試劑驅(qū)動系統(tǒng)
一般地，DNA 合成儀采用一定壓力的惰性氣體（氬氣）或氮氣及電磁閥組驅(qū)動液體試劑,，也可采用氦氣驅(qū)動試劑,。某些合成儀采用slider block滑塊系統(tǒng)及精密蠕動泵，可不采用氣體為驅(qū)動系統(tǒng),。采用氣體及電磁閥驅(qū)動液體試劑時,，需首先將管路系統(tǒng)電磁閥前段，含試劑瓶組中壓力加壓到規(guī)定氣壓,，通過合成管理軟件或手動打開電磁閥（一般打開時間為數(shù)ms）,，即可驅(qū)動液體試劑到所需的合成柱中。
試劑和堿基瓶組
DNA合成儀一般需堿基瓶組及試劑瓶組,。試劑瓶組一般zui少為6個,，含脫保護劑（Deb）、活化劑（act）,、蓋帽試劑A（capA),、蓋帽試劑B(capB)、氧化劑（OXI）及洗脫乙腈（ACN）,，每種儀器一般都多設(shè)置1-2個試劑瓶位,，用于特殊產(chǎn)物的合成。堿基瓶組一般zui少為4個標(biāo)準(zhǔn)堿基（A/C/G/T）,同時搭配2-多個特殊堿基瓶位,，用于熒光標(biāo)記等合成,。
壓力管路及輸送管路
DNA 合成儀的一般原則需要保持內(nèi)外氣體隔絕，因此無論試劑瓶,、堿基瓶均需密封保持一定壓力,。所有壓力管路目前均采用特氟龍導(dǎo)管，直徑為1/16—1/8吋,。
每個瓶子都有一個氬氣壓力管道及輸送管道進入瓶蓋插塞,，對于亞磷酰胺，1—8號瓶其壓力管道也作為排氣管,。氬氣管要保持在液體水平以上,，而輸送管卻伸到瓶的底部。當(dāng)閥門正確設(shè)置打開時,，儲液瓶上部空間由氬氣加壓,，液體被推進輸送管，流到其目的地,。
亞磷酰胺瓶排氣
除了加壓外,，亞磷酰胺瓶都是用壓力排氣管排氣的。把亞磷酰胺放人儀器前,，要用氬氣排除空氣使其凈化,。凈化是通過輸送管輸送氣體，當(dāng)氣體輸送到瓶內(nèi)時,，空氣經(jīng)壓力排氣管排出,。這是由瓶子更換步驟自動完成的。廢液瓶是輸送系統(tǒng)的低壓側(cè),，必須將出口與大氣相通,。要確保排氣管通到通風(fēng)柜。如果排氣管阻塞,，將會產(chǎn)生反壓,，試劑和溶劑的輸送會受到抑制。
輸送電磁閥
試劑輸送系統(tǒng)包括兩個試劑閥塊(8堿基儀器有3個)及2個或4個柱閥塊,。閥塊控制氣體和化學(xué)試劑流人柱子及出口,。除亞磷酰胺和四唑以外，試劑和溶劑都被同時輸送到所有活化柱,。當(dāng)有多個活化柱時,，對流速的細微變化，以自動調(diào)節(jié)每個柱子的輸送次數(shù)來補償,。每一個5—端口柱閥塊將流出物導(dǎo)人廢液口,、DMT收集口，或DNA收集瓶,，它也控制用于除去或沖洗柱內(nèi)和柱閥塊內(nèi)的試劑的氬氣,。
輔助真空
對于閥塊的適當(dāng)運行，關(guān)鍵是隔膜形成一個圓頂小空隙,，每次電磁閥打開時,，抽氣泵為每個閥塊提供了輔助真空,，輔助真空在隔膜的螺線管一側(cè)形成，使隔膜形成一圓頂空隙,。
合成柱
起始結(jié)合在載體（一般為CPG）上的核苷酸是裝在一次性的柱子中,，除柱體外，還有2個固定過濾板和2個接頭,，所有的部件都由惰性材料制成,。固定過濾板是多孑L性聚苯乙烯固定在兩端蓋子中。人口和出口都是母路厄氏(1uer)接頭,，與儀器的公路厄氏接頭配對,。柱子是對稱的(沒有頂端和底部、前后之分),，可以以任何方式與公路厄氏接頭相連接,。每一個柱子都用顏色編號，表示不同的起始核苷酸,，以及有一個*的連續(xù)順序號碼,。正常的流路是從底部進入，通過向上輸送液體,，使CPG顆粒上升并保持懸浮狀態(tài),。溶劑和試劑的流速已經(jīng)設(shè)置好，能使顆粒適當(dāng)?shù)鼗旌稀?/div>
路節(jié)流閥
試劑通過底部的luer接頭,，流到柱子,，如果沒擰上下面的一個luer接頭，應(yīng)會在一個圓柱形的玻璃流路節(jié)流閥上發(fā)現(xiàn),。試劑通過流路節(jié)流閥中一個很小的通道流到柱子,。小量的試劑可以在流路節(jié)流閥中結(jié)晶，長期這樣會造成流路阻塞,。
廢液和排氣
大多數(shù)化學(xué)試劑輸送的zui終點是廢液瓶,，廢液瓶是一個空立著的10L的聚苯乙烯容器，可放在合成儀附近的地板上或放在低于儀器的附近工作臺上,。排氣管將廢氣導(dǎo)人適當(dāng)?shù)呐艢庋b置,，如排煙罩
電導(dǎo)池
電導(dǎo)流動池是為了測定在每個DNA合成循環(huán)內(nèi)釋放的DMT陽離子的總電導(dǎo)而設(shè)計的。流動池是由一空隙隔開的兩個電極組成,，在空隙之間應(yīng)用一小電壓,。DMT陽離子流過電導(dǎo)池時起電導(dǎo)作用。
(十一)電池
DNA合成儀一般帶有鋰電池,，可以使用幾年,。當(dāng)主電源斷開時，所有的合成參數(shù)都被保留下來。這些參數(shù)包括儲存的DNA序列,，用戶設(shè)定的循環(huán),、步驟和功能，以及瓶子使用資料等,。如果正在合成中電源出現(xiàn)故障,，合成將被中斷,，只有主電源恢復(fù)時合成才可重新開始,。電池還保持合成儀內(nèi)部的時鐘計時。
(十二)控制器
控制器指導(dǎo)和初始合成儀的所有活動,，它的主要部分是軟件,、微處理機、顯示屏幕,、鍵板及相關(guān)的電子部件,。軟件控制合成的所有必要操作并由微處理機來解釋和執(zhí)行。軟件儲存在一個可取出的存儲卡中,，這個存儲卡插在儀器的背面,。合成信息顯示在液晶顯示屏上，通過選擇鍵板上的鍵可與儀器交流,。軟件是“菜單驅(qū)動”,，通過按適當(dāng)?shù)逆I，可選擇一項,，給予指令,。為了完成自動合成，軟件應(yīng)用一個包含一系列步驟的循環(huán)來完成全部化學(xué)反應(yīng),。
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