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北京普天同創(chuàng)生物科技有限公司

研究揭示不依賴DNA相互作用的轉錄激活機制

時間:2019-12-26 閱讀:1398
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12月18日,,eLife雜志在線發(fā)表了中國科學院分子植物科學創(chuàng)新中心/植物生理生態(tài)研究所張余研究組、趙國屏研究組,,上??萍即髮W楊貝研究組和浙江大學馮鈺研究組合作的題為Crlactivatestranscriptionbystabilizingactiveconformationofthemasterstresstranscriptioninitiationfactor的研究論文,論文介紹了一種特殊的不依賴DNA相互作用而激活轉錄的分子機制,。

轉錄調控是細菌應對環(huán)境脅迫,、病原菌緩解抗生素壓力的重要手段,。轉錄調控由細菌的轉錄核心機器RNA聚合酶和一整套轉錄起始σ因子共同完成,。細菌看家σ因子(如大腸桿菌的σ70)負責大多數(shù)的基因表達,而在環(huán)境脅迫下,,σS則占據(jù)主導,。Crl是協(xié)助σS實現(xiàn)基因表達程序快速轉換的關鍵蛋白,然而其轉錄激活分子機制尚不清楚,。

該研究解析了E.coliCrl轉錄激活復合物的3.8埃的冷凍電鏡結構,。該復合物包括了E.coli的RNA聚合酶、轉錄起始因子σS、Crl以及啟動子DNA,。在該結構中,,Crl與σS的domain2相互作用,同時還與RNA聚合酶的大亞基β’相互作用,。不同于傳統(tǒng)的絕大多數(shù)轉錄激活因子,,電鏡結構顯示Crl不結合啟動子DNA,因此從結構本身很難解釋Crl對于σS-RNAP的轉錄促進活性,。隨后,,該研究利用氫氘交換質譜(HDX-MS)的方法,發(fā)現(xiàn)在溶液狀態(tài)下,,Crl結合到σS之后,,能夠穩(wěn)定σS的多個結構單元,而這些結構單元直接參與了σS與RNA聚合酶以及σS與DNA的相互作用,?;谝陨蠑?shù)據(jù),作者提出了Crl特異性結合轉錄起始因子σS,,穩(wěn)定σS的活性構象,,從而促進σS與RNA聚合酶的組裝以及σS與啟動子DNA的結合,進而激活σS-RNAP介導的轉錄,。該工作呈現(xiàn)了一種新的轉錄因子與RNA聚合酶的結合方式,,揭示了一種新的細菌轉錄激活分子機制。

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