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2024-12-16 閱讀(443)
專家共識
多重病原菌檢測是一種先進的診斷技術(shù),,它能夠同時檢測和識別多種病原體,,包括細菌、病毒,、真菌和寄生蟲等,。這種檢測方法在感染性疾病的診斷中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,特別是在病原體多樣且復(fù)雜的情況下,,能夠快速準確地確定病原體,,從而制定有效的治療方案。
病原宏基因組高通量測序技術(shù)(mNGS)作為一種新型的基因水平檢測技術(shù),,無需預(yù)設(shè),、無需培養(yǎng)、無偏好性,能夠全面檢測標本中的所原體遺傳物質(zhì)(包括DNA和RNA),,并進行高通量測序,。基于生物信息學(xué)算法,,該技術(shù)可以與病原數(shù)據(jù)庫進行比對分析,,鑒定樣本中病原微生物的種類及功能信息,為臨床抗感染提供精準的病原學(xué)證據(jù),。
為了規(guī)范病原宏基因組高通量測序技術(shù)在臨床本地化檢測中的應(yīng)用,,中國藥師協(xié)會、中華醫(yī)學(xué)會細菌感染與耐藥防治分會,、國家衛(wèi)生健康委臨床抗微生物藥物敏感性折點研究和標準制定專家委員會等機構(gòu),,于2024年1月在《中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志》聯(lián)合發(fā)表了《病原宏基因組高通量測序臨床本地化檢測規(guī)范專家共識》。該共識在實驗室符合國家相關(guān)政策法規(guī)以及保證檢測方法性能可靠的前提下,,對如何在本地開展mNGS檢測提出了具體指導(dǎo)意見,。
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產(chǎn)品數(shù)據(jù)
科佰生物新推出了多重病原菌質(zhì)控品,選擇具有代表性的病原組成見下表,。以上病原均可溯源,,各病原基因組數(shù)據(jù)科佰可提供。
內(nèi)含4個革蘭氏陽性菌和4個革蘭氏陰性菌,,2個真菌,。
鑒于細菌破壁提取難易程度對檢測結(jié)果的影響,我們分別使用了市面上不同廠家的試劑盒對如上質(zhì)控品做了提取,,并使用相應(yīng)數(shù)字PCR探針檢測對應(yīng)的拷貝數(shù),,如圖所示,不同的提取試劑檢測得到的結(jié)果會有較大的差異,,與該試劑盒提取的偏好性相關(guān),。
同時,我們也對此產(chǎn)品進行了mNGS的檢測,,在無差別檢測比對得到的數(shù)據(jù)中,,10個菌都可以檢出,但是比例與數(shù)字PCR也有同樣的差異,。
然而作為一款質(zhì)控品,,無論是數(shù)字PCR還是mNGS的方法,不同提取方法,,均可以做到陽性的檢出,。