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Nature:一網(wǎng)打盡BRCA1所有核心突變,!乳腺癌研究迎重大進(jìn)展
9月13日,學(xué)術(shù)期刊《自然》上發(fā)表了一篇重磅論文,。一支來自華盛頓大學(xué)的科研團(tuán)隊(duì)利用CRISPR技術(shù),,對(duì)乳腺癌重要風(fēng)險(xiǎn)基因BRCA1進(jìn)行了“飽和式”的基因編輯,詳細(xì)解析了近4000個(gè)不同的單核苷酸變異會(huì)對(duì)這條基因產(chǎn)生怎樣的影響,。研究人員稱,,這個(gè)發(fā)現(xiàn)有望立刻在臨床上得到應(yīng)用。
相信很多學(xué)術(shù)經(jīng)緯的讀者朋友們都知道BRCA1基因的名字,。它編碼的蛋白參與了DNA的修復(fù)過程,,有重要的抑癌功能。如果BRCA1基因出現(xiàn)了突變,,就有可能影響到它的功能,,從而增加癌癥風(fēng)險(xiǎn)。
每年,,美國都有數(shù)百萬女性接受BRCA1基因測序,,了解自己的基因是否發(fā)生了突變。但困擾著許多醫(yī)生的,,正是“有可能”這三個(gè)字,。盡管BRCA1是人類研究為深入的基因之一,但我們對(duì)它的功能,,實(shí)際上還有很多不了解的地方,。我們知道其中的一些突變會(huì)顯著提高癌癥風(fēng)險(xiǎn),另一些突變則無傷大雅,,不會(huì)對(duì)健康造成隱患,。但對(duì)于大多數(shù)BRCA1基因里出現(xiàn)的突變來說,我們卻說不出它究竟會(huì)造成怎樣的影響,。
許多女性是因?yàn)橛腥橄侔┗蚵殉舶┑募易迨?,才決定接受BRCA1基因測序,。“我可能對(duì)一名女性進(jìn)行了測序分析,發(fā)現(xiàn)她的BRCA1基因帶有一個(gè)突變,,但我不知道這個(gè)突變是否會(huì)增加乳腺癌風(fēng)險(xiǎn),,還是*沒有危害。”本研究的通訊作者之一Jay Shendure教授說道,。也就是說,,這些女性朋友辛辛苦苦做了測序,得到的信息卻沒有實(shí)際應(yīng)用價(jià)值,,絲毫不能緩解她們的焦慮,。
這一難題在本研究中得到了很好的解決,??茖W(xué)家們設(shè)計(jì)了一個(gè)巧妙的實(shí)驗(yàn)——他們找到了 一種特殊的細(xì)胞系HAP1。在這種細(xì)胞系里,,一旦BRCA1蛋白失去其應(yīng)有的功能,,細(xì)胞就會(huì)死亡。然后,,他們應(yīng)用了先進(jìn)的基因編輯工具CRISPR-Cas9,,對(duì)BRCA1基因的13個(gè)關(guān)鍵外顯子區(qū)域,進(jìn)行了逐個(gè)核苷酸的突變工作,??梢韵胂螅@是一個(gè)工作量巨大的項(xiàng)目,。
為了加速研究的流程,,研究人員們設(shè)計(jì)了一套新穎的系統(tǒng)。他們每次在2000萬個(gè)細(xì)胞內(nèi),,對(duì)一整段外顯子進(jìn)行基因編輯,。隨后,研究人員們先讓這些細(xì)胞生長11天,,再做后續(xù)的分析,。如果由于某個(gè)特定突變導(dǎo)致BRCA1失去其功能,相應(yīng)的細(xì)胞就會(huì)死亡,,后續(xù)分析中也就更難找到這種特定突變的存在,。
利用這個(gè)方法,研究人員們在半年里篩選了將近4000個(gè)位點(diǎn),,發(fā)現(xiàn)了400多種會(huì)讓BRCA1失去功能的突變,,以及300多種會(huì)影響B(tài)RCA1表達(dá)的突變。這涵蓋了BRCA1基因的主要功能區(qū)域,。目前,,研究人員們已共享了這些信息,。未來的數(shù)年里,他們還計(jì)劃將這項(xiàng)工作拓展到整條BRCA1基因上,。
“我們希望這些數(shù)據(jù)能不斷增長,。當(dāng)在女性中觀察到這些突變時(shí),我們的數(shù)據(jù)能指導(dǎo)人們對(duì)測序結(jié)果的解讀,。”本研究的另一名通訊作者Lea Starita教授說道,。
過去,我們也能對(duì)特定基因進(jìn)行多個(gè)位點(diǎn)的篩選,。但能在短期內(nèi)對(duì)如此多的位點(diǎn)進(jìn)行“飽和式”的篩選,,挨個(gè)評(píng)估單個(gè)堿基對(duì)基因功能的影響,尚屬罕見,。這正是CRISPR-Cas9基因編輯工具與相應(yīng)的分析技術(shù)結(jié)合之后,,所迸發(fā)出的巨大潛力。
我們期待這項(xiàng)研究能盡快推廣到其他與疾病有關(guān)的基因上,。在這個(gè)醫(yī)學(xué)的時(shí)代,,來自基因組的信息,能讓我們更好地理解疾病,,并更快找到潛在的診斷與治療方案,。也許有朝一日,我們在癌癥發(fā)病前數(shù)年,,就能知道自己的命運(yùn),。這對(duì)于預(yù)防和治療而言,有著極大的應(yīng)用價(jià)值,。(生物谷)