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更新時(shí)間:2024-08-20 07:04:59瀏覽次數(shù):6284評(píng)價(jià)
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Omega-質(zhì)粒提取試劑盒
操作步驟:
使用前請(qǐng)先在漂洗液中加入無水乙醇,,加入體積請(qǐng)參照瓶上的標(biāo)簽,。溶液YP1在使用前先加入RNaseA(將試劑盒中提供的 RNaseA全部加入),混勻,,置于 2-8℃保存,。如非指明,所有離心步驟均為使用臺(tái)式
離心機(jī)在室溫下離心,。
1,、取1-5ml酵母培養(yǎng)物(不超過 5×107cells),12000rpm離心 1min,,盡量吸除上清(菌液較多時(shí)可以通過多次離心將菌體沉淀收集到一個(gè)離心管中),。
2、酵母細(xì)胞壁的破除:
A,、酶法:向酵母菌體中加入 470ul 山梨醇 Buffer,,充分懸浮菌體,,加入 25ul 酵母破壁酶和 5ul β-巰基乙醇,充分混勻,,30℃處理 1-2h,,期間可顛倒離心管混勻數(shù)次。12000rpm 離心 1min,,棄上清,,收集沉淀。向沉淀中加入 250ul 溶液 YP1(請(qǐng)先檢查是否已加入 RNaseA) ,,充分懸浮沉淀,。注意:如果菌塊未*混勻,會(huì)影響裂解導(dǎo)致質(zhì)粒提取量和純度偏低,。
B,、玻璃珠法:向酵母菌體中加入 250ul 溶液 YP1(請(qǐng)先檢查是否已加入 RNaseA) ,充分懸浮沉淀,。加入 150-200ul酸洗玻璃珠(自備),,漩渦振蕩 10min。簡(jiǎn)短離心使玻璃珠沉降到離心管底,,吸取上清(如上清有所損失,,請(qǐng)用溶液 YP1 補(bǔ)足 250ul)于另一干凈離心管中,。
3,、向離心管中加入 250ul溶液 YP2,溫和地上下翻轉(zhuǎn) 6-8 次使菌體充分裂解,。注意:混勻一定要溫和,,以
免污染細(xì)菌基因組 DNA,此時(shí)菌液應(yīng)變得清亮粘稠,,作用時(shí)間不要超過 5 min,,以免質(zhì)粒受到破壞。
4,、向離心管中加入 350ul溶液 YP3,,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn) 6-8次,充分混勻,,此時(shí)會(huì)出現(xiàn)白色絮狀沉淀,。12000rpm離心 10 min,用移液器小心地將上清轉(zhuǎn)移到另一個(gè)干凈的離心管中,,盡量不要吸出沉淀,。注意:溶液 YP3 加入后應(yīng)立即混合,避免產(chǎn)生局部沉淀,。如果上清中還有微小白色沉淀,,可再次離心后取上清。
5、將上一步所得上清液加入吸附柱中,,室溫放置 2min,,12000rpm 離心 1min,倒掉收集管中的廢液,,吸附柱重新放回收集管中,。
6、向吸附柱中加入 700ul 漂洗液(使用前請(qǐng)先檢查是否已加入無水乙醇),,12000rpm 離心 1min,,棄廢液,將吸附柱放入收集管中,。
7,、向吸附柱中加入 500ul漂洗液,12000rpm離心 1min,,棄廢液,,將吸附柱放入收集管中。
8,、12000rpm 離心 2min,,將吸附柱敞口置于室溫或 50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,,否則漂洗液中的乙醇會(huì)影響后續(xù)的實(shí)驗(yàn)如酶切,、PCR 等。
9,、將吸附柱放入一個(gè)干凈的離心管中,,向吸附膜中央懸空滴加 50-200ul 經(jīng) 65℃水浴預(yù)熱的洗脫液,室溫放置 2min,,12000rpm離心 1min,。
10、為了增加質(zhì)粒的回收效率,,可將得到的洗脫液重新加入吸附柱中,,室溫放置 2min, 12000rpm離心 1min,。
注意事項(xiàng):
1,、使用前請(qǐng)先檢查溶液 YP2 和溶液 YP3 是否出現(xiàn)混濁,如有混濁現(xiàn)象,,可在 37℃水浴中加熱幾分鐘,,待溶液恢復(fù)澄清后再使用。
2,、洗脫緩沖液體積不應(yīng)少于 50ul,,體積過小影響回收效率,;洗脫液的 pH值對(duì)洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應(yīng)保證其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 將水的 pH 值調(diào)此范圍),,pH 值低于 7.0 會(huì)降低,。洗脫效率;DNA產(chǎn)物應(yīng)保存在-20℃,,以防 DNA降解,。
3、質(zhì)粒得率與酵母菌株,、質(zhì)??截悢?shù)、培養(yǎng)條件等因素有關(guān),。通常酵母質(zhì)??截悢?shù)都很低,一般通過電泳或分光光度計(jì)法都很難檢測(cè)到,,可通過 PCR或轉(zhuǎn)化大腸桿菌來檢測(cè),。
4、DNA濃度及純度檢測(cè):得到的基因組DN**段的大小與樣品保存時(shí)間,、操作過程中的剪切力等因素有關(guān),。回收得到的DN**段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度,。DNA應(yīng)在OD260處有顯著吸收峰,, OD260值為 1 相當(dāng)于大約 50 μg/ml雙鏈DNA、40 μg/ml單鏈DNA,。OD260/OD280比值應(yīng)為1.7-1.9,,如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液,,而使用去離子水,,比值會(huì)偏低,因?yàn)閜H值和離子存在會(huì)影響光吸收值,,但并不表示純度低,。
Omega-質(zhì)粒提取試劑盒
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