重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 |
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Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建
參考價(jià) | 面議 |
- 型號(hào)
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- 所在地 重慶市
更新時(shí)間:2019-04-22 11:57:30瀏覽次數(shù):1935
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產(chǎn)地類(lèi)別 | 進(jìn)口 |
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適用于以下細(xì)胞類(lèi)型的文庫(kù)制備:
癌癥研究:循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC),激光捕獲顯微切割(LCM)細(xì)胞或DNA,,
以及細(xì)針抽吸(FNA)細(xì)胞,;
生殖健康研究:胚胎細(xì)胞和循環(huán)胎兒細(xì)胞,;
發(fā)育生物學(xué):胚胎細(xì)胞,,干細(xì)胞和稀有細(xì)胞,;
宏基因組學(xué)和微生物學(xué):微生物細(xì)胞,,微生物組和環(huán)境樣品。
歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229
華雅干細(xì)胞-客服中心:023-630105781
Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建
品牌:Rubicon Genomics
貨號(hào):R300669
規(guī)格:24Rxns
Rubicon R300669 DNA-Seq DNA測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建
單細(xì)胞起始的DNA測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建
SMARTer® PicoPLEX® Gold Single Cell DNA-Seq Kit
· 高重現(xiàn)性和準(zhǔn)確性:可用于CNV,、SNV和非整倍體檢測(cè)
· 在SNV和CNV檢測(cè)方面優(yōu)于MDA技術(shù)
· 三小時(shí)的工作流程,,手動(dòng)操作時(shí)間不到30分鐘
· 均勻的高覆蓋率,低的等位基因插入率和脫扣率
應(yīng)用:
適用于以下細(xì)胞類(lèi)型的文庫(kù)制備:
· 癌癥研究:循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC),激光捕獲顯微切割(LCM)細(xì)胞或DNA,,
以及細(xì)針抽吸(FNA)細(xì)胞,;
· 生殖健康研究:胚胎細(xì)胞和循環(huán)胎兒細(xì)胞;
· 發(fā)育生物學(xué):胚胎細(xì)胞,,干細(xì)胞和稀有細(xì)胞,;
· 宏基因組學(xué)和微生物學(xué):微生物細(xì)胞,微生物組和環(huán)境樣品,。
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產(chǎn)品說(shuō)明: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit (PicoPLEX Gold) 是一種旨在從單細(xì)胞中生成高質(zhì)量的DNA文庫(kù),,以便在Illumina平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序的試劑盒。該試劑盒基于PicoPLEX技術(shù),,優(yōu)化用于檢測(cè)拷貝數(shù)變異 (CNVs),、單核苷酸變異 (SNVs)、插入缺失 (indels) 和結(jié)構(gòu)變異 (SV),。PicoPLEX Gold kit在SNV檢測(cè)中表現(xiàn)出比MDA技術(shù)更好的性能,。 SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit不包含index。兼容的SMARTer Index如下所述,,需要單獨(dú)購(gòu)買(mǎi),。 PicoPLEX WGA是一種在被廣泛用于檢測(cè)單細(xì)胞中CNV的全基因組擴(kuò)增(WGA)技術(shù)。初,,PicoPLEX技術(shù)主要用于高再現(xiàn)性的檢測(cè)非整倍體異倍性和CNV,。為了滿(mǎn)足準(zhǔn)確檢測(cè)SNV的需求,對(duì)PicoPLEX WGA技術(shù)中的酶,、引物和protocols進(jìn)行了進(jìn)一步優(yōu)化,,不僅提升了擴(kuò)增的覆蓋度、*性,、準(zhǔn)確性,,同時(shí)提高了CNV、SNV,、Indel和其他SV的分辨率,,并且保持了高重現(xiàn)性。 SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit可以固定細(xì)胞或非固定細(xì)胞起始,,只需簡(jiǎn)單的4步操作流程,,即可在3小時(shí)內(nèi)完成Illumina NGS文庫(kù)的構(gòu)建,且手動(dòng)操作時(shí)間非常短,。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA HT dual index kits | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA HT dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用,,用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒,。這些試劑盒包含Illumina Nextera® XT v2 index序列對(duì)應(yīng)的index引物,多可提供384種不同的雙端index,,用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分,。其中index引物預(yù)先分裝在4個(gè)的不同條形碼標(biāo)記的index微孔板中,每個(gè)微孔板可提供不同的96種index組合 (Code No.R400660-R400663),,index微孔板(96N Sets A-D)的每個(gè)孔提供的量足夠進(jìn)行一次測(cè)序反應(yīng),;另一種是一套中有24個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)管,每個(gè)反應(yīng)管中包含不同的雙端index組合(Code No.R400664),,且每個(gè)反應(yīng)管(24N)提供的量足夠進(jìn)行兩次測(cè)序反應(yīng),。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA unique dual index kits | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA unique dual index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用,用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒,。這些試劑盒包含“IDT for Illumina UD”對(duì)應(yīng)的index引物,,多可提供96種不同雙端index,用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分,。index引物預(yù)先分裝在不同的4組各24個(gè)單獨(dú)的管中,,其中每組可提供24種不同index引物組合(Code No.R400665-R400668)。每個(gè)index引物管(24U Sets A-D)提供的量足夠進(jìn)行兩次測(cè)序反應(yīng),。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA single index kits | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SMARTer DNA single index kits是與SMARTer ThruPLEX或SMARTer PicoPLEX文庫(kù)制備試劑盒搭配使用,,用以構(gòu)建Illumina測(cè)序文庫(kù)的index引物試劑盒。這些試劑盒包含與“TruSeq LT set A”序列對(duì)應(yīng)的index引物,,可提供24種單端index,,用于樣本混合測(cè)序時(shí)的區(qū)分。index引物預(yù)先分裝在不同的2組各12個(gè)單獨(dú)的管中,,其中每組可提供12種不同index引物組合(Code No.R400695和R400697),。每個(gè)index引物管(12U Sets A-B)提供的量足夠進(jìn)行8次測(cè)序反應(yīng)。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229 華雅干細(xì)胞-客服中心:023-630105781 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
圖1. SMARTer PicoPLEX Gold Single Cell DNA-Seq Kit技術(shù),。 PicoPLEX Gold的技術(shù)概要,。通過(guò)step1裂解細(xì)胞獲得gDNA,通過(guò)隨機(jī)引物進(jìn)行預(yù)擴(kuò)增 (step 2),,然后進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增得到測(cè)序文庫(kù)(step 4)。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
圖2. PicoPLEX Gold的主要特點(diǎn):高覆蓋度,,高均勻性,,和高重現(xiàn)性 (與A產(chǎn)品技術(shù)相比)。 Panel A. 圖中顯示在不同深度的測(cè)序中覆蓋的堿基數(shù) (~35M read pairs,,PE 2 × 150 bp) ,。PicoPLEX Gold在較低深度的覆蓋度與A產(chǎn)品 (MDA) 相似,在較高深度的覆蓋度高于A產(chǎn)品(MDA),。 Panel B. 以gDNA樣本 (NA12878) 和單細(xì)胞樣本 (GM12878) 起始,,使用PicoPLEX Gold和A產(chǎn)品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增,。相比較于MDA,PicoPLEX Gold顯示出更均勻的覆蓋度,。 Panel C. 評(píng)估覆蓋度的重現(xiàn)性,。與A產(chǎn)品 (右) 相比,PicoPLEX Gold (左) 的在兩個(gè)單細(xì)胞群之間的*性明顯更好,。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
圖3. 使用PicoPLEX Gold進(jìn)行高質(zhì)量單核苷酸變異(SNV)檢測(cè),。
歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229 華雅干細(xì)胞-客服中心:023-630105781 Rubicon擁有ThruPLEX®和PicoPLEX®技術(shù),。特殊的引物或接頭設(shè)計(jì),能以微量DNA樣本起始構(gòu)建下一代測(cè)序文庫(kù),。 ThruPLEX DNA-seq Kit 更高的通量, 更好的性能, 用于所有 Illumina® 的 NGS 平臺(tái) 更高的通量–多達(dá) 96 個(gè) index 微量起始樣品(50 pg – 50 ng),,更高性能 快速簡(jiǎn)單的實(shí)驗(yàn)方法:一根管或孔中,僅三步反應(yīng),,約 2 小時(shí)時(shí)間,,無(wú)需轉(zhuǎn)移 適用于所有主要的靶向富集平臺(tái)–安捷倫 SureSelect® Enrichment,羅氏 NimbleGen® SeqCap EZ®,,IDT xGEN® LockDown® probes ThruPLEX Plasma-seq Kit 專(zhuān)為血漿游離DNA設(shè)計(jì) 專(zhuān)為cfDNA設(shè)計(jì):修復(fù)及連接試劑配方更新,,方法優(yōu)化 高品質(zhì)NGS文庫(kù):在寬廣的GC含量范圍內(nèi),可以達(dá)到高檢測(cè)再現(xiàn)性 起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量 快速簡(jiǎn)便:?jiǎn)喂堋?/span>2小時(shí),、3步操作步驟,,無(wú)需純化或樣品轉(zhuǎn)移步驟 應(yīng)用領(lǐng)域:液體活檢,、ctDNA、靶向測(cè)序等領(lǐng)域文庫(kù)構(gòu)建 兼容自動(dòng)化平臺(tái):Beckman® FXP Workstation Takara&Clontech NGS系列產(chǎn)品
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歡迎您致電 重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司 189 9633 2596 Q 3148795229 華雅干細(xì)胞-客服中心:023-630105781 |
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