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載體構(gòu)建|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)

時(shí)間:2015-5-21閱讀:250

關(guān)鍵詞:載體構(gòu)建|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)
簡介:世界*品牌載體構(gòu)建|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)原裝,,質(zhì)量保證,*,。
載體構(gòu)建|實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達(dá)體系,。
我們具備豐富的蛋白表達(dá)設(shè)計(jì)經(jīng)驗(yàn)及實(shí)驗(yàn)操作技巧,,承諾客戶不成功不收費(fèi),。我們所有的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)真實(shí)可信,,我們提供原始的表達(dá)菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實(shí)驗(yàn)報(bào)告重復(fù)我們的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,。
產(chǎn)品品牌:   http://www.,。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html    
測序?qū)嶒?yàn)流程:
設(shè)計(jì)siRNA靶序列
在制備siRNA 前都需要單獨(dú)設(shè)計(jì)siRNA序列.研究發(fā)現(xiàn)對哺乳動(dòng)物細(xì)胞,zui有效的siRNAs是21-23個(gè)堿基大小,、3’端有兩個(gè)突出堿基的雙鏈RNA,;而對非哺乳動(dòng)物,比較有效的是長片段dsRNA,。siRNA的序列專一性要求非常嚴(yán)謹(jǐn),,與靶mRNA之間一個(gè)堿基錯(cuò)配都會(huì)顯著削弱基因沉默的效果。
1.  選擇siRNA靶位點(diǎn)
從轉(zhuǎn)錄AUG起始密碼子開始,,搜尋下游AA序列,,記錄跟每個(gè)AA 3’端相鄰的19個(gè)核苷酸作為候選的siRNA靶位點(diǎn)。有研究結(jié)果顯示GC含量在30%-50%左右的siRNA要比那些GC含量偏高的更為有效,。Tuschl等建議在設(shè)計(jì)siRNA時(shí)不要針對5'和3'端的非編碼區(qū)(untranslated regions,UTRs),,原因是這些地方有豐富的調(diào)控蛋白結(jié)合區(qū)域,而這些UTR結(jié)合蛋白或者翻譯起始復(fù)合物可能會(huì)影響siRNP核酸內(nèi)切酶復(fù)合物結(jié)合mRNA從而影響siRNA的效果 
2.  序列同源性分析
將潛在的序列和相應(yīng)的基因組數(shù)據(jù)庫(人或者小鼠,、大鼠等等)進(jìn)行比較,排除那些和其他編碼序列/EST同源的序列,。例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)選出合適的目標(biāo)序列進(jìn)行合成.并非所有符合條件的siRNA都一樣有效,其原因還不清楚,可能是位置效應(yīng)的結(jié)果,因此對于一個(gè)目的基因,,一般要選擇3-5個(gè)靶位點(diǎn)來設(shè)計(jì)siRNA,。
3.  設(shè)計(jì)陰性對照
一個(gè)完整的siRNA實(shí)驗(yàn)應(yīng)該有陰性對照,作為陰性對照的siRNA應(yīng)該和選中的siRNA序列有相同的組成,,但是和mRNA沒有明顯的同源性,。通常的做法是將選中的siRNA中的堿基序列打亂。當(dāng)然,,同樣要保證它和其他基因沒有同源性,。
合成模板
1.  合成編碼 shRNA的DNA 模板的兩條單鏈,模板鏈后面接有RNA PolyIII聚合酶轉(zhuǎn)錄中止位點(diǎn),,同時(shí)兩端分別設(shè)計(jì) BamH I 和 Hind III 酶切位點(diǎn),,可以克隆到 siRNA 載體多克隆位點(diǎn)的 BamH I 和 Hind III 酶切位點(diǎn)之間。
2.  95℃,5 min,,緩慢退火,, DNA 單鏈得到 shRNA 的 DNA 雙鏈模板。

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