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Nature:不同細(xì)胞和物種之間的基因表達(dá)差異塑造先天性免疫

閱讀:1697        發(fā)布時(shí)間:2018/10/29
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在一項(xiàng)新的研究中,來(lái)自英國(guó)威康基金會(huì)桑格研究所和歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMBL)歐洲生物信息學(xué)研究所等研究機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)六種哺乳動(dòng)物物種中的25萬(wàn)多個(gè)細(xì)胞的基因進(jìn)行測(cè)序,,證實(shí)了免疫反應(yīng)中的基因如何在不同的細(xì)胞之間和不同的物種之間具有不同的活活性,。相關(guān)研究結(jié)果于2018年10月24日在線發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Gene expression variability across cells and species shapes innate immunity”,。
 

圖片來(lái)自Nature, doi:10.1038/s41586-018-0657-2,。

 

這些研究人員以的細(xì)節(jié)研究了在細(xì)胞對(duì)病原體入侵作出的初始反應(yīng)--先天性免疫反應(yīng)(innate immune response)---中激活的基因。他們利用單細(xì)胞基因組學(xué)技術(shù)測(cè)量了25萬(wàn)多個(gè)細(xì)胞中數(shù)千個(gè)基因的活性來(lái)繪制抗病毒和抗細(xì)菌免疫的進(jìn)化,。

之前的研究已表明,,先天性免疫反應(yīng)中的許多基因在脊椎動(dòng)物中快速地進(jìn)化。這被認(rèn)為是由來(lái)自細(xì)菌和病毒等病原體的無(wú)情攻擊壓力造成的,。這些基因包括產(chǎn)生細(xì)胞因子和趨化因子分子的基因,,它們以多種方式起作用---一些分子是提醒身體危險(xiǎn)存在的炎癥分子;其他的分子限制病原體增殖的能力,;還有一些分子誘導(dǎo)細(xì)胞死亡,。它們代表了一種成功的宿主策略來(lái)抵抗快速進(jìn)化的病原體,。

這些研究人員證實(shí)這些基因在不同的物種之間快速地進(jìn)化,而且在單個(gè)組織內(nèi)的不同細(xì)胞中也具有高度可變的活性,。相比之下,,他們發(fā)現(xiàn)在不同物種之間保守的并調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)的基因在單個(gè)組織的不同細(xì)胞之間中更加一致性地被激活。這些基因可能受到更嚴(yán)格的限制,,這是因?yàn)樗鼈儏⑴c細(xì)胞內(nèi)的許多不同功能,。但是,它們也是病毒的靶標(biāo),。這些受到更嚴(yán)格限制的基因代表著致命弱點(diǎn),,可被病原體用來(lái)破壞免疫系統(tǒng)。

論文作者,、威康基金會(huì)桑格研究所研究員Tzachi Hagai博士說(shuō),“我們認(rèn)為這種激活模式---一些基因受到嚴(yán)格控制,,而另一些基因具有更多的可變活性---已進(jìn)化成了一種對(duì)先天性免疫反應(yīng)加以微調(diào)的方式,。它是的,但又是平衡的,?;蚰軌蚪?jīng)進(jìn)化后協(xié)助細(xì)胞控制入侵者,而且對(duì)這些基因的使用能夠因細(xì)胞而異,,因此周圍組織不會(huì)受到大量攻擊的影響,。”

論文通信作者、威康基金會(huì)桑格研究所細(xì)胞遺傳學(xué)主任Sarah Teichmann博士說(shuō),,“在單細(xì)胞分辨率下DNA測(cè)序的強(qiáng)大功能意味著開(kāi)展這種類型的研究如今是可行的,。據(jù)估計(jì),人體有37萬(wàn)億個(gè)細(xì)胞,,每個(gè)細(xì)胞具有相同的遺傳密碼,。但是不同的細(xì)胞具有不同的表現(xiàn),它們以不同的方式使用遺傳密碼,。通過(guò)研究單個(gè)細(xì)胞,,我們能夠理解生命的這些基礎(chǔ)的構(gòu)成單元(building block,這里指的是細(xì)胞)以及它們?nèi)绾我黄鸷献?,包括它們?nèi)绾蔚挚共≡w,。”(生物谷 )

參考資料:

Tzachi Hagai, Xi Chen, Ricardo J. Miragaia et al. Gene expression variability across cells and species shapes innate immunity. Nature, Published Online: 24 October 2018, doi:10.1038/s41586-018-0657-2.

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