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一,、自噬誘導劑  

(1) Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin ：模擬內質網(wǎng)應激

(2) Carbamazepine/ L-690，330/ Lithium Chloride（氯化鋰）：IMPase抑制劑（即Inositol monophosphatase,，肌醇單磷酸酶）

(3) Earle's平衡鹽溶液：制造饑餓

(4) N-Acetyl-D-sphingosine（C2-ceramide）：Class I PI3K Pathway抑制劑

(5) Rapamycin：mTOR抑制劑

(6) Xestospongin B/C：IP3R阻滯劑

二、自噬抑制劑  

(1) 3-Methyladenine（3-MA）：（Class III PI3K） hVps34 抑制劑

(2) Bafilomycin A1：質子泵抑制劑

(3) Hydroxychloroquine（羥氯喹）：Lysosomal lumen alkalizer（溶酶體腔堿化劑）

除了選用上述工具藥外,，一般還需結合遺傳學技術對自噬相關基因進行干預：包括反義RNA干擾技術（Knockdown）,、突變株篩選、外源基因導入等,。

三,、自噬過程進行觀察和檢測 

細胞經(jīng)誘導或抑制后，需對自噬過程進行觀察和檢測,，常用的策略和技術有：

1,、觀察自噬體的形成

由于自噬體屬于亞細胞結構，普通光鏡下看不到,，因此,，直接觀察自噬體需在透射電鏡下。phagophore的特征為：新月狀或杯狀,，雙層或多層膜,，有包繞胞漿成分的趨勢。自噬體（**1）的特征為：雙層或多層膜的液泡狀結構,，內含胞漿成分,，如線粒體、內質網(wǎng),、核糖體等,。自噬溶酶體（**2）的特征為：單層膜，胞漿成分已降解,。（autophagic vacuole,，**）

2、在熒光顯微鏡下采用GFP-LC3融合蛋白來示蹤自噬形成

由于電鏡耗時長,，不利于監(jiān)測（Monitoring）自噬形成,，人們利用LC3在自噬形成過程中發(fā)生聚集的現(xiàn)象開發(fā)出了此技術。無自噬時,，GFP-LC3融合蛋白彌散在胞漿中,；自噬形成時，GFP-LC3融合蛋白轉位至自噬體膜，在熒光顯微鏡下形成多個明亮的綠色熒光斑點,，一個斑點相當于一個自噬體,，可以通過計數(shù)來評價自噬活性的高低。

3,、利用Western Blot檢測LC3-II/I比值的變化以評價自噬形成

自噬形成時,，胞漿型LC3（即LC3-I）會酶解掉一小段多肽，轉變?yōu)椋ㄗ允审w）膜型（即LC3-II）,，因此,，LC3-II/I比值的大小可估計自噬水平的高低。

（注意：LC3抗體對LC3-II有更高的親和力,，會造成假陽性,。方法2和3需結合使用，同時需考慮溶酶體活性的影響,。）

4,、檢測長壽蛋白的批量降解：非特異

5、MDC（Monodansylcadaverine,，單丹磺酰尸胺）染色：包括自噬體,，所有酸性液泡都被染色，故屬于非特異性的,。

6,、CellTrackerTM Green染色：主要用于雙染色，但其能染所有的液泡,，故也屬于非特異性的,。

四、自噬相關蛋白的定位 

在研究自噬相關蛋白時,，需對其進行定位,。由于自噬體與溶酶體、線粒體,、內質網(wǎng),、高爾基體關系密切，為了區(qū)別,，常用到一些示蹤蛋白在熒光顯微鏡下來共定位：

Lamp-2：溶酶體膜蛋白,，可用于監(jiān)測自噬體與溶酶體融合。

LysoTrackerTM 探針：有紅或藍色可選,，顯示所有酸性液泡。

pDsRed2-mito：載體,，轉染后表達一個融合蛋白（紅色熒光蛋白+線粒體基質定位信號）,，可用來檢測線粒體被自噬掉的程度（Mitophagy）。

MitoTraker探針：特異性顯示活的線粒體，熒光在經(jīng)過固定后還能保留,。

Hsp60：定位與線粒體基質,，細胞死亡時不會被釋放。

Calreticulin（鈣網(wǎng)織蛋白）：內質網(wǎng)腔

（注意：這些蛋白均為胞漿蛋白,，爬片或胰酶消化的細胞在做免疫熒光前需先透膜（permeablize）,，可采用0.1%SDS處理。）