蛋白酶K來源于林伯氏白色念球菌（Tritirachium album Limber）,，是一種與枯草桿菌蛋白酶相關的絲氨酸蛋白酶,。由于它能降解角蛋白（keratin），因此被命名為蛋白酶K,。它是一種高活性的廣譜蛋白酶,，在變性劑尿素或十二烷基磺酸鈉（sodium dodecyl sulfonate，SDS）溶液中依然能保持較高酶活力,，所以被廣泛應用于各種生物材料中的DNA或RNA的提取,。
蛋白酶K的性質從這三個方面介紹：
一、分子結構
蛋白酶K由一條肽鏈組成,，包含277個氨基酸殘基,，相對分子質量為28 930?；钚圆课挥蒁39,、H69和S224組成，底物識別位點主要為G100-Y104和S132-G136兩個片段,。蛋白酶K的氨基酸序列與枯草芽孢桿菌蛋白酶具有高度同源性,，因此被劃分為枯草芽孢桿菌蛋白酶類。蛋白酶K包含兩個二硫鍵（C34-C124,，C179-C248）,，兩個色氨酸殘基（W8，W212）和一個游離半胱氨酸（C73）,。X射線晶體學研究表明,，蛋白酶K的三維結構為一個明確的球形折疊。蛋白酶K屬于α/β類蛋白質,，包含6個α-螺旋,，15個β-折疊和一個3/10螺旋。
二,、熒光性
蛋白酶K在295 nm處被激發(fā),，它的熒光性由兩個色氨酸殘基W8和W212決定。但是,，兩個色氨酸的光反應活性表現(xiàn)不同,，W212要活潑得多。在pH 3～9范圍內,，色氨酸熒光量子產率恒定,。對已激發(fā)的色氨酸進行熱力滅活時，活化能需達到54 kJ/mol,。這個值大幅地高于來自微生物的其他蛋白酶,，因此可用來解釋蛋白酶K較高的熱穩(wěn)定性,。
三、酶學性質
蛋白酶K具有很高的切割活性,，底物識別位點能和底物組成一個3股的反平行β片層,，可催化脂肪族氨基酸和芳香族氨基酸的羧基端肽鍵斷裂。α-螺旋是保持蛋白酶K活性中心構象穩(wěn)定性的主要結構,。α-螺旋共包含90個氨基酸殘基,，占殘基總數(shù)的1/3，大部分殘基處在伸展的β-折疊結構中,。這使得整個分子有序度低,，變性熵不大，比變性焓值極低,，反映了酶穩(wěn)定性的本質,。分子中兩個二硫鍵及兩個Ca2+也對三級結構的熱穩(wěn)定性有貢獻。pH,、溫度,、Ca2+、激活劑和抑制劑等是影響蛋白酶K活力的主要因素,。
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