如何選擇基因敲除動物模型制備技術(shù)?
動物模型是現(xiàn)代生命科學(xué)研究的重要工具,,特別是基因工程小鼠和大鼠,,在基因功能研究、人類生理病理機制研究及新藥研發(fā)中起著不可替代的作用,。近幾年來,,制 備動物模型的基因修飾技術(shù)層出不窮,這不僅包括傳統(tǒng)ES打靶,、TALEN,、CRISPR/Cas9, 還有TetraOne基因敲除新技術(shù),。如此繁 多的技術(shù)該如何選擇,?本文將對這四種技術(shù)的原理、特點,、缺陷及未來發(fā)展趨勢作系統(tǒng)的介紹和對比,。
1、傳統(tǒng)ES打靶基因敲除——成熟,、修飾準確,、效果穩(wěn)定,但制作周期長達一年
基于胚胎干細胞(ES)的同源重組技術(shù)俗稱“傳統(tǒng)的基因打靶技術(shù)”,。因具有技術(shù)成熟,、修飾準確、效果穩(wěn)定等優(yōu)點而受到眾多科學(xué)家*,,此外,,世 界上所有重要的的基因敲除小鼠模型均通過此技術(shù)制備。盡管新興核酸酶修飾技術(shù)如ZFN,、TALEN,、CRISPR/Cas9等相繼出現(xiàn),但基于ES細胞的 同源重組技術(shù)依然是*可以滿足所有基因組修飾要求的技術(shù),。
基因打靶就是通過同源重組技術(shù)將外源基因定點整合進靶細胞基因組上某一確定的位點,,以達到定點修飾改造染色體上某一基因的目的?;虼虬屑夹g(shù)目前已 被廣泛認為是一種理想的特定修飾與改造生物體遺傳物質(zhì)的*方法,,其中包括了多種不同的基因敲除和敲入系統(tǒng),特別是條件性和誘導(dǎo)性基因打靶系統(tǒng)的建立,,使 得對基因在時間和空間上的靶位修飾更加明確,、效果更加可靠。但其存在周期長的缺陷,,通常制作周期10-12個月,。
2、TALEN基因敲除——周期短,,但存在馬賽克現(xiàn)象和脫靶現(xiàn)象
TALEN技術(shù)是一種新的分子生物學(xué)工具,。科學(xué)家發(fā)現(xiàn),,來自一種植物細菌的TAL蛋白的核酸結(jié)合域的氨基酸序列與其靶位點的核酸序列有恒定的對應(yīng)關(guān) 系,。利用TAL的序列模塊,可組裝成特異結(jié)合任意DNA序列的模塊化蛋白,,從而達到靶向操作內(nèi)源性基因的目的,,它克服了ZFN方法不能識別任意目標(biāo)基因序 列,以及識別序列經(jīng)常受上下游序列影響等問題,,且具有ZFN相等或更好的靈活性,,使基因操作變得更加簡單方便。但因為脫靶的問題,,利用TALEN技術(shù)進行 小鼠的基因修飾仍然無法取代傳統(tǒng)技術(shù),。加上存在馬賽克現(xiàn)象,所以在做基因敲入(KI)和其他應(yīng)用時候也必須謹慎的進行檢測,。
3,、CRISPR/Cas9基因敲除——周期短,但存在馬賽克現(xiàn)象和脫靶現(xiàn)象
CRISPR/Cas9(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) 是出現(xiàn)的一種由RNA指導(dǎo)Cas核酸酶對靶向基因進行特定DNA修飾的技術(shù),。 CRISPR是細菌和古細菌為應(yīng)對病毒和質(zhì)粒不斷攻擊而演化來的獲得性 免疫防御機制,。在這一系統(tǒng)中,crRNA(CRISPR-derived RNA)通過堿基配對與tracrRNA(trans- activating RNA)結(jié)合形成雙鏈RNA,,此tracrRNA/crRNA二元復(fù)合體指導(dǎo)Cas9蛋白在crRNA引導(dǎo)序列靶定位點剪切雙鏈 DNA達到對基因組DNA進行修飾的目的,。CRISPR/Cas9系統(tǒng)能夠?qū)π∈蠛痛笫蠡蚪M特定基因位點進行編輯,目前已經(jīng)成功應(yīng)用于大小鼠基因的 KO/KI模型制備,,其原理也是對目的片段產(chǎn)生特異的切割后,,修復(fù)過程中產(chǎn)生移碼突變或者是片段缺失,或者是在切開位置產(chǎn)生片段插入等現(xiàn)象,。
4,、 TetraOne基因敲除——成熟,、修飾準確、效果穩(wěn)定,,制作周期只需6個月
TetraOne基因敲除是業(yè)界推出的新技術(shù),,沿用ES細胞同源重組的技術(shù)體系,采用*的建系和基因改造技術(shù)建立了具有遺傳優(yōu)勢的TetraOne ES細胞系,,通過胚胎發(fā)育前期的顯微注射,,使TetraOne ES細胞100% 代替內(nèi)源ES細胞,實現(xiàn)跨越“嵌合體”階段從而快速獲得去Neo雜合子小鼠的基因打靶技術(shù),。
TetraOne技術(shù)是基于ES細胞打靶技術(shù)的金標(biāo)準,,通過同源重組技術(shù)將外源基因定點整合進靶細胞基因組上某一確定的位點,以達到定點修飾改造基因組某一基因的目的,。同時TetraOneTM 技術(shù)還具有核酸酶技術(shù)周期短的優(yōu)勢,,將傳統(tǒng)ES打靶技術(shù)的周期縮短一半,并且不會像核酸酶技術(shù)那樣帶來脫靶效應(yīng)和馬賽克現(xiàn)象,,在核酸酶技術(shù)尚未成熟之前,,TetraOne技術(shù)將是研究者*的選擇。
TetraOne基因敲除技術(shù)的原理
TetraOne基因敲除技術(shù)采用*的建系和基因改造技術(shù)建立了具有遺傳優(yōu)勢的TetraOne ES細胞系,,通過在胚胎發(fā)育前期進行顯微注射,,使TetraOne ES細胞100%代替內(nèi)源ES細胞,實現(xiàn)跨越“嵌合體”階段從而一步直接獲得TetraOne小鼠的基因打靶技術(shù),。實驗結(jié)果顯示,,TetraOne小鼠的特征均與傳統(tǒng)ES打靶技術(shù)產(chǎn)生的F1代小鼠一致。