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流式實(shí)驗(yàn)中的抗體滴定

閱讀:5914        發(fā)布時(shí)間:2019-7-16

一般我們購(gòu)買商品化的primary antibody的時(shí)候,,抗體的說(shuō)明書中都會(huì)給我們一個(gè)推薦的抗體使用濃度,。這個(gè)濃度在一定程度上來(lái)說(shuō),,是過飽和的,,可以滿足大多數(shù)實(shí)驗(yàn)的染色需求,。

但是因?yàn)槭沁^飽和的濃度,這就帶來(lái)了一定程度的抗體浪費(fèi),。而過量的抗體,,也會(huì)大大提高樣本的自發(fā)熒光,。

 

 

 

從另一個(gè)角度來(lái)看,,因?yàn)閺S家給出的推薦濃度都是基于一個(gè)特定的樣本濃度和樣本體積,所以在一些特殊的實(shí)驗(yàn)中,,比如樣本濃度或樣本體積過大的實(shí)驗(yàn),,推薦的濃度就無(wú)法達(dá)到飽和滴加的要求。在這樣的前提下,,推薦實(shí)驗(yàn)用戶針對(duì)自己的實(shí)驗(yàn)要求,,zui好可以對(duì)抗體進(jìn)行滴定,。節(jié)約成本的同時(shí),也可以讓自己的實(shí)驗(yàn)更加,。

滴定的原則:

1. 在進(jìn)行滴定實(shí)驗(yàn)前,,應(yīng)該遵守一個(gè)實(shí)驗(yàn)一個(gè)變量的原則。既然滴定實(shí)驗(yàn)要求的是摸索出準(zhǔn)確的抗體工作濃度,,那在制作樣本前,,也需要對(duì)其他的實(shí)驗(yàn)條件進(jìn)行統(tǒng)一。而這些在滴定實(shí)驗(yàn)中的條件,,也應(yīng)該沿用到后續(xù)的正式實(shí)驗(yàn)中去,。

2. 需要統(tǒng)一的條件:樣本,樣本數(shù)量/管,,樣本體積/管,,孵育條件等??偟膩?lái)說(shuō),,一個(gè)成功的滴定實(shí)驗(yàn),只應(yīng)該有“抗體的終濃度不同”這一個(gè)實(shí)驗(yàn)中的變量,。

3. 滴定的稀釋倍數(shù):一般按照5倍稀釋的標(biāo)準(zhǔn)做5個(gè)梯度的原則做滴定實(shí)驗(yàn),。也可根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。起點(diǎn)濃度的選擇則需要按照具體的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行分析,。比如,,對(duì)于PBMC或者裂解后的全血、脾臟之類的樣本,,活細(xì)胞比例高,,單管樣本一般以1*10^6為上限??梢詮耐扑]用量開始,,往下5倍稀釋,做5個(gè)梯度,。但是有些原代細(xì)胞,,比如涉及腫瘤免疫方面的樣本,活細(xì)胞比例低,,免疫細(xì)胞的浸潤(rùn)比例低,,所以制備的樣本數(shù)量也會(huì)比較大,這個(gè)時(shí)候,,也可以選擇超過推薦的濃度滴加,,然后再進(jìn)行梯度稀釋。

4. 滴定實(shí)驗(yàn)完成后,通過計(jì)算染色指數(shù)(stain Index)確定zui佳抗體濃度,。染色指數(shù)公式如下:

 

 

 

示例:

我們以anti-human CD3抗體舉例:在100ul全血樣本中,,我們以該抗體推薦的用量5ul/tube 為高濃度,5倍稀釋,,并設(shè)置5個(gè)梯度,。高濃度至低濃度分別是5ul/100ul blood,1ul/100ul blood,,0.2ul/100ul blood,,0.04ul/100ul blood,0.008ul/100ul blood,。通過計(jì)算,,染色指數(shù)由高濃度到低分別為98.57,106.29,,96.97,,12.36,8.58,。從染色指數(shù)上看,,我們挑選出zui優(yōu)的抗體濃度為1ul/100ul blood。即為推薦用量的1/5,。

 

 

 

 

用第三方軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)疊加可以一目了然,。

 

 

注意事項(xiàng):

1. 對(duì)于一些陽(yáng)性表達(dá)幾乎100%的細(xì)胞,比如PBMC中的CD45,可以在樣本染色后少量加入未染色的細(xì)胞,。

2. 對(duì)于表達(dá)量比較少的稀有細(xì)胞群體,,在染色時(shí),可加入該群細(xì)胞的父級(jí)細(xì)胞群的抗體,。在設(shè)計(jì)多色實(shí)驗(yàn)的滴定時(shí),,zui好可以分批滴定。將表達(dá)量高的抗體先進(jìn)行滴定,。確定zui佳濃度后,,再滴定表達(dá)量少的抗體,并將已經(jīng)滴定好的抗體一同加入,。比如我們?cè)诘味ㄍ庵苎械膄oxp3時(shí),,zui好可以加入已經(jīng)確定好濃度的CD4抗體。

3. 對(duì)于消化的組織來(lái)說(shuō),,因?yàn)榇嬖诖罅康乃兰?xì)胞,,所以在這些樣本的滴定過程中,要先加入死活染料區(qū)分死活,,再確定目標(biāo)抗體的濃度,。

4. 是否需要在滴定前blocking?取決于正式實(shí)驗(yàn),。如果正式實(shí)驗(yàn)是封閉的,,那么滴定實(shí)驗(yàn)也需要。

5. 遇到不同廠家,,不同貨號(hào),,不同克隆號(hào)的抗體,需要重新滴定,。

6. 滴定完成后,,理論上只要cat號(hào)一致,lot號(hào)不一致,,不需要重新滴定,。但是為了保險(xiǎn)起見,每一瓶抗體,,特別是不同lot的抗體,,zui好留一個(gè)樣本的抗體量,以方便日后的QC或者實(shí)驗(yàn)復(fù)盤,。

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