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ChIP-seq染色質(zhì)圖譜檢測(cè)方法的局限性及改善方式

時(shí)間：2023/4/7閱讀：559
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ChIP-seq是最-廣泛使用的染色質(zhì)圖譜檢測(cè)方法，但有很大的局限性,，具體表現(xiàn)為：

1.高細(xì)胞需求量,；

2.低吞吐量；

3.技術(shù)困難；

4.高成本，深度測(cè)序；

5.數(shù)據(jù)質(zhì)量差,，變量大


CUT&RUN和CUT&Tag檢測(cè)法正在取代ChIP-seq

簡(jiǎn)化的工作流程跳過(guò)了ChIP-seq實(shí)驗(yàn)法中的挑戰(zhàn)性步驟，包括染色質(zhì)片段化和抗體pull down,，用更少的細(xì)胞和測(cè)序讀數(shù)得到更佳的數(shù)據(jù),。

ChIP-seq染色質(zhì)圖譜檢測(cè)方法的局限性及改善方式

具體變現(xiàn)為：

1.低細(xì)胞需求量；

2.高吞吐量,；

3.操作流程更簡(jiǎn)易,；

4.低成本，測(cè)序讀取次數(shù)更少,；

5.數(shù)據(jù)質(zhì)量可靠,，重復(fù)性好



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