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DAN數(shù)據(jù)分析

時間:2016/7/27閱讀:2542
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DAN數(shù)據(jù)分析

     數(shù)據(jù)分析是個牽涉面較廣的問題,。不同類型的實驗結(jié)果,,有不同的分析方法;同一類型的實驗,,也有不同的分析方法,。如對DNA直方圖的定量似合分析,上有7大類計算機(jī)似合程序,。在此,,我們不可能對各種分析方法一一介紹,而只是介紹某些典型方法,。

    數(shù)據(jù)分析方法可分成非參數(shù)方法和參數(shù)方法兩大類,。非參數(shù)方法對顯示的圖形不需作任何假定,也不要數(shù)學(xué)模型,。有時,,這個方法很直觀,簡單,;但在需要一道對一道地比較兩個或更多個直方圖時,,它又變得較復(fù)雜。參數(shù)方法是指被測量的生物學(xué)系統(tǒng),、細(xì)胞群體等等,,能為一個數(shù)學(xué)模型所描述并表達(dá)成一個方程或方程組,用方程的變量可由被測的數(shù)據(jù)中提取有用的信息,。例如對小鼠的精子DNA含量進(jìn)行測量,,結(jié)果得一尖銳的峰,如果可用正態(tài)分布描述全部數(shù)據(jù),,則參數(shù)是峰下的面積,,平均值和方差。當(dāng)然,,zui終還要用zui小二乘方的方法來擬合數(shù)據(jù),。

非參數(shù)分析

 非參數(shù)分析常用于單參數(shù)直方圖的定量分析,圖是zui簡單的分析例子,。

 此圖是人白細(xì)胞用吖啶橙染色后的直方圖,,圖上有3個峰,從左到右依次是淋巴細(xì)胞,、單核細(xì)胞和粒細(xì)胞,。如果要計算各部分所占的百分比,只要計算3個峰下的面積即可。實際上,,可在淋巴細(xì)胞的峰與單核細(xì)胞的峰之間的“谷”zui低處,,人為的作一直線,垂直于橫坐標(biāo),;在單核細(xì)胞與粒細(xì)胞間的“谷”的zui低處,,再做一直線,3個峰各由直線為界,,逐道計算峰下的細(xì)胞術(shù)并與總細(xì)胞相比,,則可分別得出淋巴細(xì)胞、單核細(xì)胞,、粒細(xì)胞在整個群體中所占百分?jǐn)?shù),。

 在上述定量分析中,,我們即沒有使用任何數(shù)學(xué)模型,,也沒有引入任何變量,,所以屬于非參數(shù)定量分析方法,也可稱為直觀分析法,。

DNA直方圖的比較分析

 由于流式細(xì)胞術(shù)常測量DNA直方圖,,因此,我們再討論一下另外一種定量分析方法,。我們常會遇到比較兩個直方圖的場合,。例如一個是對照組另一個是實驗組,或者一個是零時刻,,另一個是某實驗時刻等等,。圖所示是這種方法的一個應(yīng)用實例。

   中國藏書卵巢細(xì)胞CHO分別用Hoechst  33258及Propidium  Iodide對DNA染色,,然后經(jīng)流式細(xì)胞計測量,。為使測量結(jié)果更有統(tǒng)計學(xué)意義,對同一樣品應(yīng)進(jìn)行多次,,例如10次的測量,,然后取平均值,于是得到兩個直方圖,。將兩圖歸一化,,即將G1峰的位置調(diào)節(jié)到相同倒數(shù)上,然后將兩個圖畫在一起,,即圖。其中實線是Hoechst  33258染色的,,三角形是PI染色的,。圖中每條曲線的總細(xì)胞也要歸一化到相同數(shù)值。

 從圖上我們不難得出,,在G2M峰有較明顯的差異,。33258染色的細(xì)胞,,其G2M部分所占比例較大。如果將兩條曲線逐道相減,,既得圖,,在這個HO-PI圖中,G1峰對應(yīng)的100道附近為正,,可見33258染色的G1峰較PI染色的G1峰更為尖銳,。S期部分PI略高一些,差異不大,。實際大約相差13%,。上述方法還可進(jìn)一步發(fā)展,采用Kolmogorov-Smirnov檢驗或Gossett-T檢驗,,有人曾用來識別人外周血的兩個淋巴類型,。

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