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超微量分光光度計的常見用途
閱讀:2402 發(fā)布時間:2019-12-23
常見的用途
光光度計是一類很重要的分析儀器,無論在物理學(xué)、化學(xué),、生物學(xué),、醫(yī)學(xué)、材料學(xué),、環(huán)境科學(xué)等科學(xué)研究領(lǐng)域,還是在化工,、醫(yī)藥、環(huán)境檢測,、冶金等現(xiàn)代生產(chǎn)與管理部門,紫外可見分光光度計督有廣泛而重要的應(yīng)用。分光光度計就是利用分光光度法對物質(zhì)進行定量定性分析的儀器,,常用于核酸,,蛋白定量以及細菌生長濃度的定量。
超微量分光光度計已成為現(xiàn)代分子生物實驗室常規(guī)儀器,。常用于核酸,,蛋白定量以及細菌生長濃度的定量。
核酸的定量
核酸的定量是超微量分光光度計使用頻率高的功能??梢远咳苡诰彌_液的寡核苷酸,,單鏈、雙鏈DNA,,以及RNA,。核酸的高吸收峰的吸收波長260nm。每種核酸的分子構(gòu)成不一,,因此其換算系數(shù)不同,。定量不同類型的核酸,事先要選擇對應(yīng)的系數(shù),。如:1OD的吸光值分別相當于50μg/ml的dsDNA,,37μg/ml的ssDNA,40μg/ml的RNA,,30μg/ml的Olig,。測試后的吸光值經(jīng)過上述系數(shù)的換算,從而得出相應(yīng)的樣品濃度,。測試前,,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,,爾后測試空白液和樣品液,。然而,實驗并非一帆風順,。讀數(shù)不穩(wěn)定可能是實驗者頭痛的問題,。靈敏度越高的儀器,表現(xiàn)出的吸光值漂移越大,。
事實上,,分光光度計的設(shè)計原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內(nèi)變化,,即儀器有一定的準確度和精確度,。如德國伯赫Colibri超微量分光光度計的準確度≤1.0%(1A)。這樣多次測試的結(jié)果在均值1.0%左右之間變動,,都是正常的,。另外,還需考慮核酸本身物化性質(zhì)和溶解核酸的緩沖液的pH值,,離子濃度等:在測試時,,離子濃度太高,也會導(dǎo)致讀數(shù)漂移,,因此建議使用pH值一定,、離子濃度較低的緩沖液,如TE,可大大穩(wěn)定讀數(shù),。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由于樣品中不可避免存在一些細小的顆粒,,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測試效果,。為了大程度減少顆粒對測試結(jié)果的影響,,要求核酸吸光值至少大于0.1A,吸光值好在0.1-1.5A,。在此范圍內(nèi),,顆粒的干擾相對較小,結(jié)果穩(wěn)定,。從而意味著樣品的濃度不能過低,,或者過高(超過光度計的測試范圍)。操作因素,,如混合要充分,,否則吸光值太低,甚至出現(xiàn)負值,;混合液不能存在氣泡,,空白液無懸浮物,否則讀數(shù)漂移劇烈,;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,,否則濃度差異太大;換算系數(shù)和樣品濃度單位選擇一致,;不能采用窗口磨損的比色杯,;樣品的體積必須達到比色杯要求的小體積等多個操作事項。
除了核酸濃度,,分光光度計同時顯示幾個非常重要的比值表示樣品的純度,,如A260/A280的比值,用于評估樣品的純度,,因為蛋白的吸收峰是280nm,。純凈的樣品,比值大于1.8(DNA)或者2.0(RNA),。如果比值低于1.8或者2.0,,表示存在蛋白質(zhì)或者酚類物質(zhì)的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,,如碳水化合物,,多肽,苯酚等,,較純凈的核酸A260/A230的比值大于2.0。A320檢測溶液的混濁度和其他干擾因子。純樣品,,A320一般是0,。
蛋白質(zhì)直接定量
這種方法是在280nm波長,直接測試蛋白,。選擇Warburg公式,,光度計可以直接顯示出樣品的濃度,或者是選擇相應(yīng)的換算方法,,將吸光值轉(zhuǎn)換為樣品濃度,。蛋白質(zhì)測定過程非常簡單,先測試空白液,,然后直接測試蛋白質(zhì),。由于緩沖液中存在一些雜質(zhì),一般要消除320nm的“背景”信息,,設(shè)定此功能“開”,。與測試核酸類似,要求A280的吸光值至少大于0.1A,,線性范圍在1.0-1.5之間,。實驗中選擇Warburg公式顯示樣品濃度時,發(fā)現(xiàn)讀數(shù)“漂移”,。這是一個正常的現(xiàn)象,。事實上,只要觀察A280的吸光值的變化范圍不超過1%,,表明結(jié)果非常穩(wěn)定,。漂移的原因是因為Warburg公式吸光值換算成濃度,乘以一定的系數(shù),,只要吸光值有少許改變,,濃度就會被放大,從而顯得結(jié)果很不穩(wěn)定,。蛋白質(zhì)直接定量方法,,適合測試較純凈、成分相對單一的蛋白質(zhì),。紫外直接定量法相對于比色法來說,,速度快,操作簡單,;但是容易受到平行物質(zhì)的干擾,,如DNA的干擾;另外敏感度低,,要求蛋白的濃度較高,。
比色法蛋白質(zhì)定量
蛋白質(zhì)通常是多種蛋白質(zhì)的化合物,,比色法測定的基礎(chǔ)是蛋白質(zhì)構(gòu)成成分:氨基酸(如酪氨酸,絲氨酸)與外加的顯色基團或者染料反應(yīng),,產(chǎn)生有色物質(zhì),。有色物質(zhì)的濃度與蛋白質(zhì)反應(yīng)的氨基酸數(shù)目直接相關(guān),從而反應(yīng)蛋白質(zhì)濃度,。
比色方法一般有BCA,,Bradford,Lowry等幾種方法,。
Lowry法:以早期的Biuret反應(yīng)為基礎(chǔ),,并有所改進。蛋白質(zhì)與Cu2反應(yīng),,產(chǎn)生藍色的反應(yīng)物,。但是與Biuret相比,Lowry法敏感性更高,。缺點是需要順序加入幾種不同的反應(yīng)試劑,;反應(yīng)需要的時間較長;容易受到非蛋白物質(zhì)的影響,;含EDTA,,Tritonx-100,ammoniasulfate等物質(zhì)的蛋白不適合此種方法,。
BCA(Bicinchoninineacidassay)法:這是一種較新的,、更敏感的蛋白測試法。要分析的蛋白在堿性溶液里與Cu2反應(yīng)產(chǎn)生Cu,,后者與BCA形成螯合物,,形成紫色化合物,吸收峰在562nm波長,。此化合物與蛋白濃度的線性關(guān)系*,,反應(yīng)后形成的化合物非常穩(wěn)定。相對于Lowry法,,操作簡單,,敏感度高。但是與Lowry法相似的是容易受到蛋白質(zhì)之間以及去污劑的干擾,。
Bradford法:這種方法的原理是蛋白質(zhì)與考馬斯亮蘭結(jié)合反應(yīng),,產(chǎn)生的有色化合物吸收峰595nm。特點是,,敏感度好,,是Lowry和BCA兩種測試方法的2倍;操作更簡單,,速度更快,;只需要一種反應(yīng)試劑,;化合物可以穩(wěn)定1小時,方便結(jié)果,;而且與一系列干擾Lowry,,BCA反應(yīng)的還原劑(如DTT,巰基乙醇)相容,。但是對于去污劑依然是敏感的。主要的缺點是不同的標準品會導(dǎo)致同一樣品的結(jié)果差異較大,,無可比性,。
某些初次接觸比色法測定的研究者可能為各種比色法測出的結(jié)果并不一致,感到迷惑,,究竟該相信哪種方法,?由于各種方法反應(yīng)的基團以及顯色基團不一,所以同時使用幾種方法對同一樣品得出的樣品濃度無可比性,。例如:Keller等測試人奶中的蛋白,,結(jié)果Lowry,BCA測出的濃度明顯高于Bradford,,差異顯著,。即使是測定同一樣品,同一種比色法選擇的標準樣品不一致,,測試后的濃度也不一致,。如用Lowry測試細胞勻漿中的蛋白質(zhì),以BSA作標準品,,濃度1.34mg/ml,,以a球蛋白作標準品,濃度2.64mg/ml,。因此,,在選擇比色法之前,參照要測試的樣本的化學(xué)構(gòu)成,,尋找化學(xué)構(gòu)成類似的標準蛋白作標準品,。另外,比色法定量蛋白質(zhì),,經(jīng)常出現(xiàn)的問題是樣品的吸光值太低,,導(dǎo)致測出的樣品濃度與實際的濃度差距較大。關(guān)鍵問題是,,反應(yīng)后1011分光光度計的重要配件——比色杯的顏色是有一定的半衰期,,所以每種比色法都列出了反應(yīng)測試時間,所有的樣品(包括標準樣品),,都必須在此時間內(nèi)測試,。時間過長,,得到的吸光值變小,換算的濃度值降低,。除此,,反應(yīng)溫度、溶液PH值等都是影響實驗的重要原因,。此外,,非常重要的是,是用塑料的比色法,。避免使用石英或者玻璃材質(zhì)的比色杯,,因為反應(yīng)后的顏色會讓石英或者玻璃著色,導(dǎo)致樣品吸光值不準確,。
OD600
實驗室確定細菌生長密度和生長期,,多根據(jù)經(jīng)驗和目測推斷細菌的生長密度。在遇到要求較高的實驗,,需要采用分光光度計準確測定細菌細胞密度,。OD600是追蹤液體培養(yǎng)物中微生物生長的標準方法。以未加菌液的培養(yǎng)液作為空白液,,之后定量培養(yǎng)后的含菌培養(yǎng)液,。為了保證正確操作,必須針對每種微生物和每臺儀器用顯微鏡進行細胞計數(shù),,做出校正曲線,。實驗中偶爾會出現(xiàn)菌液的OD值出現(xiàn)負值,原因是采用了顯色的培養(yǎng)基,,即細菌培養(yǎng)一段時間后,,與培養(yǎng)基反應(yīng),發(fā)生變色反應(yīng),。另外,,需注意的是,測試的樣品不能離心,,保持細菌懸浮狀態(tài),。