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Science:助推光學(xué)遺傳學(xué)發(fā)展,!解析出紫紅質(zhì)通道蛋白2的三維結(jié)構(gòu)

閱讀:874      發(fā)布時(shí)間:2017-11-30
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圖片來(lái)自MIPT,。

2017年11月29日//---紫紅質(zhì)通道蛋白2(channelrhodopsin 2, ChR2)是一種廣泛用于光遺傳學(xué)技術(shù)(optogenetics)的膜蛋白。光遺傳學(xué)技術(shù)是一種相對(duì)較新的技術(shù),,涉及利用光來(lái)操縱活的有機(jī)體中的神經(jīng)元和肌肉細(xì)胞,。類似的方法已被用來(lái)部分地逆轉(zhuǎn)聽(tīng)力/視力喪失和控制肌肉收縮。

ChR2是一種主要的光遺傳學(xué)工具,。它是一種光敏蛋白,,2003年它是從一種被稱作萊茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)的綠藻中提取出來(lái)的??茖W(xué)家們能夠?qū)hR2插入到活細(xì)胞的膜中來(lái)控制它,。當(dāng)利用光線照射時(shí),這種蛋白允許帶正電的離子穿過(guò)細(xì)胞膜進(jìn)入細(xì)胞中,。在神經(jīng)元中,,這會(huì)讓它的細(xì)胞膜去極化,從而模擬神經(jīng)沖動(dòng)的影響和導(dǎo)致這種特定的神經(jīng)元放電,。

鑒于ChR2較快地發(fā)揮作用,,對(duì)細(xì)胞相對(duì)無(wú)害,因此它當(dāng)前被用來(lái)激活神經(jīng)元,。一系列人為誘導(dǎo)的突變能夠改變這種蛋白的性質(zhì),。比如,增加它產(chǎn)生的電流或者改變它作出反應(yīng)的光線波長(zhǎng)是可行的,。這些修飾能夠讓實(shí)驗(yàn)者根據(jù)需要量身定制蛋白,。人們甚至能夠?qū)追N對(duì)不同波長(zhǎng)的光線作出反應(yīng)的蛋白變體組合使用。

迄今為止,,用于修飾ChR2性質(zhì)的大多數(shù)突變或多或少是通過(guò)定向進(jìn)化或已知的蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)隨機(jī)引入的,。人們獲得的zui接近于ChR2實(shí)際結(jié)構(gòu)的蛋白是一種奇特的組合物C1C2:它的70%來(lái)自紫紅質(zhì)通道蛋白1(ChR1, 它是一種與ChR2存在親緣關(guān)系的蛋白),剩下的30%來(lái)自ChR2,。這種混合結(jié)構(gòu)不能解釋ChR2蛋白的所有性質(zhì),。結(jié)果就是,基于C1C2預(yù)測(cè)的突變并不是真實(shí)的,,因此并不太適合用于光遺傳學(xué)技術(shù)中,。

為了揭示出ChR2的結(jié)構(gòu),來(lái)自德國(guó),、法國(guó),、俄羅斯和捷克的研究人員使用了一種被稱作X射線衍射的分析技術(shù)。這種技術(shù)僅用于分析以晶體形式存在的蛋白樣品。他們?cè)谝环N所謂的允許蛋白在不離開(kāi)膜的情形下自由地移動(dòng)的立方體脂質(zhì)中間相(cubic lipid mesophase)中培養(yǎng)ChR2蛋白晶體,。他們利用波長(zhǎng)大約為1埃的X射線照射他們培養(yǎng)的ChR2蛋白晶體,,通過(guò)分析X射線在這種蛋白晶體中的衍射情況,成功地解析出ChR2蛋白的結(jié)構(gòu),。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2017年11月24日的Science期刊上,,論文標(biāo)題為“Structural insights into ion conduction by channelrhodopsin 2”。

論文通信作者之一,、德國(guó)馬克斯普朗克生物物理研究所膜蛋白研究實(shí)驗(yàn)室副主任Valentin Borshchevskiy說(shuō),,“自從2003年發(fā)現(xiàn)ChR2以來(lái),人們就試圖解析出它的結(jié)構(gòu),。盡管來(lái)自世界各地的眾多研究小組都想做到這一點(diǎn),,但是這種蛋白在它的自然狀態(tài)下的結(jié)構(gòu)仍是未知的。如今,,鑒于我們解析出它的結(jié)構(gòu),,就能夠?qū)⒂幸饬x的突變引入到這種蛋白中,從而根據(jù)特定實(shí)驗(yàn)的需要調(diào)整它的性質(zhì),。如果不知道它的結(jié)構(gòu),,我們就必須通過(guò)反復(fù)試驗(yàn)或者利用相關(guān)蛋白的數(shù)據(jù)來(lái)找出有用的突變。”(生物谷 Bioon.com)

參考資料:

Oleksandr Volkov, Kirill Kovalev, Vitaly Polovinkin et al. Structural insights into ion conduction by channelrhodopsin 2. Science, 24 Nov 2017, 358(6366):eaan8862, doi:10.1126/science.aan8862

Klaus Gerwert. Channelrhodopsin reveals its dark secrets. Science, 24 Nov 2017, 358(6366):1000-1001, doi:10.1126/science.aar2299

 

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