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Omega-質(zhì)粒提取試劑盒
操作步驟:
使用前請先在漂洗液中加入無水乙醇,,加入體積請參照瓶上的標簽。溶液YP1在使用前先加入RNaseA(將試劑盒中提供的 RNaseA全部加入),,混勻,,置于 2-8℃保存。如非指明,,所有離心步驟均為使用臺式
離心機在室溫下離心,。
1、取1-5ml酵母培養(yǎng)物(不超過 5×107cells),,12000rpm離心 1min,,盡量吸除上清(菌液較多時可以通過多次離心將菌體沉淀收集到一個離心管中)。
2,、酵母細胞壁的破除:
A,、酶法:向酵母菌體中加入 470ul 山梨醇 Buffer,,充分懸浮菌體,,加入 25ul 酵母破壁酶和 5ul β-巰基乙醇,充分混勻,,30℃處理 1-2h,,期間可顛倒離心管混勻數(shù)次。12000rpm 離心 1min,,棄上清,,收集沉淀。向沉淀中加入 250ul 溶液 YP1(請先檢查是否已加入 RNaseA) ,,充分懸浮沉淀,。注意:如果菌塊未*混勻,會影響裂解導致質(zhì)粒提取量和純度偏低,。
B,、玻璃珠法:向酵母菌體中加入 250ul 溶液 YP1(請先檢查是否已加入 RNaseA) ,充分懸浮沉淀,。加入 150-200ul酸洗玻璃珠(自備),,漩渦振蕩 10min。簡短離心使玻璃珠沉降到離心管底,,吸取上清(如上清有所損失,,請用溶液 YP1 補足 250ul)于另一干凈離心管中。
3、向離心管中加入 250ul溶液 YP2,,溫和地上下翻轉(zhuǎn) 6-8 次使菌體充分裂解,。注意:混勻一定要溫和,以
免污染細菌基因組 DNA,,此時菌液應變得清亮粘稠,,作用時間不要超過 5 min,以免質(zhì)粒受到破壞,。
4,、向離心管中加入 350ul溶液 YP3,立即溫和地上下翻轉(zhuǎn) 6-8次,,充分混勻,,此時會出現(xiàn)白色絮狀沉淀。12000rpm離心 10 min,,用移液器小心地將上清轉(zhuǎn)移到另一個干凈的離心管中,,盡量不要吸出沉淀。注意:溶液 YP3 加入后應立即混合,,避免產(chǎn)生局部沉淀,。如果上清中還有微小白色沉淀,可再次離心后取上清,。
5,、將上一步所得上清液加入吸附柱中,室溫放置 2min,,12000rpm 離心 1min,,倒掉收集管中的廢液,吸附柱重新放回收集管中,。
6,、向吸附柱中加入 700ul 漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm 離心 1min,,棄廢液,,將吸附柱放入收集管中。
7,、向吸附柱中加入 500ul漂洗液,,12000rpm離心 1min,棄廢液,,將吸附柱放入收集管中,。
8、12000rpm 離心 2min,,將吸附柱敞口置于室溫或 50℃溫箱放置數(shù)分鐘,,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,,否則漂洗液中的乙醇會影響后續(xù)的實驗如酶切、PCR 等,。
9,、將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加 50-200ul 經(jīng) 65℃水浴預熱的洗脫液,,室溫放置 2min,,12000rpm離心 1min。
10,、為了增加質(zhì)粒的回收效率,,可將得到的洗脫液重新加入吸附柱中,室溫放置 2min,, 12000rpm離心 1min,。
注意事項:
1、使用前請先檢查溶液 YP2 和溶液 YP3 是否出現(xiàn)混濁,,如有混濁現(xiàn)象,,可在 37℃水浴中加熱幾分鐘,待溶液恢復澄清后再使用,。
2,、洗脫緩沖液體積不應少于 50ul,體積過小影響回收效率,;洗脫液的 pH值對洗脫效率也有影響,,若需要用水做洗脫液應保證其 pH 值在 8.0 左右(可用 NaOH 將水的 pH 值調(diào)此范圍),pH 值低于 7.0 會降低,。洗脫效率,;DNA產(chǎn)物應保存在-20℃,,以防 DNA降解,。
3、質(zhì)粒得率與酵母菌株,、質(zhì)??截悢?shù)、培養(yǎng)條件等因素有關,。通常酵母質(zhì)??截悢?shù)都很低,一般通過電泳或分光光度計法都很難檢測到,,可通過 PCR或轉(zhuǎn)化大腸桿菌來檢測,。
4、DNA濃度及純度檢測:得到的基因組DN**段的大小與樣品保存時間,、操作過程中的剪切力等因素有關,?;厥盏玫降腄N**段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計檢測濃度與純度。DNA應在OD260處有顯著吸收峰,, OD260值為 1 相當于大約 50 μg/ml雙鏈DNA,、40 μg/ml單鏈DNA。OD260/OD280比值應為1.7-1.9,,如果洗脫時不使用洗脫緩沖液,,而使用去離子水,比值會偏低,,因為pH值和離子存在會影響光吸收值,,但并不表示純度低。
Omega-質(zhì)粒提取試劑盒