 | 類型 | 特點(diǎn) |
假尿苷(Pseudo-UTP;Ψ),、 | 提高mRNA的穩(wěn)定性,、提升翻譯效率、降低免疫原性 | |
N1-甲基-假尿苷(N1-Methylpseudo-UTP) | ||
5-甲基-胞苷三磷酸 (5-Methyl-CTP) | ||
5-甲氧基-尿苷三磷酸(5-Methoxy-UTP) | ||
N6-甲基-腺苷三磷酸(m6A,N6-Methyl-ATP) |
修飾核苷酸產(chǎn)品列表
貨號(hào) | 名稱 | 規(guī)格 |
abs60188 | 5-甲氧基-CTP鋰鹽溶液 | 10μL/50μL/1mL |
abs60169 | 5-甲氧基-UTP鈉鹽溶液 | 10μL/50μL/1mL |
abs60189 | 5-甲氧基-UTP鋰鹽溶液 | 10μL/50μL/1mL |
abs60168 | 5-甲基-CTP鈉鹽溶液 | 10μL/50μL/1mL |
abs60159 | ATP Sodium salt solution(100 mM) | 1ml×3 |
abs60163 | CTP Sodium salt solution(100 mM) | 1ml×3 |
abs60164 | GTP Sodium salt solution(100 mM) | 1ml×3 |
abs60165 | UTP Sodium salt solution(100mM) | 1ml×3 |
abs60186 | N1-甲基-假尿苷三磷酸四鋰鹽溶液/N1-Methyl-Pseudo-UTP | 10ul/50ul/1mL |
abs60156 | N1-甲基-假尿苷三磷酸四鈉鹽溶液/N1-Methyl-Pseudo-UTP | 10ul/50ul/1mL |
abs60187 | N6-甲基-ATP鋰鹽溶液 | 10ul/50ul |
abs60158 | NTP 鈉鹽混合溶液(含ATP,、CTP,、GTP、UTP) | 1ml×3 |
abs60185 | 假尿苷三磷酸四鋰鹽溶液/Pseudo-UTP, lithium salt solution | 10ul/50ul/1ml |
abs60155 | 假尿苷三磷酸四鈉鹽溶液/Pseudo-UTP, Sodium salt solution | 10ul/50ul/1ml |
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